POLR2A

POLR2A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2GHQ, 2GHT, 2LTO, 3D9K, 3D9L, 3D9M, 3D9N, 3D9O, 3D9P, 4JXT, 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
Ідентифікатори
Символи	POLR2A, POLR2, POLRA, RPB1, RPBh1, RPO2, RPOL2, RpIILS, hRPB220, hsRPB1, polymerase (RNA) II subunit A, RNA polymerase II subunit A, NEDHIB
Зовнішні ІД	OMIM: 180660 MGI: 98086 HomoloGene: 721 GeneCards: POLR2A
шифр КФ	2.7.7.48
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • DNA binding; • nucleotidyltransferase activity; • RNA polymerase II activity; • зв'язування з іоном металу; • RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity; • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity; • GO:0001948 protein binding; • ubiquitin protein ligase binding; • RNA binding; • protein C-terminus binding; • promoter-specific chromatin binding;
Клітинна компонента	• Prp19 complex; • Ядерце; • РНК-полімераза II; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • цитоплазма;
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome; • regulation of transcription, DNA-templated; • somatic stem cell population maintenance; • DNA-templated transcription, termination; • transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • 7-methylguanosine mRNA capping; • transcription by RNA polymerase II; • transcription, RNA-templated; • positive regulation of RNA splicing; • positive regulation of viral transcription; • transcription-coupled nucleotide-excision repair; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • snRNA transcription by RNA polymerase II; • fibroblast growth factor receptor signaling pathway; • transcription, DNA-templated; • RNA metabolic process; • regulation of gene silencing by miRNA;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5430
	20020
	ENSG00000284832; ENSG00000181222
	ENSMUSG00000005198
	P24928
	P08775
	NM_000937
	NM_009089; NM_001291068
	NP_000928
	NP_001277997
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

POLR2A (англ. RNA polymerase II subunit A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 970 амінокислот, а молекулярна маса — 217 176[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MHGGGPPSGD	SACPLRTIKR	VQFGVLSPDE	LKRMSVTEGG	IKYPETTEGG
RPKLGGLMDP	RQGVIERTGR	CQTCAGNMTE	CPGHFGHIEL	AKPVFHVGFL
VKTMKVLRCV	CFFCSKLLVD	SNNPKIKDIL	AKSKGQPKKR	LTHVYDLCKG
KNICEGGEEM	DNKFGVEQPE	GDEDLTKEKG	HGGCGRYQPR	IRRSGLELYA
EWKHVNEDSQ	EKKILLSPER	VHEIFKRISD	EECFVLGMEP	RYARPEWMIV
TVLPVPPLSV	RPAVVMQGSA	RNQDDLTHKL	ADIVKINNQL	RRNEQNGAAA
HVIAEDVKLL	QFHVATMVDN	ELPGLPRAMQ	KSGRPLKSLK	QRLKGKEGRV
RGNLMGKRVD	FSARTVITPD	PNLSIDQVGV	PRSIAANMTF	AEIVTPFNID
RLQELVRRGN	SQYPGAKYII	RDNGDRIDLR	FHPKPSDLHL	QTGYKVERHM
CDGDIVIFNR	QPTLHKMSMM	GHRVRILPWS	TFRLNLSVTT	PYNADFDGDE
MNLHLPQSLE	TRAEIQELAM	VPRMIVTPQS	NRPVMGIVQD	TLTAVRKFTK
RDVFLERGEV	MNLLMFLSTW	DGKVPQPAIL	KPRPLWTGKQ	IFSLIIPGHI
NCIRTHSTHP	DDEDSGPYKH	ISPGDTKVVV	ENGELIMGIL	CKKSLGTSAG
SLVHISYLEM	GHDITRLFYS	NIQTVINNWL	LIEGHTIGIG	DSIADSKTYQ
DIQNTIKKAK	QDVIEVIEKA	HNNELEPTPG	NTLRQTFENQ	VNRILNDARD
KTGSSAQKSL	SEYNNFKSMV	VSGAKGSKIN	ISQVIAVVGQ	QNVEGKRIPF
GFKHRTLPHF	IKDDYGPESR	GFVENSYLAG	LTPTEFFFHA	MGGREGLIDT
AVKTAETGYI	QRRLIKSMES	VMVKYDATVR	NSINQVVQLR	YGEDGLAGES
VEFQNLATLK	PSNKAFEKKF	RFDYTNERAL	RRTLQEDLVK	DVLSNAHIQN
ELEREFERMR	EDREVLRVIF	PTGDSKVVLP	CNLLRMIWNA	QKIFHINPRL
PSDLHPIKVV	EGVKELSKKL	VIVNGDDPLS	RQAQENATLL	FNIHLRSTLC
SRRMAEEFRL	SGEAFDWLLG	EIESKFNQAI	AHPGEMVGAL	AAQSLGEPAT
QMTLNTFHYA	GVSAKNVTLG	VPRLKELINI	SKKPKTPSLT	VFLLGQSARD
AERAKDILCR	LEHTTLRKVT	ANTAIYYDPN	PQSTVVAEDQ	EWVNVYYEMP
DFDVARISPW	LLRVELDRKH	MTDRKLTMEQ	IAEKINAGFG	DDLNCIFNDD
NAEKLVLRIR	IMNSDENKMQ	EEEEVVDKMD	DDVFLRCIES	NMLTDMTLQG
IEQISKVYMH	LPQTDNKKKI	IITEDGEFKA	LQEWILETDG	VSLMRVLSEK
DVDPVRTTSN	DIVEIFTVLG	IEAVRKALER	ELYHVISFDG	SYVNYRHLAL
LCDTMTCRGH	LMAITRHGVN	RQDTGPLMKC	SFEETVDVLM	EAAAHGESDP
MKGVSENIML	GQLAPAGTGC	FDLLLDAEKC	KYGMEIPTNI	PGLGAAGPTG
MFFGSAPSPM	GGISPAMTPW	NQGATPAYGA	WSPSVGSGMT	PGAAGFSPSA
ASDASGFSPG	YSPAWSPTPG	SPGSPGPSSP	YIPSPGGAMS	PSYSPTSPAY
EPRSPGGYTP	QSPSYSPTSP	SYSPTSPSYS	PTSPNYSPTS	PSYSPTSPSY
SPTSPSYSPT	SPSYSPTSPS	YSPTSPSYSP	TSPSYSPTSP	SYSPTSPSYS
PTSPSYSPTS	PSYSPTSPSY	SPTSPSYSPT	SPSYSPTSPS	YSPTSPNYSP
TSPNYTPTSP	SYSPTSPSYS	PTSPNYTPTS	PNYSPTSPSY	SPTSPSYSPT
SPSYSPSSPR	YTPQSPTYTP	SSPSYSPSSP	SYSPASPKYT	PTSPSYSPSS
PEYTPTSPKY	SPTSPKYSPT	SPKYSPTSPT	YSPTTPKYSP	TSPTYSPTSP
VYTPTSPKYS	PTSPTYSPTS	PKYSPTSPTY	SPTSPKGSTY	SPTSPGYSPT
SPTYSLTSPA	ISPDDSDEEN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Wintzerith M., Acker J., Vicaire S., Vigneron M., Kedinger C. (1992). Complete sequence of the human RNA polymerase II largest subunit.. Nucleic Acids Res. 20: 910 — 910. PubMed DOI:10.1093/nar/20.4.910
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes.. J. Biol. Chem. 273: 34444 — 34453. PubMed DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
Parada C.A., Roeder R.G. (1999). A novel RNA polymerase II-containing complex potentiates Tat-enhanced HIV-1 transcription.. EMBO J. 18: 3688 — 3701. PubMed DOI:10.1093/emboj/18.13.3688
Kim J.B., Yamaguchi Y., Wada T., Handa H., Sharp P.A. (1999). Tat-SF1 protein associates with RAP30 and human SPT5 proteins.. Mol. Cell. Biol. 19: 5960 — 5968. PubMed DOI:10.1128/MCB.19.9.5960
Allen M., Friedler A., Schon O., Bycroft M. (2002). The structure of an FF domain from human HYPA/FBP11.. J. Mol. Biol. 323: 411 — 416. PubMed DOI:10.1016/S0022-2836(02)00968-3

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9187 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P24928 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9187 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P24928 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.