MDM2

MDM2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1RV1, 1T4E, 1T4F, 1YCR, 1Z1M, 2AXI, 2C6A, 2C6B, 2FOP, 2GV2, 2HDP, 2LZG, 2M86, 2MPS, 2RUH, 2VJE, 2VJF, 3EQS, 3G03, 3IUX, 3IWY, 3JZK, 3JZR, 3JZS, 3LBK, 3LBL, 3LNJ, 3LNZ, 3MQS, 3TJ2, 3TPX, 3TU1, 3V3B, 3VBG, 3VZV, 3W69, 4DIJ, 4ERE, 4ERF, 4HBM, 4HFZ, 4HG7, 4JV7, 4JV9, 4JVE, 4JVR, 4JWR, 4MDN, 4MDQ, 4OAS, 4OBA, 4OCC, 4ODE, 4ODF, 4OGN, 4OGT, 4OGV, 4OQ3, 4QO4, 4QOC, 4UMN, 4WT2, 4XXB, 4ZYC, 4ZYF, 4ZYI, 4UE1, 4UD7, 5AFG, 5HMI, 5HMK, 5HMH, 5C5A
Ідентифікатори
Символи	MDM2, ACTFS, HDMX, hdm2, MDM2 proto-oncogene, LSKB
Зовнішні ІД	OMIM: 164785 MGI: 96952 HomoloGene: 1793 GeneCards: MDM2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• scaffold protein binding; • GO:0001948 protein binding; • enzyme binding; • зв'язування з іоном металу; • identical protein binding; • ubiquitin protein ligase binding; • p53 binding; • SUMO transferase activity; • ubiquitin-protein transferase activity; • transferase activity; • ligase activity; • 5S rRNA binding; • zinc ion binding; • ribonucleoprotein complex binding; • protein N-terminus binding; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • NEDD8 ligase activity; • disordered domain specific binding; • protein domain specific binding; • receptor serine/threonine kinase binding; • peroxisome proliferator activated receptor binding; • ubiquitin binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • endocytic vesicle membrane; • клітинна мембрана; • Синапс; • Ядерні тільця; • цитоплазма; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • Ядерце; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• negative regulation of signal transduction by p53 class mediator; • endocardial cushion morphogenesis; • cellular response to UV-C; • atrial septum development; • regulation of heart rate; • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest; • positive regulation of gene expression; • blood vessel development; • positive regulation of cell population proliferation; • negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; • response to ether; • blood vessel remodeling; • cellular response to hypoxia; • heart valve development; • cellular response to estrogen stimulus; • negative regulation of apoptotic process; • cellular response to organic substance; • cellular response to hydrogen peroxide; • response to cocaine; • cardiac septum morphogenesis; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • peptidyl-lysine modification; • positive regulation of cell cycle; • ventricular septum development; • positive regulation of protein export from nucleus; • response to steroid hormone; • cellular response to growth factor stimulus; • regulation of protein catabolic process; • cellular response to antibiotic; • negative regulation of gene expression; • positive regulation of mitotic cell cycle; • heart development; • cellular response to alkaloid; • cellular response to vitamin B1; • response to magnesium ion; • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • cellular response to peptide hormone stimulus; • cellular response to organic cyclic compound; • GO:0022415 viral process; • response to iron ion; • Регуляція експресії генів; • response to antibiotic; • traversing start control point of mitotic cell cycle; • Убіквітин-залежний протеоліз; • negative regulation of protein processing; • establishment of protein localization; • response to toxic substance; • response to morphine; • atrioventricular valve morphogenesis; • protein localization to nucleus; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation; • response to water-immersion restraint stress; • negative regulation of neuron projection development; • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell migration; • protein deubiquitination; • protein sumoylation; • transcription factor catabolic process; • protein autoubiquitination; • response to formaldehyde; • protein destabilization; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • proteolysis involved in cellular protein catabolic process; • cellular response to gamma radiation; • cellular response to actinomycin D; • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator; • amyloid fibril formation; • protein-containing complex assembly; • ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	4193
	17246
	ENSG00000135679
	ENSMUSG00000020184
	Q00987
	P23804
NM_001145336; NM_001145337; NM_001145339; NM_001145340; NM_001278462;
	NM_002392; NM_006878; NM_006879; NM_006880; NM_006881; NM_006882; NM_032739; NM_001367990
	NM_001288586; NM_010786
NP_001138809; NP_001138811; NP_001138812; NP_001265391; NP_002383;
	NP_001354919
	NP_001275515; NP_034916
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MDM2 (англ. MDM2 proto-oncogene) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 491 амінокислот, а молекулярна маса — 55 233[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MCNTNMSVPT	DGAVTTSQIP	ASEQETLVRP	KPLLLKLLKS	VGAQKDTYTM
KEVLFYLGQY	IMTKRLYDEK	QQHIVYCSND	LLGDLFGVPS	FSVKEHRKIY
TMIYRNLVVV	NQQESSDSGT	SVSENRCHLE	GGSDQKDLVQ	ELQEEKPSSS
HLVSRPSTSS	RRRAISETEE	NSDELSGERQ	RKRHKSDSIS	LSFDESLALC
VIREICCERS	SSSESTGTPS	NPDLDAGVSE	HSGDWLDQDS	VSDQFSVEFE
VESLDSEDYS	LSEEGQELSD	EDDEVYQVTV	YQAGESDTDS	FEEDPEISLA
DYWKCTSCNE	MNPPLPSHCN	RCWALRENWL	PEDKGKDKGE	ISEKAKLENS
TQAEEGFDVP	DCKKTIVNDS	RESCVEENDD	KITQASQSQE	SEDYSQPSTS
SSIIYSSQED	VKEFEREETQ	DKEESVESSL	PLNAIEPCVI	CQGRPKNGCI
VHGKTGHLMA	CFTCAKKLKK	RNKPCPVCRQ	PIQMIVLTYF	P

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Oliner J.D., Kinzler K.W., Meltzer P.S., George D.L., Vogelstein B. (1992). Amplification of a gene encoding a p53-associated protein in human sarcomas.. Nature 358: 80 — 83. PubMed DOI:10.1038/358080a0
Sigalas I., Calvert A.H., Anderson J.J., Neal D.E., Lunec J. (1996). Alternatively spliced mdm2 transcripts with loss of p53 binding domain sequences: transforming ability and frequent detection in human cancer.. Nat. Med. 2: 912 — 917. PubMed DOI:10.1038/nm0896-912
Veldhoen N., Metcalfe S., Milner J. (1999). A novel exon within the mdm2 gene modulates translation initiation in vitro and disrupts the p53-binding domain of mdm2 protein.. Oncogene 18: 7026 — 7033. PubMed DOI:10.1038/sj.onc.1203182
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Zauberman A., Flusberg D., Haupt Y., Barak Y., Oren M. (1995). A functional p53-responsive intronic promoter is contained within the human mdm2 gene.. Nucleic Acids Res. 23: 2584 — 2592. PubMed DOI:10.1093/nar/23.14.2584
Liang H., Atkins H., Abdel-Fattah R., Jones S.N., Lunec J. (2004). Genomic organisation of the human MDM2 oncogene and relationship to its alternatively spliced mRNAs.. Gene 338: 217 — 223. PubMed DOI:10.1016/j.gene.2004.05.015

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6973 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q00987 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6973 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q00987 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.