SCD

SCD (англ. Stearoyl-CoA desaturase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 359 амінокислот, а молекулярна маса — 41 523[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MPAHLLQDDISSSYTTTTTITAPPSRVLQNGGDKLETMPLYLEDDIRPDI
KDDIYDPTYKDKEGPSPKVEYVWRNIILMSLLHLGALYGITLIPTCKFYT
WLWGVFYYFVSALGITAGAHRLWSHRSYKARLPLRLFLIIANTMAFQNDV
YEWARDHRAHHKFSETHADPHNSRRGFFFSHVGWLLVRKHPAVKEKGSTL
DLSDLEAEKLVMFQRRYYKPGLLMMCFILPTLVPWYFWGETFQNSVFVAT
FLRYAVVLNATWLVNSAAHLFGYRPYDKNISPRENILVSLGAVGEGFHNY
HHSFPYDYSASEYRWHINFTTFFIDCMAALGLAYDRKKVSKAAILARIKR
TGDGNYKSG
SCD
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи SCD, FADS5, MSTP008, SCD1, SCDOS, hSCD1, stearoyl-CoA desaturase (delta-9-desaturase), stearoyl-CoA desaturase
Зовнішні ІД OMIM: 604031 MGI: 98239 HomoloGene: 74538 GeneCards: SCD
Реагує на сполуку
CD33[1]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6319
20249
Ensembl
ENSG00000099194
ENSMUSG00000037071
UniProt
O00767
P13516
RefSeq (мРНК)
NM_005063
NM_009127
RefSeq (білок)
NP_005054
NP_033153
Локус (UCSC) Хр. 10: 100.35 – 100.36 Mb Хр. 19: 44.39 – 44.41 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм жирних кислот, метаболізм ліпідів, біосинтез жирних кислот, біосинтез ліпідів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

  • Zhang L., Ge L., Parimoo S., Stenn K., Prouty S.M. (1999). Human stearoyl-CoA desaturase: alternative transcripts generated from a single gene by usage of tandem polyadenylation sites.. Biochem. J. 340: 255 — 264. PubMed DOI:10.1042/bj3400255
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Zhang L., Ge L., Tran T., Stenn K., Prouty S.M. (2001). Isolation and characterization of the human stearoyl-CoA desaturase gene promoter: requirement of a conserved CCAAT cis-element.. Biochem. J. 357: 183 — 193. PubMed DOI:10.1042/0264-6021:3570183
  • Xu G., Shin S.B., Jaffrey S.R. (2009). Global profiling of protease cleavage sites by chemoselective labeling of protein N-termini.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106: 19310 — 19315. PubMed DOI:10.1073/pnas.0908958106
  • Zhang S., Yang Y., Shi Y. (2005). Characterization of human SCD2, an oligomeric desaturase with improved stability and enzyme activity by cross-linking in intact cells.. Biochem. J. 388: 135 — 142. PubMed DOI:10.1042/BJ20041554
  • Goren M.A., Fox B.G. (2008). Wheat germ cell-free translation, purification, and assembly of a functional human stearoyl-CoA desaturase complex.. Protein Expr. Purif. 62: 171 — 178. PubMed DOI:10.1016/j.pep.2008.08.002

Примітки

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.