LYN

LYN
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1W1F, 1WA7, 3A4O
Ідентифікатори
Символи	LYN, LYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase, JTK8, p53Lyn, p56Lyn
Зовнішні ІД	OMIM: 165120 MGI: 96892 HomoloGene: 55649 GeneCards: LYN
Реагує на сполуку
	bafetinib, Бозутиніб, SU6656[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transmembrane transporter binding; • SH3 domain binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • kinase activity; • gamma-tubulin binding; • signaling receptor binding; • ATP binding; • protein kinase activity; • non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity; • enzyme binding; • transferase activity; • platelet-derived growth factor receptor binding; • integrin binding; • GO:0001948 protein binding; • glycosphingolipid binding; • protein tyrosine kinase activity; • nucleotide binding; • phosphoprotein binding; • ubiquitin protein ligase binding; • ephrin receptor binding; • phosphorylation-dependent protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • мембрана; • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane; • мітохондріальний міжмембранний простір; • perinuclear region of cytoplasm; • клітинне ядро; • мітохондріальна мембрана; • membrane raft; • Екзосома; • комплекс Ґольджі; • клітинна мембрана; • GO:0097483, GO:0097481 Постсинаптичне ущільнення; • mast cell granule; • integrin alpha2-beta1 complex; • Криста; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • glutamatergic synapse; • postsynaptic specialization, intracellular component;
Біологічний процес	• regulation of protein phosphorylation; • cellular response to extracellular stimulus; • cellular response to retinoic acid; • positive regulation of B cell receptor signaling pathway; • tolerance induction to self antigen; • regulation of mast cell activation; • regulation of cell adhesion mediated by integrin; • cellular response to heat; • response to amino acid; • кровотворення; • adaptive immune response; • regulation of erythrocyte differentiation; • cellular response to DNA damage stimulus; • positive regulation of Fc receptor mediated stimulatory signaling pathway; • platelet activation; • Fc-epsilon receptor signaling pathway; • protein phosphorylation; • regulation of B cell apoptotic process; • positive regulation of dendritic cell apoptotic process; • positive regulation of glial cell proliferation; • response to carbohydrate; • regulation of platelet aggregation; • negative regulation of cell population proliferation; • B cell receptor signaling pathway; • negative regulation of myeloid leukocyte differentiation; • dendritic cell differentiation; • Fc receptor mediated inhibitory signaling pathway; • Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • regulation of B cell receptor signaling pathway; • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; • response to sterol depletion; • positive regulation of stress-activated protein kinase signaling cascade; • regulation of cytokine production; • response to insulin; • positive regulation of mast cell proliferation; • negative regulation of MAP kinase activity; • regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; • erythrocyte differentiation; • protein autophosphorylation; • oligodendrocyte development; • regulation of mast cell degranulation; • positive regulation of phosphorylation; • GO:0022415 viral process; • response to toxic substance; • negative regulation of protein phosphorylation; • Fc receptor mediated stimulatory signaling pathway; • growth hormone receptor signaling pathway via JAK-STAT; • фосфорилювання; • immune system process; • regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol; • positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein; • B cell homeostasis; • immune response-regulating cell surface receptor signaling pathway; • response to axon injury; • negative regulation of mast cell proliferation; • regulation of inflammatory response; • peptidyl-tyrosine autophosphorylation; • response to hormone; • positive regulation of cellular component movement; • regulation of monocyte chemotaxis; • leukocyte migration; • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway; • histamine secretion by mast cell; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • response to organic cyclic compound; • negative regulation of intracellular signal transduction; • positive regulation of cell migration; • ephrin receptor signaling pathway; • negative regulation of toll-like receptor 2 signaling pathway; • T cell costimulation; • response to peptide hormone; • platelet degranulation; • зсідання крові; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity; • positive regulation of oligodendrocyte progenitor proliferation; • negative regulation of immune response; • positive regulation of cell population proliferation; • positive regulation of neuron projection development; • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • negative regulation of B cell proliferation; • negative regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway; • Сигнальна трансдукція; • Вроджений імунітет; • neuron projection development; • central nervous system development; • inflammatory response; • positive regulation of protein phosphorylation; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling; • Диференціація клітин; • positive regulation of Ras protein signal transduction; • positive regulation of aspartic-type endopeptidase activity involved in amyloid precursor protein catabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	4067
	17096
	ENSG00000254087
	ENSMUSG00000042228
	P07948
	P25911
	NM_001111097; NM_002350
	NM_001111096; NM_010747
	NP_001104567; NP_002341
	NP_001104566; NP_034877
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LYN (англ. LYN proto-oncogene, Src family tyrosine kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 512 амінокислот, а молекулярна маса — 58 574[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGCIKSKGKD	SLSDDGVDLK	TQPVRNTERT	IYVRDPTSNK	QQRPVPESQL
LPGQRFQTKD	PEEQGDIVVA	LYPYDGIHPD	DLSFKKGEKM	KVLEEHGEWW
KAKSLLTKKE	GFIPSNYVAK	LNTLETEEWF	FKDITRKDAE	RQLLAPGNSA
GAFLIRESET	LKGSFSLSVR	DFDPVHGDVI	KHYKIRSLDN	GGYYISPRIT
FPCISDMIKH	YQKQADGLCR	RLEKACISPK	PQKPWDKDAW	EIPRESIKLV
KRLGAGQFGE	VWMGYYNNST	KVAVKTLKPG	TMSVQAFLEE	ANLMKTLQHD
KLVRLYAVVT	REEPIYIITE	YMAKGSLLDF	LKSDEGGKVL	LPKLIDFSAQ
IAEGMAYIER	KNYIHRDLRA	ANVLVSESLM	CKIADFGLAR	VIEDNEYTAR
EGAKFPIKWT	APEAINFGCF	TIKSDVWSFG	ILLYEIVTYG	KIPYPGRTNA
DVMTALSQGY	RMPRVENCPD	ELYDIMKMCW	KEKAEERPTF	DYLQSVLDDF
YTATEGQYQQ	QP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до тирозинових протеїнкіназ родини Src-протеїнкіназ. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, запальна відповідь. Білок має сайт для зв'язування з АТФ. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, апараті гольджі.

Література

Rider L.G., Raben N., Miller L., Jelsema C. (1994). The cDNAs encoding two forms of the LYN protein tyrosine kinase are expressed in rat mast cells and human myeloid cells.. Gene 138: 219 — 222. PubMed DOI:10.1016/0378-1119(94)90811-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Partanen J., Maekelae T.P., Alitalo R., Lehvaeslaiho H., Alitalo K. (1990). Putative tyrosine kinases expressed in K-562 human leukemia cells.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 8913 — 8917. PubMed DOI:10.1073/pnas.87.22.8913
Bielke W., Ziemiecki A., Kappos L., Miescher G.C. (1992). Expression of the B cell-associated tyrosine kinase gene Lyn in primary neuroblastoma tumours and its modulation during the differentiation of neuroblastoma cell lines.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 186: 1403 — 1409. PubMed DOI:10.1016/S0006-291X(05)81562-1
Roifman C.M., Ke S. (1993). CD19 is a substrate of the antigen receptor-associated protein tyrosine kinase in human B cells.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 194: 222 — 225. PubMed DOI:10.1006/bbrc.1993.1807
Wang A.V., Scholl P.R., Geha R.S. (1994). Physical and functional association of the high affinity immunoglobulin G receptor (Fc gamma RI) with the kinases Hck and Lyn.. J. Exp. Med. 180: 1165 — 1170. PubMed DOI:10.1084/jem.180.3.1165

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з LYN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6735 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
UniProt, P07948 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з LYN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6735 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P07948 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.