NCOR2

NCOR2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2RT5, 4OAR, 2L5G, 2LTP, 1KKQ, 3R2A, 2ODD, 4A69, 3R29, 1XC5, 1R2B,%%s1KKQ, 1R2B, 1XC5, 2GPV, 2LTP, 3R29, 3R2A, 4A69, 2L5G, 2ODD, 2RT5, 4OAR
Ідентифікатори
Символи	NCOR2, CTG26, N-CoR2, SMAP270, SMRT, SMRTE, SMRTE-tau, TNRC14, TRAC, TRAC-1, TRAC1, nuclear receptor corepressor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600848 MGI: 1337080 HomoloGene: 31370 GeneCards: NCOR2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001106 transcription corepressor activity; • protein N-terminus binding; • histone deacetylase binding; • Notch binding; • DNA binding; • transcription factor binding; • nuclear receptor binding; • GO:0001948 protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • chromatin binding; • sequence-specific DNA binding; • glucocorticoid receptor binding; • retinoic acid receptor binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • retinoid X receptor binding;
Клітинна компонента	• transcription repressor complex; • Ядерні тільця; • мембрана; • histone deacetylase complex; • nuclear matrix; • Нуклеоплазма; • клітинне ядро; • Хроматин;
Біологічний процес	• negative regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA; • regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of lipid metabolic process; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of androgen receptor signaling pathway; • Лактація; • response to organonitrogen compound; • response to estradiol; • еструс;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	9612
	20602
	ENSG00000196498
	ENSMUSG00000029478
	Q9Y618
	Q9WU42
	NM_006312; NM_001077261; NM_001206654
	NM_001253904; NM_001253905; NM_011424
	NP_001070729; NP_001193583; NP_006303; NP_001193583.1
	NP_001240833; NP_001240834; NP_035554
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NCOR2 (англ. Nuclear receptor corepressor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 525 амінокислот, а молекулярна маса — 274 804[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGSTQPVAQ	TWRATEPRYP	PHSLSYPVQI	ARTHTDVGLL	EYQHHSRDYA
SHLSPGSIIQ	PQRRRPSLLS	EFQPGNERSQ	ELHLRPESHS	YLPELGKSEM
EFIESKRPRL	ELLPDPLLRP	SPLLATGQPA	GSEDLTKDRS	LTGKLEPVSP
PSPPHTDPEL	ELVPPRLSKE	ELIQNMDRVD	REITMVEQQI	SKLKKKQQQL
EEEAAKPPEP	EKPVSPPPIE	SKHRSLVQII	YDENRKKAEA	AHRILEGLGP
QVELPLYNQP	SDTRQYHENI	KINQAMRKKL	ILYFKRRNHA	RKQWEQKFCQ
RYDQLMEAWE	KKVERIENNP	RRRAKESKVR	EYYEKQFPEI	RKQRELQERM
QSRVGQRGSG	LSMSAARSEH	EVSEIIDGLS	EQENLEKQMR	QLAVIPPMLY
DADQQRIKFI	NMNGLMADPM	KVYKDRQVMN	MWSEQEKETF	REKFMQHPKN
FGLIASFLER	KTVAECVLYY	YLTKKNENYK	SLVRRSYRRR	GKSQQQQQQQ
QQQQQQQQQQ	PMPRSSQEEK	DEKEKEKEAE	KEEEKPEVEN	DKEDLLKEKT
DDTSGEDNDE	KEAVASKGRK	TANSQGRRKG	RITRSMANEA	NSEEAITPQQ
SAELASMELN	ESSRWTEEEM	ETAKKGLLEH	GRNWSAIARM	VGSKTVSQCK
NFYFNYKKRQ	NLDEILQQHK	LKMEKERNAR	RKKKKAPAAA	SEEAAFPPVV
EDEEMEASGV	SGNEEEMVEE	AEALHASGNE	VPRGECSGPA	TVNNSSDTES
IPSPHTEAAK	DTGQNGPKPP	ATLGADGPPP	GPPTPPPEDI	PAPTEPTPAS
EATGAPTPPP	APPSPSAPPP	VVPKEEKEEE	TAAAPPVEEG	EEQKPPAAEE
LAVDTGKAEE	PVKSECTEEA	EEGPAKGKDA	EAAEATAEGA	LKAEKKEGGS
GRATTAKSSG	APQDSDSSAT	CSADEVDEAE	GGDKNRLLSP	RPSLLTPTGD
PRANASPQKP	LDLKQLKQRA	AAIPPIQVTK	VHEPPREDAA	PTKPAPPAPP
PPQNLQPESD	APQQPGSSPR	GKSRSPAPPA	DKEAEKPVFF	PAFAAEAQKL
PGDPPCWTSG	LPFPVPPREV	IKASPHAPDP	SAFSYAPPGH	PLPLGLHDTA
RPVLPRPPTI	SNPPPLISSA	KHPSVLERQI	GAISQGMSVQ	LHVPYSEHAK
APVGPVTMGL	PLPMDPKKLA	PFSGVKQEQL	SPRGQAGPPE	SLGVPTAQEA
SVLRGTALGS	VPGGSITKGI	PSTRVPSDSA	ITYRGSITHG	TPADVLYKGT
ITRIIGEDSP	SRLDRGREDS	LPKGHVIYEG	KKGHVLSYEG	GMSVTQCSKE
DGRSSSGPPH	ETAAPKRTYD	MMEGRVGRAI	SSASIEGLMG	RAIPPERHSP
HHLKEQHHIR	GSITQGIPRS	YVEAQEDYLR	REAKLLKREG	TPPPPPPSRD
LTEAYKTQAL	GPLKLKPAHE	GLVATVKEAG	RSIHEIPREE	LRHTPELPLA
PRPLKEGSIT	QGTPLKYDTG	ASTTGSKKHD	VRSLIGSPGR	TFPPVHPLDV
MADARALERA	CYEESLKSRP	GTASSSGGSI	ARGAPVIVPE	LGKPRQSPLT
YEDHGAPFAG	HLPRGSPVTT	REPTPRLQEG	SLSSSKASQD	RKLTSTPREI
AKSPHSTVPE	HHPHPISPYE	HLLRGVSGVD	LYRSHIPLAF	DPTSIPRGIP
LDAAAAYYLP	RHLAPNPTYP	HLYPPYLIRG	YPDTAALENR	QTIINDYITS
QQMHHNAATA	MAQRADMLRG	LSPRESSLAL	NYAAGPRGII	DLSQVPHLPV
LVPPTPGTPA	TAMDRLAYLP	TAPQPFSSRH	SSSPLSPGGP	THLTKPTTTS
SSERERDRDR	ERDRDREREK	SILTSTTTVE	HAPIWRPGTE	QSSGSSGSSG
GGGGSSSRPA	SHSHAHQHSP	ISPRTQDALQ	QRPSVLHNTG	MKGIITAVEP
STPTVLRSTS	TSSPVRPAAT	FPPATHCPLG	GTLDGVYPTL	MEPVLLPKEA
PRVARPERPR	ADTGHAFLAK	PPARSGLEPA	SSPSKGSEPR	PLVPPVSGHA
TIARTPAKNL	APHHASPDPP	APPASASDPH	REKTQSKPFS	IQELELRSLG
YHGSSYSPEG	VEPVSPVSSP	SLTHDKGLPK	HLEELDKSHL	EGELRPKQPG
PVKLGGEAAH	LPHLRPLPES	QPSSSPLLQT	APGVKGHQRV	VTLAQHISEV
ITQDYTRHHP	QQLSAPLPAP	LYSFPGASCP	VLDLRRPPSD	LYLPPPDHGA
PARGSPHSEG	GKRSPEPNKT	SVLGGGEDGI	EPVSPPEGMT	EPGHSRSAVY
PLLYRDGEQT	EPSRMGSKSP	GNTSQPPAFF	SKLTESNSAM	VKSKKQEINK
KLNTHNRNEP	EYNISQPGTE	IFNMPAITGT	GLMTYRSQAV	QEHASTNMGL
EAIIRKALMG	KYDQWEESPP	LSANAFNPLN	ASASLPAAMP	ITAADGRSDH
TLTSPGGGGK	AKVSGRPSSR	KAKSPAPGLA	SGDRPPSVSS	VHSEGDCNRR
TPLTNRVWED	RPSSAGSTPF	PYNPLIMRLQ	AGVMASPPPP	GLPAGSGPLA
GPHHAWDEEP	KPLLCSQYET	LSDSE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Sande S., Privalsky M.L. (1996). Identification of TRACs (T3 receptor-associating cofactors), a family of cofactors that associate with, and modulate the activity of, nuclear hormone receptors.. Mol. Endocrinol. 10: 813 — 825. PubMed DOI:10.1210/mend.10.7.8813722
Chen J.D., Evans R.M. (1995). A transcriptional co-repressor that interacts with nuclear hormone receptors.. Nature 377: 454 — 457. PubMed DOI:10.1038/377454a0
Zhang J., Kalkum M., Chait B.T., Roeder R.G. (2002). The N-CoR-HDAC3 nuclear receptor corepressor complex inhibits the JNK pathway through the integral subunit GPS2.. Mol. Cell 9: 611 — 623. PubMed DOI:10.1016/S1097-2765(02)00468-9
Hauksdottir H., Farboud B., Privalsky M.L. (2003). Retinoic acid receptors beta and gamma do not repress, but instead activate target gene transcription in both the absence and presence of hormone ligand.. Mol. Endocrinol. 17: 373 — 385. PubMed DOI:10.1210/me.2002-0340
Goodson M.L., Jonas B.A., Privalsky M.L. (2005). Alternative mRNA splicing of SMRT creates functional diversity by generating corepressor isoforms with different affinities for different nuclear receptors.. J. Biol. Chem. 280: 7493 — 7503. PubMed DOI:10.1074/jbc.M411514200

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7673 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q9Y618 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7673 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9Y618 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.