S100A9

S100A9
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1IRJ, 1XK4, 4GGF, 4XJK
Ідентифікатори
Символи	S100A9, 60B8AG, CAGB, CFAG, CGLB, L1AG, LIAG, MAC387, MIF, MRP14, NIF, P14, S100 calcium binding protein A9, S100-A9
Зовнішні ІД	OMIM: 123886 MGI: 1338947 HomoloGene: 2227 GeneCards: S100A9
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • microtubule binding; • zinc ion binding; • signal transducer activity; • зв'язування з іоном металу; • Toll-like receptor 4 binding; • antioxidant activity; • GO:0001948 protein binding; • RAGE receptor binding; • arachidonic acid binding;
Клітинна компонента	• мембрана; • клітинна мембрана; • Екзосома; • Цитоскелет; • клітинне ядро; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • extracellular space; • Нуклеоплазма; • гіалоплазма; • Міжклітинні контакти; • secretory granule lumen; • цитоплазма; • extracellular region; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• peptidyl-cysteine S-trans-nitrosylation; • positive regulation of inflammatory response; • chemokine production; • immune system process; • cellular oxidant detoxification; • cell-cell signaling; • cytokine production; • leukocyte migration involved in inflammatory response; • neutrophil chemotaxis; • defense response to fungus; • хемотаксис; • sequestering of zinc ion; • neutrophil aggregation; • positive regulation of cell growth; • defense response to bacterium; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • regulation of inflammatory response; • Вроджений імунітет; • inflammatory response; • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway; • regulation of cytoskeleton organization; • Апоптоз; • Автофагія; • toll-like receptor signaling pathway; • antimicrobial humoral response; • neutrophil degranulation; • positive regulation of neuron projection development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6280
	20202
	ENSG00000163220
	ENSMUSG00000056071
	P06702
	P31725
	NM_002965
	NM_001281852; NM_009114
	NP_002956
	NP_001268781; NP_033140
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

S100A9 (англ. S100 calcium binding protein A9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 114 амінокислот, а молекулярна маса — 13 242[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTCKMSQLER	NIETIINTFH	QYSVKLGHPD	TLNQGEFKEL	VRKDLQNFLK
KENKNEKVIE	HIMEDLDTNA	DKQLSFEEFI	MLMARLTWAS	HEKMHEGDEG
PGHHHKPGLG	EGTP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антиоксидантів, антимікробних білків. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, хемотаксис, автофагія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Lagasse E., Clerc R.G. (1988). Cloning and expression of two human genes encoding calcium-binding proteins that are regulated during myeloid differentiation.. Mol. Cell. Biol. 8: 2402 — 2410. PubMed DOI:10.1128/MCB.8.6.2402
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Edgeworth J., Freemont P., Hogg N. (1989). Ionomycin-regulated phosphorylation of the myeloid calcium-binding protein p14.. Nature 342: 189 — 192. PubMed DOI:10.1038/342189a0
Tobe T., Murakami K., Tomita M., Nozawa R. (1989). Amino acid sequences of 60B8 antigens induced in HL-60 cells by 1,25-dihydroxyvitamin D3. The antigens are identical with macrophage-related protein-14 and -8.. Chem. Pharm. Bull. 37: 1576 — 1580. PubMed DOI:10.1248/cpb.37.1576
Miyasaki K.T., Bodeau A.L., Murthy A.R., Lehrer R.I. (1993). In vitro antimicrobial activity of the human neutrophil cytosolic S-100 protein complex, calprotectin, against Capnocytophaga sputigena.. J. Dent. Res. 72: 517 — 523. PubMed DOI:10.1177/00220345930720020801
Ryckman C., Vandal K., Rouleau P., Talbot M., Tessier P.A. (2003). Proinflammatory activities of S100: proteins S100A8, S100A9, and S100A8/A9 induce neutrophil chemotaxis and adhesion.. J. Immunol. 170: 3233 — 3242. PubMed DOI:10.4049/jimmunol.170.6.3233

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10499 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.
UniProt, P06702 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 1

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10499 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.

[UniProt-4] UniProt, P06702 (англ.). Процитовано 6 лютого 2017.