SARM1

SARM1 (англ. Sterile alpha and TIR motif containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 724 амінокислот, а молекулярна маса — 79 388[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MVLTLLLSAYKLCRFFAMSGPRPGAERLAVPGPDGGGGTGPWWAAGGRGP
REVSPGAGTEVQDALERALPELQQALSALKQAGGARAVGAGLAEVFQLVE
EAWLLPAVGREVAQGLCDAIRLDGGLDLLLRLLQAPELETRVQAARLLEQ
ILVAENRDRVARIGLGVILNLAKEREPVELARSVAGILEHMFKHSEETCQ
RLVAAGGLDAVLYWCRRTDPALLRHCALALGNCALHGGQAVQRRMVEKRA
AEWLFPLAFSKEDELLRLHACLAVAVLATNKEVEREVERSGTLALVEPLV
ASLDPGRFARCLVDASDTSQGRGPDDLQRLVPLLDSNRLEAQCIGAFYLC
AEAAIKSLQGKTKVFSDIGAIQSLKRLVSYSTNGTKSALAKRALRLLGEE
VPRPILPSVPSWKEAEVQTWLQQIGFSKYCESFREQQVDGDLLLRLTEEE
LQTDLGMKSGITRKRFFRELTELKTFANYSTCDRSNLADWLGSLDPRFRQ
YTYGLVSCGLDRSLLHRVSEQQLLEDCGIHLGVHRARILTAAREMLHSPL
PCTGGKPSGDTPDVFISYRRNSGSQLASLLKVHLQLHGFSVFIDVEKLEA
GKFEDKLIQSVMGARNFVLVLSPGALDKCMQDHDCKDWVHKEIVTALSCG
KNIVPIIDGFEWPEPQVLPEDMQAVLTFNGIKWSHEYQEATIEKIIRFLQ
GRSSRDSSAGSDTSLEGAAPMGPT
SARM1
Ідентифікатори
Символи SARM1, MyD88-5, SAMD2, SARM, sterile alpha and TIR motif containing 1, hHsTIR
Зовнішні ІД OMIM: 607732 MGI: 2136419 HomoloGene: 9015 GeneCards: SARM1
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
23098
237868
Ensembl
ENSG00000004139
ENSMUSG00000050132
UniProt
Q6SZW1
Q0D2N8
Q6PDS3
RefSeq (мРНК)
NM_015077
NM_001168521
NM_172795
RefSeq (білок)
NP_055892
NP_055892.2
NP_001161993
NP_766383
Локус (UCSC) Хр. 17: 28.36 – 28.4 Mb Хр. 11: 78.47 – 78.5 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мітохондрії, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.

Література

  • Mink M., Fogelgren B., Olszewski K., Maroy P., Csiszar K. (2001). A novel human gene (SARM) at chromosome 17q11 encodes a protein with a SAM motif and structural similarity to Armadillo/beta-catenin that is conserved in mouse, Drosophila, and Caenorhabditis elegans.. Genomics 74: 234 — 244. PubMed DOI:10.1006/geno.2001.6548
  • O'Neill L.A.J. (2006). DisSARMing Toll-like receptor signaling.. Nat. Immunol. 7: 1023 — 1025. PubMed DOI:10.1038/ni1006-1023
  • Dalod M. (2007). Studies of SARM1 uncover similarities between immune and neuronal responses to danger.. Sci. STKE 2007: PE73 — PE73. PubMed DOI:10.1126/stke.4172007pe73
  • Panneerselvam P., Singh L.P., Ho B., Chen J., Ding J.L. (2012). Targeting of pro-apoptotic TLR adaptor SARM to mitochondria: definition of the critical region and residues in the signal sequence.. Biochem. J. 442: 263 — 271. PubMed DOI:10.1042/BJ20111653

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17074 (англ.). Процитовано 21 вересня 2017.
  4. UniProt, Q6SZW1 (англ.). Процитовано 21 вересня 2017.

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.