STIM1

STIM1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2K60, 3TEQ, 2MAJ, 2MAK, 4O9B
Ідентифікатори
Символи	STIM1, D11S4896E, GOK, IMD10, STRMK, TAM, TAM1, stromal interaction molecule 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605921 MGI: 107476 HomoloGene: 20681 GeneCards: STIM1
Пов'язані генетичні захворювання
	Stormorken syndrome, tubular aggregate myopathy[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • calcium channel regulator activity; • microtubule plus-end binding; • зв'язування з іоном металу; • protease binding; • GO:0001948 protein binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • integral component of plasma membrane; • cortical endoplasmic reticulum; • sarcoplasmic reticulum; • integral component of endoplasmic reticulum membrane; • Ендоплазматичний ретикулум; • sarcoplasmic reticulum membrane; • Мікротрубочки; • Цитоскелет; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• regulation of cardiac conduction; • regulation of calcium ion transport; • ion transport; • detection of calcium ion; • enamel mineralization; • activation of store-operated calcium channel activity; • calcium ion transport; • cellular calcium ion homeostasis; • regulation of store-operated calcium entry; • store-operated calcium entry; • positive regulation of angiogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6786
	20866
	ENSG00000167323
	ENSMUSG00000030987
	Q13586
	P70302
	NM_003156; NM_001277961; NM_001277962
	NM_009287; NM_001374058; NM_001374060
NP_001264890; NP_001264891; NP_003147; NP_001369495; NP_001369496;
	NP_001369497; NP_001369498; NP_001369499; NP_001369500; NP_001369501; NP_001369502; NP_001369503; NP_001369504; NP_001369505; NP_001369506; NP_001369507; NP_001369508; NP_001369509; NP_001369510
	NP_033313; NP_001360987; NP_001360989
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

STIM1 (англ. Stromal interaction molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 685 амінокислот, а молекулярна маса — 77 423[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDVCVRLALW	LLWGLLLHQG	QSLSHSHSEK	ATGTSSGANS	EESTAAEFCR
IDKPLCHSED	EKLSFEAVRN	IHKLMDDDAN	GDVDVEESDE	FLREDLNYHD
PTVKHSTFHG	EDKLISVEDL	WKAWKSSEVY	NWTVDEVVQW	LITYVELPQY
EETFRKLQLS	GHAMPRLAVT	NTTMTGTVLK	MTDRSHRQKL	QLKALDTVLF
GPPLLTRHNH	LKDFMLVVSI	VIGVGGCWFA	YIQNRYSKEH	MKKMMKDLEG
LHRAEQSLHD	LQERLHKAQE	EHRTVEVEKV	HLEKKLRDEI	NLAKQEAQRL
KELREGTENE	RSRQKYAEEE	LEQVREALRK	AEKELESHSS	WYAPEALQKW
LQLTHEVEVQ	YYNIKKQNAE	KQLLVAKEGA	EKIKKKRNTL	FGTFHVAHSS
SLDDVDHKIL	TAKQALSEVT	AALRERLHRW	QQIEILCGFQ	IVNNPGIHSL
VAALNIDPSW	MGSTRPNPAH	FIMTDDVDDM	DEEIVSPLSM	QSPSLQSSVR
QRLTEPQHGL	GSQRDLTHSD	SESSLHMSDR	QRVAPKPPQM	SRAADEALNA
MTSNGSHRLI	EGVHPGSLVE	KLPDSPALAK	KALLALNHGL	DKAHSLMELS
PSAPPGGSPH	LDSSRSHSPS	SPDPDTPSPV	GDSRALQASR	NTRIPHLAGK
KAVAEEDNGS	IGEETDSSPG	RKKFPLKIFK	KPLKK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, саркоплазматичному ретикулумі.

Література

Parker N.J., Begley C.G., Smith P.J., Fox R.M. (1996). Molecular cloning of a novel human gene (D11S4896E) at chromosomal region 11p15.5.. Genomics 37: 253 — 256. PubMed DOI:10.1006/geno.1996.0553
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment.. J. Proteome Res. 7: 5167 — 5176. PubMed DOI:10.1021/pr800500r
Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry.. Nat. Biotechnol. 21: 660 — 666. PubMed DOI:10.1038/nbt827
Lewandrowski U., Moebius J., Walter U., Sickmann A. (2006). Elucidation of N-glycosylation sites on human platelet proteins: a glycoproteomic approach.. Mol. Cell. Proteomics 5: 226 — 233. PubMed DOI:10.1074/mcp.M500324-MCP200
Krapivinsky G., Krapivinsky L., Stotz S.C., Manasian Y., Clapham D.E. (2011). POST, partner of stromal interaction molecule 1 (STIM1), targets STIM1 to multiple transporters.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 19234 — 19239. PubMed DOI:10.1073/pnas.1117231108

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з STIM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11386 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.
UniProt, Q13586 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 11

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з STIM1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11386 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q13586 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.