RARA

RARA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1DKF, 1DSZ, 3A9E, 3KMR, 3KMZ, 4DQM, 5K13
Ідентифікатори
Символи	RARA, NR1B1, RAR, retinoic acid receptor alpha, RARalpha
Зовнішні ІД	OMIM: 180240 MGI: 97856 HomoloGene: 20262 GeneCards: RARA
Реагує на сполуку
	adapalene, alitretinoin, tamibarotene, tazarotene, Третиноїн[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• retinoic acid binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • protein domain specific binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity; • mRNA 5'-UTR binding; • signaling receptor binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • retinoic acid-responsive element binding; • transcription factor binding; • зв'язування з іоном металу; • steroid hormone receptor activity; • enzyme binding; • zinc ion binding; • GO:0001948 protein binding; • DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • protein kinase A binding; • protein kinase B binding; • translation repressor activity, mRNA regulatory element binding; • alpha-actinin binding; • protein heterodimerization activity; • chromatin DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • histone deacetylase binding; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • nuclear receptor coactivator activity; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • actin cytoskeleton; • perinuclear region of cytoplasm; • neuron projection; • клітинне ядро; • cell surface; • Нуклеоплазма; • neuronal cell body; • Дендрит (нейробіологія); • гіалоплазма; • RNA polymerase II transcription regulator complex;
Біологічний процес	• growth plate cartilage development; • germ cell development; • cellular response to retinoic acid; • ureteric bud development; • positive regulation of interleukin-5 production; • prostate gland development; • limb development; • apoptotic cell clearance; • chondroblast differentiation; • regulation of granulocyte differentiation; • protein phosphorylation; • response to vitamin A; • face development; • Сперматогенез; • response to ethanol; • negative regulation of cell population proliferation; • steroid hormone mediated signaling pathway; • regulation of apoptotic process; • response to cytokine; • negative regulation of translation; • regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of cell differentiation; • negative regulation of gene expression; • transcription, DNA-templated; • cellular response to estrogen stimulus; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of cell cycle; • regulation of myelination; • positive regulation of neuron differentiation; • negative regulation of tumor necrosis factor production; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • trachea cartilage development; • glandular epithelial cell development; • male gonad development; • negative regulation of cartilage development; • response to retinoic acid; • negative regulation of granulocyte differentiation; • multicellular organism growth; • female pregnancy; • negative regulation of apoptotic process; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of interleukin-4 production; • regulation of synaptic plasticity; • outflow tract septum morphogenesis; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of interferon-gamma production; • response to estradiol; • negative regulation of translational initiation; • embryonic camera-type eye development; • positive regulation of interleukin-13 production; • neural tube closure; • positive regulation of binding; • retinoic acid receptor signaling pathway; • positive regulation of gene expression; • Sertoli cell fate commitment; • positive regulation of cell population proliferation; • positive regulation of T-helper 2 cell differentiation; • ventricular cardiac muscle cell differentiation; • liver development; • cellular response to lipopolysaccharide; • bone development; • hippocampus development; • Сигнальна трансдукція; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • multicellular organism development; • hormone-mediated signaling pathway; • Диференціація клітин; • response to lipid; • gland development; • bone morphogenesis; • epithelium development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5914
	19401
	ENSG00000131759
	ENSMUSG00000037992
	P10276; Q6I9R7
	P11416
	NM_000964; NM_001024809; NM_001033603; NM_001145301; NM_001145302
	NM_001176528; NM_001177302; NM_001177303; NM_009024; NM_001361954
NP_000955; NP_001019980; NP_001138773; NP_001138774; NP_000955.1;
	NP_001138773.1
	NP_001169999; NP_001170773; NP_001170774; NP_033050; NP_001348883
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RARA (англ. Retinoic acid receptor alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 462 амінокислот, а молекулярна маса — 50 771[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASNSSSCPT	PGGGHLNGYP	VPPYAFFFPP	MLGGLSPPGA	LTTLQHQLPV
SGYSTPSPAT	IETQSSSSEE	IVPSPPSPPP	LPRIYKPCFV	CQDKSSGYHY
GVSACEGCKG	FFRRSIQKNM	VYTCHRDKNC	IINKVTRNRC	QYCRLQKCFE
VGMSKESVRN	DRNKKKKEVP	KPECSESYTL	TPEVGELIEK	VRKAHQETFP
ALCQLGKYTT	NNSSEQRVSL	DIDLWDKFSE	LSTKCIIKTV	EFAKQLPGFT
TLTIADQITL	LKAACLDILI	LRICTRYTPE	QDTMTFSDGL	TLNRTQMHNA
GFGPLTDLVF	AFANQLLPLE	MDDAETGLLS	AICLICGDRQ	DLEQPDRVDM
LQEPLLEALK	VYVRKRRPSR	PHMFPKMLMK	ITDLRSISAK	GAERVITLKM
EIPGSMPPLI	QEMLENSEGL	DTLSGQPGGG	GRDGGGLAPP	PGSCSPSLSP
SSNRSSPATH	SP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Giguere V., Ong E.S., Segui P., Evans R.M. (1987). Identification of a receptor for the morphogen retinoic acid.. Nature 330: 624 — 629. PubMed DOI:10.1038/330624a0
Hjalt T.A.H., Murray J.C. (1999). Genomic structure of the human retinoic acid receptor-alpha1 gene.. Mamm. Genome 10: 528 — 529. PubMed DOI:10.1007/s003359901036
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Brand N.J., Petkovich M., Chambon P. (1990). Characterization of a functional promoter for the human retinoic acid receptor-alpha (hRAR-alpha).. Nucleic Acids Res. 18: 6799 — 6806. PubMed DOI:10.1093/nar/18.23.6799
Petkovich M., Brand N.J., Krust A., Chambon P. (1987). A human retinoic acid receptor which belongs to the family of nuclear receptors.. Nature 330: 444 — 450. PubMed DOI:10.1038/330444a0
Shao W., Halachmi S., Brown M. (2002). ERAP140, a conserved tissue-specific nuclear receptor coactivator.. Mol. Cell. Biol. 22: 3358 — 3372. PubMed DOI:10.1128/MCB.22.10.3358-3372.2002

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з Retinoic acid receptor alpha переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9864 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P10276 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Retinoic acid receptor alpha переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9864 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P10276 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.