OLR1

OLR1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1YPO, 1YPQ, 1YPU, 1YXJ, 1YXK, 3VLG
Ідентифікатори
Символи	OLR1, CLEC8A, LOX1, LOXIN, SCARE1, SLOX1, oxidized low density lipoprotein receptor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602601 MGI: 1261434 HomoloGene: 1910 GeneCards: OLR1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • carbohydrate binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • receptor complex; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • Нуклеоплазма; • extracellular region; • membrane raft; • specific granule membrane; • tertiary granule membrane;
Біологічний процес	• immune system process; • кровообіг; • Протеоліз; • Адгезія клітин; • inflammatory response; • leukocyte migration; • neutrophil degranulation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4973
	108078
	ENSG00000173391
	ENSMUSG00000030162
	P78380
	Q9EQ09
	NM_001172632; NM_001172633; NM_002543
	NM_001301094; NM_001301096; NM_138648
	NP_001166103; NP_001166104; NP_002534
	NP_001288023; NP_001288025; NP_619589
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

OLR1 (англ. Oxidized low density lipoprotein receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 273 амінокислот, а молекулярна маса — 30 959[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTFDDLKIQT	VKDQPDEKSN	GKKAKGLQFL	YSPWWCLAAA	TLGVLCLGLV
VTIMVLGMQL	SQVSDLLTQE	QANLTHQKKK	LEGQISARQQ	AEEASQESEN
ELKEMIETLA	RKLNEKSKEQ	MELHHQNLNL	QETLKRVANC	SAPCPQDWIW
HGENCYLFSS	GSFNWEKSQE	KCLSLDAKLL	KINSTADLDF	IQQAISYSSF
PFWMGLSRRN	PSYPWLWEDG	SPLMPHLFRV	RGAVSQTYPS	GTCAYIQRGA
VYAENCILAA	FSICQKKANL	RAQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Yamanaka S., Zhang X.-Y., Miura K., Kim S., Iwao H. (1998). The human gene encoding the lectin-type oxidized LDL receptor (OLR1) is a novel member of the natural killer gene complex with a unique expression profile.. Genomics 54: 191 — 199. PubMed DOI:10.1006/geno.1998.5561
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Hayashida K., Kume N., Minami M., Kita T. (2002). Lectin-like oxidized LDL receptor-1 (LOX-1) supports adhesion of mononuclear leukocytes and a monocyte-like cell line THP-1 cells under static and flow conditions.. FEBS Lett. 511: 133 — 138. PubMed DOI:10.1016/S0014-5793(01)03297-5
Luedecking-Zimmer E., DeKosky S.T., Chen Q., Barmada M.M., Kamboh M.I. (2002). Investigation of oxidized LDL-receptor 1 (OLR1) as the candidate gene for Alzheimer's disease on chromosome 12.. Hum. Genet. 111: 443 — 451. PubMed DOI:10.1007/s00439-002-0802-7
Hu B., Li D., Sawamura T., Mehta J.L. (2003). Oxidized LDL through LOX-1 modulates LDL-receptor expression in human coronary artery endothelial cells.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 307: 1008 — 1012. PubMed DOI:10.1016/S0006-291X(03)01295-6
Pritchard A., St Clair D., Lemmon H., Mann D.M.A., Lendon C. (2004). No association between polymorphisms in the lectin-like oxidised low density lipoprotein receptor (ORL1) gene on chromosome 12 and Alzheimer's disease in a UK cohort.. Neurosci. Lett. 366: 126 — 129. PubMed DOI:10.1016/j.neulet.2004.05.023

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8133 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P78380 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8133 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P78380 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.