RARG

RARG
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1EXA, 1EXX, 1FCX, 1FCY, 1FCZ, 1FD0, 2LBD, 3LBD, 4LBD
Ідентифікатори
Символи	RARG, NR1B3, RARC, retinoic acid receptor gamma, RARgamma
Зовнішні ІД	OMIM: 180190 MGI: 97858 HomoloGene: 20263 GeneCards: RARG
Реагує на сполуку
	adapalene, alitretinoin, palovarotene, tamibarotene, tazarotene, третиноїн[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • steroid hormone receptor activity; • GO:0001948 protein binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • DNA binding; • retinoid X receptor binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • transcription factor binding; • nuclear receptor coactivator activity; • signaling receptor activity; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • Нуклеоплазма; • клітинне ядро; • transcription regulator complex; • RNA polymerase II transcription regulator complex;
Біологічний процес	• regulation of cell size; • growth plate cartilage development; • cellular response to retinoic acid; • gland development; • regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of cartilage development; • response to retinoic acid; • multicellular organism growth; • negative regulation of cell differentiation; • bone morphogenesis; • chondrocyte development; • negative regulation of apoptotic process; • retinal pigment epithelium development; • transcription, DNA-templated; • epithelium development; • embryonic camera-type eye development; • reproductive structure development; • limb development; • face development; • neural tube closure; • negative regulation of chondrocyte differentiation; • Harderian gland development; • prostate gland epithelium morphogenesis; • regulation of myelination; • positive regulation of gene expression; • retina development in camera-type eye; • positive regulation of cell population proliferation; • growth plate cartilage chondrocyte growth; • canonical Wnt signaling pathway; • Регуляція експресії генів; • camera-type eye development; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • regulation of myeloid cell differentiation; • bone development; • trachea cartilage development; • anterior/posterior pattern specification; • glandular epithelial cell development; • steroid hormone mediated signaling pathway; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • embryonic hindlimb morphogenesis; • retinoic acid receptor signaling pathway; • negative regulation of cell population proliferation; • embryonic eye morphogenesis; • positive regulation of apoptotic process; • positive regulation of programmed cell death; • cellular response to leukemia inhibitory factor; • multicellular organism development; • hormone-mediated signaling pathway; • Диференціація клітин; • response to lipid;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	5916
	19411
	ENSG00000172819
	ENSMUSG00000001288
	P13631
	P18911
	NM_000966; NM_001042728; NM_001243730; NM_001243731; NM_001243732
	NM_001042727; NM_011244
	NP_000957; NP_001036193; NP_001230659; NP_001230660; NP_001230661
	NP_001036192; NP_035374
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RARG (англ. Retinoic acid receptor gamma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 454 амінокислот, а молекулярна маса — 50 342[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATNKERLFA	AGALGPGSGY	PGAGFPFAFP	GALRGSPPFE	MLSPSFRGLG
QPDLPKEMAS	LSVETQSTSS	EEMVPSSPSP	PPPPRVYKPC	FVCNDKSSGY
HYGVSSCEGC	KGFFRRSIQK	NMVYTCHRDK	NCIINKVTRN	RCQYCRLQKC
FEVGMSKEAV	RNDRNKKKKE	VKEEGSPDSY	ELSPQLEELI	TKVSKAHQET
FPSLCQLGKY	TTNSSADHRV	QLDLGLWDKF	SELATKCIIK	IVEFAKRLPG
FTGLSIADQI	TLLKAACLDI	LMLRICTRYT	PEQDTMTFSD	GLTLNRTQMH
NAGFGPLTDL	VFAFAGQLLP	LEMDDTETGL	LSAICLICGD	RMDLEEPEKV
DKLQEPLLEA	LRLYARRRRP	SQPYMFPRML	MKITDLRGIS	TKGAERAITL
KMEIPGPMPP	LIREMLENPE	MFEDDSSQPG	PHPNASSEDE	VPGGQGKGGL
KSPA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Krust A., Kastner P., Petkovich M., Zelent A., Chambon P. (1989). A third human retinoic acid receptor, hRAR-gamma.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 5310 — 5314. PubMed DOI:10.1073/pnas.86.14.5310
Lehmann J.M., Hoffmann B., Pfahl M. (1991). Genomic organization of the retinoic acid receptor gamma gene.. Nucleic Acids Res. 19: 573 — 578. PubMed DOI:10.1093/nar/19.3.573
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Lehmann J.M., Zhang X.K., Pfahl M. (1992). RAR-gamma-2 expression is regulated through a retinoic acid response element embedded in Sp1 sites.. Mol. Cell. Biol. 12: 2976 — 2985. PubMed DOI:10.1128/MCB.12.7.2976

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з Retinoic acid receptor gamma переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9866 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P13631 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Retinoic acid receptor gamma переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9866 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P13631 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.