NCAPD2

NCAPD2
Ідентифікатори
Символи	NCAPD2, CAP-D2, CNAP1, hCAP-D2, non-SMC condensin I complex subunit D2, MCPH21
Зовнішні ІД	OMIM: 615638 MGI: 1915548 HomoloGene: 6497 GeneCards: NCAPD2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• histone binding; • chromatin binding; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мембрана; • хромосома; • Нуклеоплазма; • Конденсин; • nuclear chromosome; • condensed chromosome; • клітинне ядро; • condensed chromosome, centromeric region; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• mitotic chromosome condensation; • meiotic chromosome condensation; • поділ клітини; • chromosome separation; • chromosome condensation; • клітинний цикл; • GO:0007067 мітоз;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9918
	68298
	ENSG00000010292
	ENSMUSG00000038252
	Q15021
	Q8K2Z4
	NM_014865
	NM_146171
	NP_055680
	NP_666283
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NCAPD2 (англ. Non-SMC condensin I complex subunit D2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 401 амінокислот, а молекулярна маса — 157 182[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPQMYEFHL	PLSPEELLKS	GGVNQYVVQE	VLSIKHLPPQ	LRAFQAAFRA
QGPLAMLQHF	DTIYSILHHF	RSIDPGLKED	TLQFLIKVVS	RHSQELPAIL
DDTTLSGSDR	NAHLNALKMN	CYALIRLLES	FETMASQTNL	VDLDLGGKGK
KARTKAAHGF	DWEEERQPIL	QLLTQLLQLD	IRHLWNHSII	EEEFVSLVTG
CCYRLLENPT	INHQKNRPTR	EAITHLLGVA	LTRYNHMLSA	TVKIIQMLQH
FEHLAPVLVA	AVSLWATDYG	MKSIVGEIVR	EIGQKCPQEL	SRDPSGTKGF
AAFLTELAER	VPAILMSSMC	ILLDHLDGEN	YMMRNAVLAA	MAEMVLQVLS
GDQLEAAARD	TRDQFLDTLQ	AHGHDVNSFV	RSRVLQLFTR	IVQQKALPLT
RFQAVVALAV	GRLADKSVLV	CKNAIQLLAS	FLANNPFSCK	LSDADLAGPL
QKETQKLQEM	RAQRRTAAAS	AVLDPEEEWE	AMLPELKSTL	QQLLQLPQGE
EEIPEQIANT	ETTEDVKGRI	YQLLAKASYK	KAIILTREAT	GHFQESEPFS
HIDPEESEET	RLLNILGLIF	KGPAASTQEK	NPRESTGNMV	TGQTVCKNKP
NMSDPEESRG	NDELVKQEML	VQYLQDAYSF	SRKITEAIGI	ISKMMYENTT
TVVQEVIEFF	VMVFQFGVPQ	ALFGVRRMLP	LIWSKEPGVR	EAVLNAYRQL
YLNPKGDSAR	AKAQALIQNL	SLLLVDASVG	TIQCLEEILC	EFVQKDELKP
AVTQLLWERA	TEKVACCPLE	RCSSVMLLGM	MARGKPEIVG	SNLDTLVSIG
LDEKFPQDYR	LAQQVCHAIA	NISDRRKPSL	GKRHPPFRLP	QEHRLFERLR
ETVTKGFVHP	DPLWIPFKEV	AVTLIYQLAE	GPEVICAQIL	QGCAKQALEK
LEEKRTSQED	PKESPAMLPT	FLLMNLLSLA	GDVALQQLVH	LEQAVSGELC
RRRVLREEQE	HKTKDPKEKN	TSSETTMEEE	LGLVGATADD	TEAELIRGIC
EMELLDGKQT	LAAFVPLLLK	VCNNPGLYSN	PDLSAAASLA	LGKFCMISAT
FCDSQLRLLF	TMLEKSPLPI	VRSNLMVATG	DLAIRFPNLV	DPWTPHLYAR
LRDPAQQVRK	TAGLVMTHLI	LKDMVKVKGQ	VSEMAVLLID	PEPQIAALAK
NFFNELSHKG	NAIYNLLPDI	ISRLSDPELG	VEEEPFHTIM	KQLLSYITKD
KQTESLVEKL	CQRFRTSRTE	RQQRDLAYCV	SQLPLTERGL	RKMLDNFDCF
GDKLSDESIF	SAFLSVVGKL	RRGAKPEGKA	IIDEFEQKLR	ACHTRGLDGI
KELEIGQAGS	QRAPSAKKPS	TGSRYQPLAS	TASDNDFVTP	EPRRTTRRHP
NTQQRASKKK	PKVVFSSDES	SEEDLSAEMT	EDETPKKTTP	ILRASARRHR
S

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, конденсація ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1.. DNA Res. 2: 167 — 174. PubMed DOI:10.1093/dnares/2.4.167
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Schmiesing J.A., Gregson H.C., Zhou S., Yokomori K. (2000). A human condensin complex containing hCAP-C-hCAP-E and CNAP1, a homolog of Xenopus XCAP-D2, colocalizes with phosphorylated histone H3 during the early stage of mitotic chromosome condensation.. Mol. Cell. Biol. 20: 6996 — 7006. PubMed DOI:10.1128/MCB.20.18.6996-7006.2000
Kimura K., Cuvier O., Hirano T. (2001). Chromosome condensation by a human condensin complex in Xenopus egg extracts.. J. Biol. Chem. 276: 5417 — 5420. PubMed DOI:10.1074/jbc.C000873200
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization.. Nat. Biotechnol. 24: 1285 — 1292. PubMed DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24305 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q15021 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24305 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q15021 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.