NGFR

NGFR
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3EWV, 2N80, 2N97, 2N83
Ідентифікатори
Символи	NGFR, CD271, Gp80-LTNFRSF16, p75(NTR), p75NTR, nerve growth factor receptor
Зовнішні ІД	OMIM: 162010 MGI: 97323 HomoloGene: 1877 GeneCards: NGFR
Онтологія гена
Молекулярна функція	• signal transducer activity; • transmembrane signaling receptor activity; • tumor necrosis factor-activated receptor activity; • ubiquitin protein ligase binding; • GO:0001948 protein binding; • calmodulin binding; • coreceptor activity; • neurotrophin binding; • nerve growth factor binding; • amyloid-beta binding; • death receptor activity; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• extracellular region; • Нуклеоплазма; • integral component of membrane; • гіалоплазма; • integral component of plasma membrane; • neuron projection; • мембрана; • cell surface; • ендосома; • клітинне ядро; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• ритмічний процес; • regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • negative regulation of apoptotic process; • neurotrophin TRK receptor signaling pathway; • Сигнальна трансдукція; • axon guidance; • multicellular organism development; • Апоптоз; • negative regulation of axonogenesis; • нейробіологія розвитку; • glucose homeostasis; • positive regulation of axonogenesis; • circadian regulation of gene expression; • membrane protein intracellular domain proteolysis; • Диференціація клітин; • inflammatory response; • Імунна відповідь; • intracellular protein transport; • positive regulation of apoptotic process; • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • response to lipopolysaccharide; • apoptotic signaling pathway; • negative regulation of neuron projection development; • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • positive regulation of protein localization to nucleus; • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of blood vessel endothelial cell proliferation involved in sprouting angiogenesis; • Rho protein signal transduction; • cellular glucose homeostasis; • neuron apoptotic process; • cellular response to amyloid-beta;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4804
	18053
	ENSG00000064300
	ENSMUSG00000000120
	P08138
	Q9Z0W1
	NM_002507
	NM_033217
	NP_002498
	NP_150086
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NGFR (англ. Nerve growth factor receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 427 амінокислот, а молекулярна маса — 45 183[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGAGATGRAM	DGPRLLLLLL	LGVSLGGAKE	ACPTGLYTHS	GECCKACNLG
EGVAQPCGAN	QTVCEPCLDS	VTFSDVVSAT	EPCKPCTECV	GLQSMSAPCV
EADDAVCRCA	YGYYQDETTG	RCEACRVCEA	GSGLVFSCQD	KQNTVCEECP
DGTYSDEANH	VDPCLPCTVC	EDTERQLREC	TRWADAECEE	IPGRWITRST
PPEGSDSTAP	STQEPEAPPE	QDLIASTVAG	VVTTVMGSSQ	PVVTRGTTDN
LIPVYCSILA	AVVVGLVAYI	AFKRWNSCKQ	NKQGANSRPV	NQTPPPEGEK
LHSDSGISVD	SQSLHDQQPH	TQTASGQALK	GDGGLYSSLP	PAKREEVEKL
LNGSAGDTWR	HLAGELGYQP	EHIDSFTHEA	CPVRALLASW	ATQDSATLDA
LLAALRRIQR	ADLVESLCSE	STATSPV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, біологічні ритми, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Sehgal A., Patil N., Chao M. (1988). A constitutive promoter directs expression of the nerve growth factor receptor gene.. Mol. Cell. Biol. 8: 3160 — 3167. PubMed DOI:10.1128/MCB.8.8.3160
Khursigara G., Orlinick J.R., Chao M.V. (1999). Association of the p75 neurotrophin receptor with TRAF6.. J. Biol. Chem. 274: 2597 — 2600. PubMed DOI:10.1074/jbc.274.5.2597
Bai D., Chen H., Huang B.-R. (2003). RanBPM is a novel binding protein for p75NTR.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 309: 552 — 557. PubMed DOI:10.1016/j.bbrc.2003.08.033
Chapman B.S., Eckart M.R., Kaufman S.E., Lapointe G.R. (1996). O-linked oligosaccharide on the 75-kDa neurotrophin receptor.. J. Neurochem. 66: 1707 — 1716. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7809 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P08138 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7809 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P08138 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.