SS18L1

SS18L1
Ідентифікатори
Символи	SS18L1, CREST, LP2261, nBAF chromatin remodeling complex subunit, SS18L1 subunit of BAF chromatin remodeling complex, SMARCL2
Зовнішні ІД	OMIM: 606472 MGI: 2444061 HomoloGene: 9191 GeneCards: SS18L1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity;
Клітинна компонента	• nBAF complex; • Ядерні тільця; • центромера; • Кінетохор; • хромосома; • клітинне ядро; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• positive regulation of transcription, DNA-templated; • dendrite development; • positive regulation of dendrite morphogenesis; • regulation of dendrite development; • regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • chromatin organization; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	26039
	269397
	ENSG00000184402
	ENSMUSG00000039086
	O75177
	Q8BW22
	NM_001301778; NM_015558; NM_198935
	NM_178750
	NP_001288707; NP_945173
	NP_848865
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SS18L1 (англ. SS18L1, nBAF chromatin remodeling complex subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 396 амінокислот, а молекулярна маса — 42 990[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSVAFASARP	RGKGEVTQQT	IQKMLDENHH	LIQCILEYQS	KGKTAECTQY
QQILHRNLVY	LATIADSNQN	MQSLLPAPPT	QNMNLGPGAL	TQSGSSQGLH
SQGSLSDAIS	TGLPPSSLLQ	GQIGNGPSHV	SMQQTAPNTL	PTTSMSISGP
GYSHAGPASQ	GVPMQGQGTI	GNYVSRTNIN	MQSNPVSMMQ	QQAATSHYSS
AQGGSQHYQG	QSSIAMMGQG	SQGSSMMGQR	PMAPYRPSQQ	GSSQQYLGQE
EYYGEQYSHS	QGAAEPMGQQ	YYPDGHGDYA	YQQSSYTEQS	YDRSFEESTQ
HYYEGGNSQY	SQQQAGYQQG	AAQQQTYSQQ	QYPSQQSYPG	QQQGYGSAQG
APSQYPGYQQ	GQGQQYGSYR	APQTAPSAQQ	QRPYGYEQGQ	YGNYQQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах, кінетохорі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15592 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, O75177 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15592 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O75177 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.