NCOR1

NCOR1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2EQR, 3H52, 3KMZ, 3N00, 4MDD, 4WVD
Ідентифікатори
Символи	NCOR1, N-CoR, N-CoR1, PPP1R109, TRAC1, hN-CoR, nuclear receptor corepressor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600849 MGI: 1349717 HomoloGene: 38166 GeneCards: NCOR1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • histone deacetylase binding; • thyroid hormone receptor binding; • GO:0001948 protein binding; • nuclear receptor binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • chromatin binding; • sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• histone deacetylase complex; • мембрана; • transcription repressor complex; • Sin3 complex; • spindle microtubule; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • гіалоплазма; • mitotic spindle;
Біологічний процес	• regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA; • spindle assembly; • negative regulation of JNK cascade; • regulation of fatty acid transport; • Циркадний ритм; • transcription, DNA-templated; • regulation of lipid metabolic process; • chromatin organization; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of androgen receptor signaling pathway; • locomotor rhythm; • ритмічний процес;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	9611
	20185
	ENSG00000141027
	ENSMUSG00000018501
	O75376
	Q60974
	NM_001190438; NM_001190440; NM_006311
	NM_001252313; NM_011308; NM_177229
	NP_001177367; NP_001177369; NP_006302
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NCOR1 (англ. Nuclear receptor corepressor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 440 амінокислот, а молекулярна маса — 270 210[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSSGYPPNQ	GAFSTEQSRY	PPHSVQYTFP	NTRHQQEFAV	PDYRSSHLEV
SQASQLLQQQ	QQQQLRRRPS	LLSEFHPGSD	RPQERRTSYE	PFHPGPSPVD
HDSLESKRPR	LEQVSDSHFQ	RVSAAVLPLV	HPLPEGLRAS	ADAKKDPAFG
GKHEAPSSPI	SGQPCGDDQN	ASPSKLSKEE	LIQSMDRVDR	EIAKVEQQIL
KLKKKQQQLE	EEAAKPPEPE	KPVSPPPVEQ	KHRSIVQIIY	DENRKKAEEA
HKIFEGLGPK	VELPLYNQPS	DTKVYHENIK	TNQVMRKKLI	LFFKRRNHAR
KQREQKICQR	YDQLMEAWEK	KVDRIENNPR	RKAKESKTRE	YYEKQFPEIR
KQREQQERFQ	RVGQRGAGLS	ATIARSEHEI	SEIIDGLSEQ	ENNEKQMRQL
SVIPPMMFDA	EQRRVKFINM	NGLMEDPMKV	YKDRQFMNVW	TDHEKEIFKD
KFIQHPKNFG	LIASYLERKS	VPDCVLYYYL	TKKNENYKAL	VRRNYGKRRG
RNQQIARPSQ	EEKVEEKEED	KAEKTEKKEE	EKKDEEEKDE	KEDSKENTKE
KDKIDGTAEE	TEEREQATPR	GRKTANSQGR	RKGRITRSMT	NEAAAASAAA
AAATEEPPPP	LPPPPEPIST	EPVETSRWTE	EEMEVAKKGL	VEHGRNWAAI
AKMVGTKSEA	QCKNFYFNYK	RRHNLDNLLQ	QHKQKTSRKP	REERDVSQCE
SVASTVSAQE	DEDIEASNEE	ENPEDSEVEA	VKPSEDSPEN	ATSRGNTEPA
VELEPTTETA	PSTSPSLAVP	STKPAEDESV	ETQVNDSISA	ETAEQMDVDQ
QEHSAEEGSV	CDPPPATKAD	SVDVEVRVPE	NHASKVEGDN	TKERDLDRAS
EKVEPRDEDL	VVAQQINAQR	PEPQSDNDSS	ATCSADEDVD	GEPERQRMFP
MDSKPSLLNP	TGSILVSSPL	KPNPLDLPQL	QHRAAVIPPM	VSCTPCNIPI
GTPVSGYALY	QRHIKAMHES	ALLEEQRQRQ	EQIDLECRSS	TSPCGTSKSP
NREWEVLQPA	PHQVITNLPE	GVRLPTTRPT	RPPPPLIPSS	KTTVASEKPS
FIMGGSISQG	TPGTYLTSHN	QASYTQETPK	PSVGSISLGL	PRQQESAKSA
TLPYIKQEEF	SPRSQNSQPE	GLLVRAQHEG	VVRGTAGAIQ	EGSITRGTPT
SKISVESIPS	LRGSITQGTP	ALPQTGIPTE	ALVKGSISRM	PIEDSSPEKG
REEAASKGHV	IYEGKSGHIL	SYDNIKNARE	GTRSPRTAHE	ISLKRSYESV
EGNIKQGMSM	RESPVSAPLE	GLICRALPRG	SPHSDLKERT	VLSGSIMQGT
PRATTESFED	GLKYPKQIKR	ESPPIRAFEG	AITKGKPYDG	ITTIKEMGRS
IHEIPRQDIL	TQESRKTPEV	VQSTRPIIEG	SISQGTPIKF	DNNSGQSAIK
HNVKSLITGP	SKLSRGMPPL	EIVPENIKVV	ERGKYEDVKA	GETVRSRHTS
VVSSGPSVLR	STLHEAPKAQ	LSPGIYDDTS	ARRTPVSYQN	TMSRGSPMMN
RTSDVTISSN	KSTNHERKST	LTPTQRESIP	AKSPVPGVDP	VVSHSPFDPH
HRGSTAGEVY	RSHLPTHLDP	AMPFHRALDP	AAAAYLFQRQ	LSPTPGYPSQ
YQLYAMENTR	QTILNDYITS	QQMQVNLRPD	VARGLSPREQ	PLGLPYPATR
GIIDLTNMPP	TILVPHPGGT	STPPMDRITY	IPGTQITFPP	RPYNSASMSP
GHPTHLAAAA	SAERERERER	EKERERERIA	AASSDLYLRP	GSEQPGRPGS
HGYVRSPSPS	VRTQETMLQQ	RPSVFQGTNG	TSVITPLDPT	AQLRIMPLPA
GGPSISQGLP	ASRYNTAADA	LAALVDAAAS	APQMDVSKTK	ESKHEAARLE
ENLRSRSAAV	SEQQQLEQKT	LEVEKRSVQC	LYTSSAFPSG	KPQPHSSVVY
SEAGKDKGPP	PKSRYEEELR	TRGKTTITAA	NFIDVIITRQ	IASDKDARER
GSQSSDSSSS	LSSHRYETPS	DAIEVISPAS	SPAPPQEKLQ	TYQPEVVKAN
QAENDPTRQY	EGPLHHYRPQ	QESPSPQQQL	PPSSQAEGMG	QVPRTHRLIT
LADHICQIIT	QDFARNQVSS	QTPQQPPTST	FQNSPSALVS	TPVRTKTSNR
YSPESQAQSV	HHQRPGSRVS	PENLVDKSRG	SRPGKSPERS	HVSSEPYEPI
SPPQVPVVHE	KQDSLLLLSQ	RGAEPAEQRN	DARSPGSISY	LPSFFTKLEN
TSPMVKSKKQ	EIFRKLNSSG	GGDSDMAAAQ	PGTEIFNLPA	VTTSGSVSSR
GHSFADPASN	LGLEDIIRKA	LMGSFDDKVE	DHGVVMSQPM	GVVPGTANTS
VVTSGETRRE	EGDPSPHSGG	VCKPKLISKS	NSRKSKSPIP	GQGYLGTERP
SSVSSVHSEG	DYHRQTPGWA	WEDRPSSTGS	TQFPYNPLTM	RMLSSTPPTP
IACAPSAVNQ	AAPHQQNRIW	EREPAPLLSA	QYETLSDSDD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Wang J., Hoshino T., Redner R.L., Kajigaya S., Liu J.M. (1998). ETO, fusion partner in t(8;21) acute myeloid leukemia, represses transcription by interaction with the human N-CoR/mSin3/HDAC1 complex.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 10860 — 10865. PubMed DOI:10.1073/pnas.95.18.10860
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Harding H.P., Atkins G.B., Jaffe A.B., Seo W.J., Lazar M.A. (1997). Transcriptional activation and repression by RORalpha, an orphan nuclear receptor required for cerebellar development.. Mol. Endocrinol. 11: 1737 — 1746. PubMed DOI:10.1210/mend.11.11.0002
Underhill C., Qutob M.S., Yee S.P., Torchia J. (2000). A novel nuclear receptor corepressor complex, N-CoR, contains components of the mammalian SWI/SNF complex and the corepressor KAP-1.. J. Biol. Chem. 275: 40463 — 40470. PubMed DOI:10.1074/jbc.M007864200
Zhang J., Kalkum M., Chait B.T., Roeder R.G. (2002). The N-CoR-HDAC3 nuclear receptor corepressor complex inhibits the JNK pathway through the integral subunit GPS2.. Mol. Cell 9: 611 — 623. PubMed DOI:10.1016/S1097-2765(02)00468-9
Yoon H.-G., Chan D.W., Reynolds A.B., Qin J., Wong J. (2003). N-CoR mediates DNA methylation-dependent repression through a methyl CpG binding protein Kaiso.. Mol. Cell 12: 723 — 734. PubMed DOI:10.1016/j.molcel.2003.08.008

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7672 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, O75376 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7672 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O75376 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.