NEIL1

NEIL1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1TDH, 4NRV, 5ITY, 5ITQ, 5ITU, 5ITX, 5ITR, 5ITT
Ідентифікатори
Символи	NEIL1, FPG1, NEI1, hFPG1, nei like DNA glycosylase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608844 MGI: 1920024 HomoloGene: 11616 GeneCards: NEIL1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • zinc ion binding; • hydrolase activity, hydrolyzing N-glycosyl compounds; • hydrolase activity, acting on glycosyl bonds; • damaged DNA binding; • protein C-terminus binding; • каталітична активність; • lyase activity; • nucleic acid binding; • hydrolase activity; • DNA N-glycosylase activity; • DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity; • class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • хромосома; • Центр організації мікротрубочок; • Цитоскелет; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма;
Біологічний процес	• nucleotide-excision repair; • response to oxidative stress; • cellular response to DNA damage stimulus; • depyrimidination; • negative regulation of nuclease activity; • Обмін речовин; • Репарація ДНК; • base-excision repair;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	79661
	72774
	ENSG00000140398
	ENSMUSG00000032298
	Q96FI4
	Q8K4Q6
	NM_001256552; NM_024608; NM_001352519; NM_001352520
	NM_028347; NM_001357409
	NP_001243481; NP_078884; NP_001339448; NP_001339449
	NP_082623; NP_001344338
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NEIL1 (англ. Nei like DNA glycosylase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 390 амінокислот, а молекулярна маса — 43 684[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPEGPELHLA	SQFVNEACRA	LVFGGCVEKS	SVSRNPEVPF	ESSAYRISAS
ARGKELRLIL	SPLPGAQPQQ	EPLALVFRFG	MSGSFQLVPR	EELPRHAHLR
FYTAPPGPRL	ALCFVDIRRF	GRWDLGGKWQ	PGRGPCVLQE	YQQFRENVLR
NLADKAFDRP	ICEALLDQRF	FNGIGNYLRA	EILYRLKIPP	FEKARSVLEA
LQQHRPSPEL	TLSQKIRTKL	QNPDLLELCH	SVPKEVVQLG	GKGYGSESGE
EDFAAFRAWL	RCYGMPGMSS	LQDRHGRTIW	FQGDPGPLAP	KGRKSRKKKS
KATQLSPEDR	VEDALPPSKA	PSRTRRAKRD	LPKRTATQRP	EGTSLQQDPE
APTVPKKGRR	KGRQAASGHC	RPRKVKADIP	SLEPEGTSAS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, гідролаз, глікозидаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, хромосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Bandaru V., Sunkara S., Wallace S.S., Bond J.P. (2002). A novel human DNA glycosylase that removes oxidative DNA damage and is homologous to Escherichia coli endonuclease VIII.. DNA Repair 1: 517 — 529. PubMed DOI:10.1016/S1568-7864(02)00036-8
Dou H., Mitra S., Hazra T.K. (2003). Repair of oxidized bases in DNA bubble structures by human DNA glycosylases NEIL1 and NEIL2.. J. Biol. Chem. 278: 49679 — 49684. PubMed DOI:10.1074/jbc.M308658200
Hildrestrand G.A., Rolseth V., Bjoras M., Luna L. (2007). Human NEIL1 localizes with the centrosomes and condensed chromosomes during mitosis.. DNA Repair 6: 1425 — 1433. PubMed DOI:10.1016/j.dnarep.2007.04.008
Yeo J., Goodman R.A., Schirle N.T., David S.S., Beal P.A. (2010). RNA editing changes the lesion specificity for the DNA repair enzyme NEIL1.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 20715 — 20719. PubMed DOI:10.1073/pnas.1009231107
Doublie S., Bandaru V., Bond J.P., Wallace S.S. (2004). The crystal structure of human endonuclease VIII-like 1 (NEIL1) reveals a zincless finger motif required for glycosylase activity.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 10284 — 10289. PubMed DOI:10.1073/pnas.0402051101

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18448 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, Q96FI4 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18448 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q96FI4 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.