SMC5

SMC5 (англ. Structural maintenance of chromosomes 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 101 амінокислот, а молекулярна маса — 128 806[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MATPSKKTSTPSPQPSKRALPRDPSSEVPSKRKNSAPQLPLLQSSGPFVE
GSIVRISMENFLTYDICEVSPGPHLNMIVGANGTGKSSIVCAICLGLAGK
PAFMGRADKVGFFVKRGCSRGMVEIELFRASGNLVITREIDVAKNQSFWF
INKKSTTQKIVEEKVAALNIQVGNLCQFLPQDKVGEFAKLSKIELLEATE
KSIGPPEMHKYHCELKNLREKEKQLETSCKEKTEYLQKMVQRNERYKQDV
ERFYERKRHLDLIEMLEAKRPWVEYENVRQEYEEVKLVRDRVKEEVRKLK
EGQIPVTCRIEEMENERHNLEARIKEKATDIKEASQKCKQKQDVIERKDK
HIEELQQALIVKQNEELDRQRRIGNTRKMIEDLQNELKTTENCENLQPQI
DAITNDLRRIQDEKALCEGEIIDKRRERETLEKEKKSVDDHIVRFDNLMN
QKEDKLRQRFRDTYDAVLWLRNNRDKFKQRVCEPIMLTINMKDNKNAKYI
ENHIPSNDLRAFVFESQEDMEVFLKEVRDNKKLRVNAVIAPKSSYADKAP
SRSLNELKQYGFFSYLRELFDAPDPVMSYLCCQYHIHEVPVGTEKTRERI
ERVIQETRLKQIYTAEEKYVVKTSFYSNKVISSNTSLKVAQFLTVTVDLE
QRRHLEEQLKEIHRKLQAVDSGLIALRETSKHLEHKDNELRQKKKELLER
KTKKRQLEQKISSKLGSLKLMEQDTCNLEEEERKASTKIKEINVQKAKLV
TELTNLIKICTSLHIQKVDLILQNTTVISEKNKLESDYMAASSQLRLTEQ
HFIELDENRQRLLQKCKELMKRARQVCNLGAEQTLPQEYQTQVPTIPNGH
NSSLPMVFQDLPNTLDEIDALLTEERSRASCFTGLNPTIVQEYTKREEEI
EQLTEELKGKKVELDQYRENISQVKERWLNPLKELVEKINEKFSNFFSSM
QCAGEVDLHTENEEDYDKYGIRIRVKFRSSTQLHELTPHHQSGGERSVST
MLYLMALQELNRCPFRVVDEINQGMDPINERRVFEMVVNTACKENTSQYF
FITPKLLQNLPYSEKMTVLFVYNGPHMLEPNTWNLKAFQRRRRRITFTQP
S
SMC5
Ідентифікатори
Символи SMC5, SMC5L1, structural maintenance of chromosomes 5
Зовнішні ІД OMIM: 609386 MGI: 2385088 HomoloGene: 41009 GeneCards: SMC5
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
23137
226026
Ensembl
ENSG00000198887
ENSMUSG00000024943
UniProt
Q8IY18
Q8CG46
RefSeq (мРНК)
NM_015110
NM_001252684
NM_001252685
NM_153808
RefSeq (білок)
NP_055925
NP_001239613
NP_001239614
NP_722503
Локус (UCSC) Хр. 9: 70.26 – 70.35 Mb Хр. 19: 23.21 – 23.27 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз, рекомбінація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Potts P.R., Yu H. (2005). Human MMS21/NSE2 is a SUMO ligase required for DNA repair.. Mol. Cell. Biol. 25: 7021 — 7032. PubMed DOI:10.1128/MCB.25.16.7021-7032.2005
  • Potts P.R., Porteus M.H., Yu H. (2006). Human SMC5/6 complex promotes sister chromatid homologous recombination by recruiting the SMC1/3 cohesin complex to double-strand breaks.. EMBO J. 25: 3377 — 3388. PubMed DOI:10.1038/sj.emboj.7601218
  • Potts P.R., Yu H. (2007). The SMC5/6 complex maintains telomere length in ALT cancer cells through SUMOylation of telomere-binding proteins.. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 581 — 590. PubMed DOI:10.1038/nsmb1259
  • Taylor E.M., Copsey A.C., Hudson J.J., Vidot S., Lehmann A.R. (2008). Identification of the proteins, including MAGEG1, that make up the human SMC5-6 protein complex.. Mol. Cell. Biol. 28: 1197 — 1206. PubMed DOI:10.1128/MCB.00767-07
  • Behlke-Steinert S., Touat-Todeschini L., Skoufias D.A., Margolis R.L. (2009). SMC5 and MMS21 are required for chromosome cohesion and mitotic progression.. Cell Cycle 8: 2211 — 2218. PubMed DOI:10.4161/cc.8.14.8979

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20465 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
  4. UniProt, Q8IY18 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.