SWAP70

SWAP70
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2DN6
Ідентифікатори
Символи	SWAP70, SWAP-70, HSPC321, SWAP switching B-cell complex 70kDa subunit, SWAP switching B-cell complex subunit 70, switching B-cell complex subunit switching B cell complex subunit SWAP70
Зовнішні ІД	OMIM: 604762 MGI: 1298390 HomoloGene: 7557 GeneCards: SWAP70
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • calcium ion binding; • GO:0001948 protein binding; • ATP binding; • cadherin binding;
Клітинна компонента	• cell projection; • мембрана; • клітинна мембрана; • Цитоскелет; • клітинне ядро; • lamellipodium; • цитоплазма;
Біологічний процес	• positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; • positive regulation of mast cell chemotaxis; • negative regulation of peptidyl-serine dephosphorylation; • negative regulation of actin filament depolymerization; • actin filament bundle assembly; • regulation of protein localization; • regulation of actin polymerization or depolymerization; • somatic cell DNA recombination; • Перемикання класу імуноглобулінів; • positive regulation of actin filament bundle assembly; • negative regulation of cell-cell adhesion mediated by integrin;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	23075
	20947
	ENSG00000133789
	ENSMUSG00000031015
	Q9UH65
	Q6A028
	NM_001297714; NM_015055
	NM_009302
	NP_001284643; NP_055870
	NP_033328
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SWAP70 (англ. SWAP switching B-cell complex subunit 70) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 585 амінокислот, а молекулярна маса — 68 998[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGSLKEELLK	AIWHAFTALD	QDHSGKVSKS	QLKVLSHNLC	TVLKVPHDPV
ALEEHFRDDD	EGPVSNQGYM	PYLNRFILEK	VQDNFDKIEF	NRMCWTLCVK
KNLTKNPLLI	TEEDAFKIWV	IFNFLSEDKY	PLIIVSEEIE	YLLKKLTEAM
GGGWQQEQFE	HYKINFDDSK	NGLSAWELIE	LIGNGQFSKG	MDRQTVSMAI
NEVFNELILD	VLKQGYMMKK	GHRRKNWTER	WFVLKPNIIS	YYVSEDLKDK
KGDILLDENC	CVESLPDKDG	KKCLFLVKCF	DKTFEISASD	KKKKQEWIQA
IHSTIHLLKL	GSPPPHKEAR	QRRKELRKKQ	LAEQEELERQ	MKELQAANES
KQQELEAVRK	KLEEAASRAA	EEEKKRLQTQ	VELQARFSTE	LEREKLIRQQ
MEEQVAQKSS	ELEQYLQRVR	ELEDMYLKLQ	EALEDERQAR	QDEETVRKLQ
ARLLEEESSK	RAELEKWHLE	QQQAIQTTEA	EKQELENQRV	LKEQALQEAM
EQLEQLELER	KQALEQYEEV	KKKLEMATNK	TKSWKDKVAH	HEGLIRLIEP
GSKNPHLITN	WGPAAFTEAE	LEEREKNWKE	KKTTE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних відростках.

Література

Rapalus L., Minegishi Y., Lavoie A., Cunningham-Rundles C., Conley M.E. (2001). Analysis of SWAP-70 as a candidate gene for non-X-linked hyper IgM syndrome and common variable immunodeficiency.. Clin. Immunol. 101: 270 — 275. PubMed DOI:10.1006/clim.2001.5116
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17070 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, Q9UH65 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17070 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9UH65 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.