POLB

POLB
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1BPX, 1BPY, 1BPZ, 1MQ2, 1MQ3, 1TV9, 1TVA, 1ZJM, 1ZJN, 1ZQA, 1ZQB, 1ZQC, 1ZQD, 1ZQE, 1ZQF, 1ZQG, 1ZQH, 1ZQI, 1ZQJ, 1ZQK, 1ZQL, 1ZQM, 1ZQN, 1ZQO, 1ZQP, 1ZQQ, 1ZQR, 1ZQS, 1ZQT, 2FMP, 2FMQ, 2FMS, 2I9G, 2ISO, 2ISP, 2P66, 2PXI, 3C2K, 3C2L, 3C2M, 3GDX, 3ISB, 3ISC, 3ISD, 3JPN, 3JPO, 3JPP, 3JPQ, 3JPR, 3JPS, 3JPT, 3LK9, 3MBY, 3OGU, 3RH4, 3RH5, 3RH6, 3RJE, 3RJF, 3RJG, 3RJH, 3RJI, 3RJJ, 3RJK, 3TFR, 3TFS, 4DO9, 4DOA, 4DOB, 4DOC, 4F5N, 4F5O, 4F5P, 4F5Q, 4F5R, 4GXI, 4GXJ, 4GXK, 4JWM, 4JWN, 4KLD, 4KLE, 4KLF, 4KLG, 4KLH, 4KLI, 4KLJ, 4KLL, 4KLM, 4KLO, 4KLQ, 4KLS, 4KLT, 4KLU, 4LVS, 4M2Y, 4M47, 4M9G, 4M9H, 4M9J, 4M9L, 4M9N, 4MF2, 4MF8, 4MFA, 4MFC, 4MFF, 4NLK, 4NLN, 4NLZ, 4NM1, 4NM2, 4NXZ, 4NY8, 4O5C, 4O5E, 4O5K, 4O9M, 4P2H, 4PGQ, 4PGX, 4PGY, 4PH5, 4PHA, 4PHD, 4PHE, 4PHP, 4PPX, 4R63, 4R64, 4R65, 4R66, 4RPX, 4RPY, 4RPZ, 4RQ0, 4RQ1, 4RQ2, 4RQ3, 4RQ4, 4RQ5, 4RQ6, 4RQ7, 4RQ8, 4RT2, 4RT3, 4TUP, 4TUQ, 4TUR, 4TUS, 4UAW, 4UAY, 4UAZ, 4UB1, 4UB2, 4UB3, 4UB4, 4UB5, 4UBB, 4UBC, 7ICE, 7ICF, 7ICG, 7ICH, 7ICI, 7ICJ, 7ICK, 7ICL, 7ICM, 7ICN, 7ICO, 7ICP, 7ICQ, 7ICR, 7ICS, 7ICT, 7ICU, 7ICV, 8ICA, 8ICB, 8ICC, 8ICE, 8ICF, 8ICG, 8ICH, 8ICI, 8ICJ, 8ICK, 8ICL, 8ICM, 8ICN, 8ICO, 8ICP, 8ICQ, 8ICR, 8ICS, 8ICT, 8ICU, 8ICV, 8ICW, 8ICX, 8ICY, 8ICZ, 9ICA, 9ICB, 9ICC, 9ICE, 9ICF, 9ICG, 9ICH, 9ICI, 9ICJ, 9ICK, 9ICL, 9ICM, 9ICN, 9ICO, 9ICP, 9ICQ, 9ICR, 9ICS, 9ICT, 9ICU, 9ICV, 9ICW, 9ICX, 9ICY, 5BOL, 5BOM, 5BPC, 5DB8, 5DBB, 5DBA, 5DB7, 5DBC, 5DB9, 5DB6, 4YMN, 4YN4, 4YMO, 4YMM, 4Z6C, 4Z6F, 4Z6D, 4Z6E
Ідентифікатори
Символи	POLB, DNA polymerase beta
Зовнішні ІД	OMIM: 174760 MGI: 97740 HomoloGene: 2013 GeneCards: POLB
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • DNA binding; • nucleotidyltransferase activity; • microtubule binding; • зв'язування з іоном металу; • damaged DNA binding; • GO:0001948 protein binding; • lyase activity; • enzyme binding; • DNA-directed DNA polymerase activity; • DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity; • ДНК-полімераза; • DNA polymerase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • Нуклеоплазма; • spindle microtubule; • Мікротрубочки; • клітинне ядро; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• neuron apoptotic process; • somatic hypermutation of immunoglobulin genes; • pyrimidine dimer repair; • nucleotide-excision repair, DNA gap filling; • DNA-dependent DNA replication; • DNA biosynthetic process; • homeostasis of number of cells; • response to hyperoxia; • Старіння людини; • spleen development; • salivary gland morphogenesis; • cellular response to DNA damage stimulus; • immunoglobulin heavy chain V-D-J recombination; • Реплікація ДНК; • somatic diversification of immunoglobulins; • base-excision repair, gap-filling; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; • response to ethanol; • inflammatory response; • lymph node development; • response to gamma radiation; • Репарація ДНК; • Апоптоз; • base-excision repair; • base-excision repair, DNA ligation; • base-excision repair, base-free sugar-phosphate removal; • protein deubiquitination; • double-strand break repair via nonhomologous end joining;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5423
	18970
	ENSG00000070501
	ENSMUSG00000031536
	P06746
	Q8K409
	NM_002690
	NM_011130
	NP_002681
	NP_035260
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

POLB (англ. DNA polymerase beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 335 амінокислот, а молекулярна маса — 38 178[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSKRKAPQET	LNGGITDMLT	ELANFEKNVS	QAIHKYNAYR	KAASVIAKYP
HKIKSGAEAK	KLPGVGTKIA	EKIDEFLATG	KLRKLEKIRQ	DDTSSSINFL
TRVSGIGPSA	ARKFVDEGIK	TLEDLRKNED	KLNHHQRIGL	KYFGDFEKRI
PREEMLQMQD	IVLNEVKKVD	SEYIATVCGS	FRRGAESSGD	MDVLLTHPSF
TSESTKQPKL	LHQVVEQLQK	VHFITDTLSK	GETKFMGVCQ	LPSKNDEKEY
PHRRIDIRLI	PKDQYYCGVL	YFTGSDIFNK	NMRAHALEKG	FTINEYTIRP
LGVTGVAGEP	LPVDSEKDIF	DYIQWKYREP	KDRSE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, ліаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, синтез ДНК, реплікація ДНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, ДНК, іоном магнію, іоном натрію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Bennett R.A., Wilson D.M. III, Wong D., Demple B. (1997). Interaction of human apurinic endonuclease and DNA polymerase beta in the base excision repair pathway.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 7166 — 7169. PubMed DOI:10.1073/pnas.94.14.7166
Matsumoto Y., Kim K., Katz D.S., Feng J.-A. (1998). Catalytic center of DNA polymerase beta for excision of deoxyribose phosphate groups.. Biochemistry 37: 6456 — 6464. PubMed DOI:10.1021/bi9727545
Pelletier H., Sawaya M.R., Wolfle W., Wilson S.H., Kraut J. (1996). A structural basis for metal ion mutagenicity and nucleotide selectivity in human DNA polymerase beta.. Biochemistry 35: 12762 — 12777. PubMed DOI:10.1021/bi9529566
Pelletier H., Sawaya M.R. (1996). Characterization of the metal ion binding helix-hairpin-helix motifs in human DNA polymerase beta by X-ray structural analysis.. Biochemistry 35: 12778 — 12787. PubMed DOI:10.1021/bi960790i
Sawaya M.R., Prasad R., Wilson S.H., Kraut J., Pelletier H. (1997). Crystal structures of human DNA polymerase beta complexed with gapped and nicked DNA: evidence for an induced fit mechanism.. Biochemistry 36: 11205 — 11215. PubMed DOI:10.1021/bi9703812

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9174 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
UniProt, P06746 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9174 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P06746 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.