MMP2

MMP2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1CK7, 1CXW, 1EAK, 1GEN, 1GXD, 1HOV, 1J7M, 1KS0, 1QIB, 1RTG, 3AYU
Ідентифікатори
Символи	MMP2, CLG4, CLG4A, MMP-2, MMP-II, MONA, TBE-1, matrix metallopeptidase 2
Зовнішні ІД	OMIM: 120360 MGI: 97009 HomoloGene: 3329 GeneCards: MMP2
Реагує на сполуку
	tiludronic acid[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • peptidase activity; • GO:0001948 protein binding; • metalloendopeptidase activity; • hydrolase activity; • metallopeptidase activity; • serine-type endopeptidase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мембрана; • клітинна мембрана; • Саркомера; • extracellular region; • мітохондрія; • клітинне ядро; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • extracellular space; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• intramembranous ossification; • cellular protein metabolic process; • response to hypoxia; • endodermal cell differentiation; • ephrin receptor signaling pathway; • skeletal system morphogenesis; • extracellular matrix disassembly; • bone trabecula formation; • Протеоліз; • Ангіогенез; • positive regulation of innate immune response; • collagen catabolic process; • cellular response to amino acid stimulus; • face morphogenesis; • embryo implantation; • blood vessel maturation; • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation; • cytokine-mediated signaling pathway; • extracellular matrix organization; • cellular response to reactive oxygen species; • positive regulation of smooth muscle cell proliferation; • tissue remodeling; • response to amyloid-beta;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4313
	17390
	ENSG00000087245
	ENSMUSG00000031740
	P08253
	P33434
	NM_004530; NM_001127891; NM_001302508; NM_001302509; NM_001302510
	NM_008610
	NP_001121363; NP_001289437; NP_001289438; NP_001289439; NP_004521
	NP_032636
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MMP2 (англ. Matrix metallopeptidase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 660 амінокислот, а молекулярна маса — 73 882[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEALMARGAL	TGPLRALCLL	GCLLSHAAAA	PSPIIKFPGD	VAPKTDKELA
VQYLNTFYGC	PKESCNLFVL	KDTLKKMQKF	FGLPQTGDLD	QNTIETMRKP
RCGNPDVANY	NFFPRKPKWD	KNQITYRIIG	YTPDLDPETV	DDAFARAFQV
WSDVTPLRFS	RIHDGEADIM	INFGRWEHGD	GYPFDGKDGL	LAHAFAPGTG
VGGDSHFDDD	ELWTLGEGQV	VRVKYGNADG	EYCKFPFLFN	GKEYNSCTDT
GRSDGFLWCS	TTYNFEKDGK	YGFCPHEALF	TMGGNAEGQP	CKFPFRFQGT
SYDSCTTEGR	TDGYRWCGTT	EDYDRDKKYG	FCPETAMSTV	GGNSEGAPCV
FPFTFLGNKY	ESCTSAGRSD	GKMWCATTAN	YDDDRKWGFC	PDQGYSLFLV
AAHEFGHAMG	LEHSQDPGAL	MAPIYTYTKN	FRLSQDDIKG	IQELYGASPD
IDLGTGPTPT	LGPVTPEICK	QDIVFDGIAQ	IRGEIFFFKD	RFIWRTVTPR
DKPMGPLLVA	TFWPELPEKI	DAVYEAPQEE	KAVFFAGNEY	WIYSASTLER
GYPKPLTSLG	LPPDVQRVDA	AFNWSKNKKT	YIFAGDKFWR	YNEVKKKMDP
GFPKLIADAW	NAIPDNLDAV	VDLQGGGHSY	FFKGAYYLKL	ENQSLKSVKF
GSIKSDWLGC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ангіогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, мітохондрії, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Collier I.E., Bruns G.A.P., Goldberg G.I., Gerhard D.S. (1991). On the structure and chromosome location of the 72- and 92-kDa human type IV collagenase genes.. Genomics 9: 429 — 434. PubMed DOI:10.1016/0888-7543(91)90408-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Butler G.S., Will H., Atkinson S.J., Murphy G. (1997). Membrane-type-2 matrix metalloproteinase can initiate the processing of progelatinase A and is regulated by the tissue inhibitors of metalloproteinases.. Eur. J. Biochem. 244: 653 — 657. PubMed DOI:10.1111/j.1432-1033.1997.t01-1-00653.x
Brooks P.C., Silletti S., von Schalscha T.L., Friedlander M., Cheresh D.A. (1998). Disruption of angiogenesis by PEX, a noncatalytic metalloproteinase fragment with integrin binding activity.. Cell 92: 391 — 400. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(00)80931-9
Fernandez-Patron C., Radomski M.W., Davidge S.T. (1999). Vascular matrix metalloproteinase-2 cleaves big endothelin-1 yielding a novel vasoconstrictor.. Circ. Res. 85: 906 — 911. PubMed DOI:10.1161/01.RES.85.10.906
Chattopadhyay N., Mitra A., Frei E., Chatterjee A. (2001). Human cervical tumor cell (SiHa) surface alphavbeta3 integrin receptor has associated matrix metalloproteinase (MMP-2) activity.. J. Cancer Res. Clin. Oncol. 127: 653 — 658. PubMed DOI:10.1007/s004320100271

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з Matrix metallopeptidase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7166 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P08253 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Matrix metallopeptidase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7166 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P08253 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.