STAT6

STAT6
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1OJ5, 4Y5W, 4Y5U
Ідентифікатори
Символи	STAT6, D12S1644, IL-4-STAT, STAT6B, STAT6C, signal transducer and activator of transcription 6
Зовнішні ІД	OMIM: 601512 MGI: 103034 HomoloGene: 2373 GeneCards: STAT6
Пов'язані генетичні захворювання
	eosinophilic esophagitis[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• identical protein binding; • sequence-specific DNA binding; • protein phosphatase binding; • DNA binding; • GO:0001948 protein binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • membrane raft; • цитоплазма; • гіалоплазма; • Ядерна мембрана;
Біологічний процес	• regulation of transcription by RNA polymerase II; • T-helper 1 cell lineage commitment; • regulation of cell population proliferation; • response to cytokine; • interleukin-4-mediated signaling pathway; • regulation of transcription, DNA-templated; • cellular response to hydrogen peroxide; • mammary gland epithelial cell proliferation; • cellular response to reactive nitrogen species; • positive regulation of type I interferon production; • positive regulation of isotype switching to IgE isotypes; • mammary gland morphogenesis; • negative regulation of type 2 immune response; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • Сигнальна трансдукція; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • cytokine-mediated signaling pathway; • positive regulation of cold-induced thermogenesis; • defense response; • receptor signaling pathway via JAK-STAT; • response to peptide hormone; • growth hormone receptor signaling pathway via JAK-STAT;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	6778
	20852
	ENSG00000166888
	ENSMUSG00000002147
	P42226
	P52633
	NM_001178078; NM_001178079; NM_001178080; NM_001178081; NM_003153
	NM_009284
	NP_001171549; NP_001171550; NP_001171551; NP_001171552; NP_003144
	NP_033310
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

STAT6 (англ. Signal transducer and activator of transcription 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 847 амінокислот, а молекулярна маса — 94 135[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLWGLVSKM	PPEKVQRLYV	DFPQHLRHLL	GDWLESQPWE	FLVGSDAFCC
NLASALLSDT	VQHLQASVGE	QGEGSTILQH	ISTLESIYQR	DPLKLVATFR
QILQGEKKAV	MEQFRHLPMP	FHWKQEELKF	KTGLRRLQHR	VGEIHLLREA
LQKGAEAGQV	SLHSLIETPA	NGTGPSEALA	MLLQETTGEL	EAAKALVLKR
IQIWKRQQQL	AGNGAPFEES	LAPLQERCES	LVDIYSQLQQ	EVGAAGGELE
PKTRASLTGR	LDEVLRTLVT	SCFLVEKQPP	QVLKTQTKFQ	AGVRFLLGLR
FLGAPAKPPL	VRADMVTEKQ	ARELSVPQGP	GAGAESTGEI	INNTVPLENS
IPGNCCSALF	KNLLLKKIKR	CERKGTESVT	EEKCAVLFSA	SFTLGPGKLP
IQLQALSLPL	VVIVHGNQDN	NAKATILWDN	AFSEMDRVPF	VVAERVPWEK
MCETLNLKFM	AEVGTNRGLL	PEHFLFLAQK	IFNDNSLSME	AFQHRSVSWS
QFNKEILLGR	GFTFWQWFDG	VLDLTKRCLR	SYWSDRLIIG	FISKQYVTSL
LLNEPDGTFL	LRFSDSEIGG	ITIAHVIRGQ	DGSPQIENIQ	PFSAKDLSIR
SLGDRIRDLA	QLKNLYPKKP	KDEAFRSHYK	PEQMGKDGRG	YVPATIKMTV
ERDQPLPTPE	LQMPTMVPSY	DLGMAPDSSM	SMQLGPDMVP	QVYPPHSHSI
PPYQGLSPEE	SVNVLSAFQE	PHLQMPPSLG	QMSLPFDQPH	PQGLLPCQPQ
EHAVSSPDPL	LCSDVTMVED	SCLSQPVTAF	PQGTWIGEDI	FPPLLPPTEQ
DLTKLLLEGQ	GESGGGSLGA	QPLLQPSHYG	QSGISMSHMD	LRANPSW

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Patel B.K., Keck C.L., O'Leary R.S., Popescu N.C., LaRochelle W.J. (1998). Localization of the human stat6 gene to chromosome 12q13.3-q14.1, a region implicated in multiple solid tumors.. Genomics 52: 192 — 200. PubMed DOI:10.1006/geno.1998.5436
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Litterst C.M., Pfitzner E. (2002). An LXXLL motif in the transactivation domain of STAT6 mediates recruitment of NCoA-1/SRC-1.. J. Biol. Chem. 277: 36052 — 36060. PubMed DOI:10.1074/jbc.M203556200

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з STAT6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11368 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P42226 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з STAT6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11368 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P42226 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.