POLR2E

POLR2E
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5IY6, 5IY9, 5IY8, 5IYA, 5IYB, 5IY7, 5IYC, 5IYD
Ідентифікатори
Символи	POLR2E, RPABC1, RPB5, XAP4, hRPB25, hsRPB5, polymerase (RNA) II subunit E, RNA polymerase II subunit E, RNA polymerase II, I and III subunit E
Зовнішні ІД	OMIM: 180664 MGI: 1913670 HomoloGene: 2018 GeneCards: POLR2E
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • RNA polymerase II activity; • RNA polymerase III activity; • GO:0001948 protein binding; • RNA polymerase I activity; • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • RNA polymerase I complex; • RNA polymerase III complex; • РНК-полімераза II; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма;
Біологічний процес	• termination of RNA polymerase I transcription; • mRNA splicing, via spliceosome; • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation; • transcription initiation from RNA polymerase I promoter; • transcription elongation from RNA polymerase II promoter; • 7-methylguanosine mRNA capping; • transcription by RNA polymerase II; • transcription-coupled nucleotide-excision repair; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • GO:0022415 viral process; • transcription by RNA polymerase III; • fibroblast growth factor receptor signaling pathway; • snRNA transcription by RNA polymerase II; • RNA metabolic process; • regulation of gene silencing by miRNA; • transcription, DNA-templated; • transcription elongation from RNA polymerase I promoter; • positive regulation of type I interferon production; • somatic stem cell population maintenance; • positive regulation of viral transcription;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5434
	66420
	ENSG00000099817
	ENSMUSG00000004667
	P19388
	Q80UW8
	NM_002695; NM_001316323; NM_001316324
	NM_025554
	NP_001303252; NP_001303253; NP_002686
	NP_079830
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

POLR2E (англ. RNA polymerase II subunit E) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 210 амінокислот, а молекулярна маса — 24 551[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDDEEETYRL	WKIRKTIMQL	CHDRGYLVTQ	DELDQTLEEF	KAQSGDKPSE
GRPRRTDLTV	LVAHNDDPTD	QMFVFFPEEP	KVGIKTIKVY	CQRMQEENIT
RALIVVQQGM	TPSAKQSLVD	MAPKYILEQF	LQQELLINIT	EHELVPEHVV
MTKEEVTELL	ARYKLRENQL	PRIQAGDPVA	RYFGIKRGQV	VKIIRPSETA
GRYITYRLVQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes.. J. Biol. Chem. 273: 34444 — 34453. PubMed DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
Pati U.K., Weissman S.M. (1989). Isolation and molecular characterization of a cDNA encoding the 23-kDa subunit of human RNA polymerase II.. J. Biol. Chem. 264: 13114 — 13121. PubMed
Pati U.K., Weissman S.M. (1991). J. Biol. Chem. 266: 13468 — 13468. PubMed
Cheong J.H., Yi M., Lin Y., Murakami S. (1995). Human RPB5, a subunit shared by eukaryotic nuclear RNA polymerases, binds human hepatitis B virus X protein and may play a role in X transactivation.. EMBO J. 14: 143 — 150. PubMed

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9192 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P19388 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9192 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P19388 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.