PDGFRA

PDGFRA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1GQ5
Ідентифікатори
Символи	PDGFRA, CD140A, PDGFR-2, PDGFR2, RHEGAS9, platelet derived growth factor receptor alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 173490 MGI: 97530 HomoloGene: 31361 GeneCards: PDGFRA
Пов'язані генетичні захворювання
	Астигматизм, gastrointestinal stromal tumor[1]
Реагує на сполуку
	cediranib, crenolanib, Масітиніб, Нінтеданіб[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• vascular endothelial growth factor-activated receptor activity; • transferase activity; • protein kinase activity; • nucleotide binding; • protein homodimerization activity; • vascular endothelial growth factor binding; • platelet-derived growth factor receptor binding; • kinase activity; • GO:0001948 protein binding; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity; • platelet-derived growth factor alpha-receptor activity; • protein tyrosine kinase activity; • ATP binding; • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • platelet-derived growth factor binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • intrinsic component of plasma membrane; • integral component of plasma membrane; • клітинна мембрана; • Міжклітинні контакти; • клітинне ядро; • цитоплазма; • Мікроворсинки; • external side of plasma membrane; • cell surface; • комплекс Ґольджі; • Війка; • protein-containing complex; • cell projection; • receptor complex;
Біологічний процес	• embryonic skeletal system morphogenesis; • regulation of actin cytoskeleton reorganization; • regulation of chemotaxis; • фосфорилювання; • positive regulation of phospholipase C activity; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • positive regulation of cell migration; • positive regulation of fibroblast proliferation; • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; • cell activation; • MAPK cascade; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity; • cellular response to reactive oxygen species; • positive regulation of DNA replication; • negative regulation of platelet activation; • protein phosphorylation; • хемотаксис; • multicellular organism development; • positive regulation of cell population proliferation; • positive regulation of cell proliferation by VEGF-activated platelet derived growth factor receptor signaling pathway; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling; • platelet-derived growth factor receptor signaling pathway; • GO:0022415 viral process; • platelet aggregation; • regulation of mesenchymal stem cell differentiation; • phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process; • negative regulation of platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway; • luteinization; • in utero embryonic development; • hematopoietic progenitor cell differentiation; • estrogen metabolic process; • female gonad development; • anatomical structure morphogenesis; • animal organ morphogenesis; • cell migration; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • signal transduction involved in regulation of gene expression; • extracellular matrix organization; • lung development; • adrenal gland development; • male genitalia development; • Leydig cell differentiation; • platelet-derived growth factor receptor-alpha signaling pathway; • Загоєння ран; • odontogenesis of dentin-containing tooth; • protein autophosphorylation; • embryonic digestive tract morphogenesis; • embryonic cranial skeleton morphogenesis; • skeletal system morphogenesis; • cardiac myofibril assembly; • roof of mouth development; • face morphogenesis; • cell chemotaxis; • retina vasculature development in camera-type eye; • cellular response to amino acid stimulus; • metanephric glomerular capillary formation; • phosphatidylinositol-mediated signaling; • positive regulation of protein kinase B signaling; • positive regulation of MAPK cascade;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5156
	18595
	ENSG00000134853
	ENSMUSG00000029231
	P16234
	P26618
	NM_006206; NM_001347827; NM_001347828; NM_001347829; NM_001347830
	NM_001083316; NM_011058; NM_001347718; NM_001347719
	NP_001334756; NP_001334757; NP_001334758; NP_001334759; NP_006197
	NP_001076785; NP_001334647; NP_001334648; NP_035188
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PDGFRA (англ. Platelet derived growth factor receptor alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 089 амінокислот, а молекулярна маса — 122 670[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGTSHPAFLV	LGCLLTGLSL	ILCQLSLPSI	LPNENEKVVQ	LNSSFSLRCF
GESEVSWQYP	MSEEESSDVE	IRNEENNSGL	FVTVLEVSSA	SAAHTGLYTC
YYNHTQTEEN	ELEGRHIYIY	VPDPDVAFVP	LGMTDYLVIV	EDDDSAIIPC
RTTDPETPVT	LHNSEGVVPA	SYDSRQGFNG	TFTVGPYICE	ATVKGKKFQT
IPFNVYALKA	TSELDLEMEA	LKTVYKSGET	IVVTCAVFNN	EVVDLQWTYP
GEVKGKGITM	LEEIKVPSIK	LVYTLTVPEA	TVKDSGDYEC	AARQATREVK
EMKKVTISVH	EKGFIEIKPT	FSQLEAVNLH	EVKHFVVEVR	AYPPPRISWL
KNNLTLIENL	TEITTDVEKI	QEIRYRSKLK	LIRAKEEDSG	HYTIVAQNED
AVKSYTFELL	TQVPSSILDL	VDDHHGSTGG	QTVRCTAEGT	PLPDIEWMIC
KDIKKCNNET	SWTILANNVS	NIITEIHSRD	RSTVEGRVTF	AKVEETIAVR
CLAKNLLGAE	NRELKLVAPT	LRSELTVAAA	VLVLLVIVII	SLIVLVVIWK
QKPRYEIRWR	VIESISPDGH	EYIYVDPMQL	PYDSRWEFPR	DGLVLGRVLG
SGAFGKVVEG	TAYGLSRSQP	VMKVAVKMLK	PTARSSEKQA	LMSELKIMTH
LGPHLNIVNL	LGACTKSGPI	YIITEYCFYG	DLVNYLHKNR	DSFLSHHPEK
PKKELDIFGL	NPADESTRSY	VILSFENNGD	YMDMKQADTT	QYVPMLERKE
VSKYSDIQRS	LYDRPASYKK	KSMLDSEVKN	LLSDDNSEGL	TLLDLLSFTY
QVARGMEFLA	SKNCVHRDLA	ARNVLLAQGK	IVKICDFGLA	RDIMHDSNYV
SKGSTFLPVK	WMAPESIFDN	LYTTLSDVWS	YGILLWEIFS	LGGTPYPGMM
VDSTFYNKIK	SGYRMAKPDH	ATSEVYEIMV	KCWNSEPEKR	PSFYHLSEIV
ENLLPGQYKK	SYEKIHLDFL	KSDHPAVARM	RVDSDNAYIG	VTYKNEEDKL
KDWEGGLDEQ	RLSADSGYII	PLPDIDPVPE	EEDLGKRNRH	SSQTSEESAI
ETGSSSSTFI	KREDETIEDI	DMMDDIGIDS	SDLVEDSFL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, білків розвитку, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, хемотаксис, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані.

Література

Claesson-Welsh L., Eriksson A., Westermark B., Heldin C.H. (1989). cDNA cloning and expression of the human A-type platelet-derived growth factor (PDGF) receptor establishes structural similarity to the B-type PDGF receptor.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 4917 — 4921. PubMed DOI:10.1073/pnas.86.13.4917
Kawagishi J., Ku T. (1995). Structure, organization, and transcription units of the human alpha-platelet-derived growth factor receptor gene, PDGFRA.. Genomics 30: 224 — 232. PubMed DOI:10.1006/geno.1995.9883
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Griffin J.H., Leung J., Bruner R.J., Caligiuri M.A., Briesewitz R. (2003). Discovery of a fusion kinase in EOL-1 cells and idiopathic hypereosinophilic syndrome.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 7830 — 7835. PubMed DOI:10.1073/pnas.0932698100
Yokote K., Margolis B., Heldin C.H., Claesson-Welsh L. (1996). Grb7 is a downstream signaling component of platelet-derived growth factor alpha- and beta-receptors.. J. Biol. Chem. 271: 30942 — 30949. PubMed DOI:10.1074/jbc.271.48.30942
Bazenet C.E., Gelderloos J.A., Kazlauskas A. (1996). Phosphorylation of tyrosine 720 in the platelet-derived growth factor alpha receptor is required for binding of Grb2 and SHP-2 but not for activation of Ras or cell proliferation.. Mol. Cell. Biol. 16: 6926 — 6936. PubMed DOI:10.1128/MCB.16.12.6926

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з PDGFRA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Сполуки, які фізично взаємодіють з Platelet derived growth factor receptor alpha переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8803 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, P16234 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PDGFRA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Platelet derived growth factor receptor alpha переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8803 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-6] UniProt, P16234 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.