PRPF6
PRPF6 (англ. Pre-mRNA processing factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 941 амінокислот, а молекулярна маса — 106 925[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MNKKKKPFLG | MPAPLGYVPG | LGRGATGFTT | RSDIGPARDA | NDPVDDRHAP | ||||
| PGKRTVGDQM | KKNQAADDDD | EDLNDTNYDE | FNGYAGSLFS | SGPYEKDDEE | ||||
| ADAIYAALDK | RMDERRKERR | EQREKEEIEK | YRMERPKIQQ | QFSDLKRKLA | ||||
| EVTEEEWLSI | PEVGDARNKR | QRNPRYEKLT | PVPDSFFAKH | LQTGENHTSV | ||||
| DPRQTQFGGL | NTPYPGGLNT | PYPGGMTPGL | MTPGTGELDM | RKIGQARNTL | ||||
| MDMRLSQVSD | SVSGQTVVDP | KGYLTDLNSM | IPTHGGDIND | IKKARLLLKS | ||||
| VRETNPHHPP | AWIASARLEE | VTGKLQVARN | LIMKGTEMCP | KSEDVWLEAA | ||||
| RLQPGDTAKA | VVAQAVRHLP | QSVRIYIRAA | ELETDIRAKK | RVLRKALEHV | ||||
| PNSVRLWKAA | VELEEPEDAR | IMLSRAVECC | PTSVELWLAL | ARLETYENAR | ||||
| KVLNKARENI | PTDRHIWITA | AKLEEANGNT | QMVEKIIDRA | ITSLRANGVE | ||||
| INREQWIQDA | EECDRAGSVA | TCQAVMRAVI | GIGIEEEDRK | HTWMEDADSC | ||||
| VAHNALECAR | AIYAYALQVF | PSKKSVWLRA | AYFEKNHGTR | ESLEALLQRA | ||||
| VAHCPKAEVL | WLMGAKSKWL | AGDVPAARSI | LALAFQANPN | SEEIWLAAVK | ||||
| LESENDEYER | ARRLLAKARS | SAPTARVFMK | SVKLEWVQDN | IRAAQDLCEE | ||||
| ALRHYEDFPK | LWMMKGQIEE | QKEMMEKARE | AYNQGLKKCP | HSTPLWLLLS | ||||
| RLEEKIGQLT | RARAILEKSR | LKNPKNPGLW | LESVRLEYRA | GLKNIANTLM | ||||
| AKALQECPNS | GILWSEAIFL | EARPQRRTKS | VDALKKCEHD | PHVLLAVAKL | ||||
| FWSQRKITKA | REWFHRTVKI | DSDLGDAWAF | FYKFELQHGT | EEQQEEVRKR | ||||
| CESAEPRHGE | LWCAVSKDIA | NWQKKIGDIL | RLVAGRIKNT | F |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.
Література
- Nishikimi A., Mukai J., Kioka N., Yamada M. (1999). A novel mammalian nuclear protein similar to Schizosaccharomyces pombe Prp1p/Zer1p and Saccharomyces cerevisiae Prp6p pre-mRNA splicing factors.. Biochim. Biophys. Acta 1435: 147 — 152. PubMed DOI:10.1016/S0167-4838(99)00203-4
- Makarov E.M., Makarova O.V., Achsel T., Luehrmann R. (2000). The human homologue of the yeast splicing factor Prp6p contains multiple TPR elements and is stably associated with the U5 snRNP via protein-protein interactions.. J. Mol. Biol. 298: 567 — 575. PubMed DOI:10.1006/jmbi.2000.3685
- Yuryev A., Ono M., Goff S.A., Macaluso F., Wennogle L.P. (2000). Isoform-specific localization of A-RAF in mitochondria.. Mol. Cell. Biol. 20: 4870 — 4878. PubMed DOI:10.1128/MCB.20.13.4870-4878.2000
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis.. RNA 8: 426 — 439. PubMed DOI:10.1017/S1355838202021088
- Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP.. RNA 12: 1418 — 1430. PubMed DOI:10.1261/rna.55406
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з PRPF6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15860 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
- UniProt, O94906 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.