PIWIL2

PIWIL2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3O7X, 3QIR
Ідентифікатори
Символи	PIWIL2, CT80, HILI, PIWIL1L, mili, piwi like RNA-mediated gene silencing 2
Зовнішні ІД	OMIM: 610312 MGI: 1930036 HomoloGene: 23071 GeneCards: PIWIL2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA binding; • nucleic acid binding; • piRNA binding; • mRNA binding; • nuclease activity; • endonuclease activity; • endoribonuclease activity; • hydrolase activity; • зв'язування з іоном металу; • polysome binding; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • chromatoid body; • polysome; • perinucleolar chromocenter; • pi-body; • P granule; • dense body; • PET complex; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• germ-line stem cell population maintenance; • Диференціація клітин; • positive regulation of histone H3-K9 acetylation; • RNA 5'-end processing; • positive regulation of meiosis I; • positive regulation of translation; • DNA methylation involved in gamete generation; • Оогенез; • multicellular organism development; • GO:0007126 Мейоз; • positive regulation of histone H3-K14 acetylation; • regulation of translation; • piRNA metabolic process; • Сайленсинг генів; • Сперматогенез; • negative regulation of transposition; • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic; • piRNA biosynthetic process; • negative regulation of circadian rhythm; • ритмічний процес;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	55124
	57746
	ENSG00000197181
	ENSMUSG00000033644
	Q8TC59
	Q8CDG1
	NM_001135721; NM_018068; NM_001330480
	NM_021308; NM_001364321
	NP_001129193; NP_001317409; NP_060538
	NP_067283; NP_001351250
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PIWIL2 (англ. Piwi like RNA-mediated gene silencing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 973 амінокислот, а молекулярна маса — 109 849[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDPFRPSFRG	QSPIHPSQCQ	AVRMPGCWPQ	ASKPLDPALG	RGAPAGRGHV
FGKPEEPSTQ	RGPAQRESVG	LVSMFRGLGI	ETVSKTPLKR	EMLPSGRGIL
GRGLSANLVR	KDREELSPTF	WDPKVLAAGD	SKMAETSVGW	SRTLGRGSSD
ASLLPLGRAA	GGISREVDKP	PCTFSTPSRG	PPQLSSPPAL	PQSPLHSPDR
PLVLTVEHKE	KELIVKQGSK	GTPQSLGLNL	VKIQCHNEAV	YQYHVTFSPN
VECKSMRFGM	LKDHQAVTGN	VTAFDGSILY	LPVKLQQVLE	LKSQRKTDSA
EISIKIQMTK	ILEPCSDLCI	PFYNVVFRRV	MKLLDMKLVG	RNFYDPTSAM
VLQQHRLQIW	PGYAASIRRT	DGGLFLLADV	SHKVIRNDCV	LDVMHAIYQQ
NKEHFQDECT	KLLVGNIVIT	RYNNRTYRID	DVDWNKTPKD	SFTMSDGKEI
TFLEYYSKNY	GITVKEEDQP	LLIHRPSERQ	DNHGMLLKGE	ILLLPELSFM
TGIPEKMKKD	FRAMKDLAQQ	INLSPKQHHS	ALECLLQRIA	KNEAATNELM
RWGLRLQKDV	HKIEGRVLPM	ERINLKNTSF	ITSQELNWVK	EVTRDPSILT
IPMHFWALFY	PKRAMDQARE	LVNMLEKIAG	PIGMRMSPPA	WVELKDDRIE
TYVRTIQSTL	GAEGKIQMVV	CIIMGPRDDL	YGAIKKLCCV	QSPVPSQVVN
VRTIGQPTRL	RSVAQKILLQ	INCKLGGELW	GVDIPLKQLM	VIGMDVYHDP
SRGMRSVVGF	VASINLTLTK	WYSRVVFQMP	HQEIVDSLKL	CLVGSLKKFY
EVNHCLPEKI	VVYRDGVSDG	QLKTVANYEI	PQLQKCFEAF	ENYQPKMVVF
VVQKKISTNL	YLAAPQNFVT	PTPGTVVDHT	ITSCEWVDFY	LLAHHVRQGC
GIPTHYVCVL	NTANLSPDHM	QRLTFKLCHM	YWNWPGTIRV	PAPCKYAHKL
AFLSGHILHH	EPAIQLCENL	FFL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, білків розвитку, ендонуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, диференціація клітин, сперматогенез, РНК-залежне заглушення генів, мейоз, альтернативний сплайсинг, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Sasaki T., Shiohama A., Minoshima S., Shimizu N. (2003). Identification of eight members of the Argonaute family in the human genome.. Genomics 82: 323 — 330. PubMed DOI:10.1016/S0888-7543(03)00129-0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Tian Y., Simanshu D.K., Ma J.B., Patel D.J. (2011). Structural basis for piRNA 2'-O-methylated 3'-end recognition by Piwi PAZ (Piwi/Argonaute/Zwille) domains.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 903 — 910. PubMed DOI:10.1073/pnas.1017762108

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17644 (англ.). Процитовано 19 вересня 2017.
UniProt, Q8TC59 (англ.). Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17644 (англ.). Процитовано 19 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q8TC59 (англ.). Процитовано 19 вересня 2017.