THAP1

THAP1 (англ. THAP domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 213 амінокислот, а молекулярна маса — 24 944[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MVQSCSAYGCKNRYDKDKPVSFHKFPLTRPSLCKEWEAAVRRKNFKPTKY
SSICSEHFTPDCFKRECNNKLLKENAVPTIFLCTEPHDKKEDLLEPQEQL
PPPPLPPPVSQVDAAIGLLMPPLQTPVNLSVFCDHNYTVEDTMHQRKRIH
QLEQQVEKLRKKLKTAQQRCRRQERQLEKLKEVVHFQKEKDDVSERGYVI
LPNDYFEIVEVPA
THAP1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи THAP1, DYT6, THAP domain containing, apoptosis associated protein 1, THAP domain containing 1
Зовнішні ІД OMIM: 609520 MGI: 1921004 HomoloGene: 10005 GeneCards: THAP1
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
55145
73754
Ensembl
ENSG00000131931
ENSMUSG00000037214
UniProt
Q9NVV9
Q8CHW1
RefSeq (мРНК)
NM_199003
NM_018105
NM_199042
RefSeq (білок)
NP_060575
NP_945354
NP_950243
Локус (UCSC) Хр. 8: 42.84 – 42.84 Mb Хр. 8: 26.16 – 26.16 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
  • Roussigne M., Cayrol C., Clouaire T., Amalric F., Girard J.-P. (2003). THAP1 is a nuclear proapoptotic factor that links prostate-apoptosis-response-4 (Par-4) to PML nuclear bodies.. Oncogene 22: 2432 — 2442. PubMed DOI:10.1038/sj.onc.1206271
  • Sabogal A., Lyubimov A.Y., Corn J.E., Berger J.M., Rio D.C. (2010). THAP proteins target specific DNA sites through bipartite recognition of adjacent major and minor grooves.. Nat. Struct. Mol. Biol. 17: 117 — 123. PubMed DOI:10.1038/nsmb.1742
  • Campagne S., Saurel O., Gervais V., Milon A. (2010). Structural determinants of specific DNA-recognition by the THAP zinc finger.. Nucleic Acids Res. 38: 3466 — 3476. PubMed DOI:10.1093/nar/gkq053
  • Van Gerpen J.A., Ledoux M.S., Wszolek Z.K. (2010). Adult-onset leg dystonia due to a missense mutation in THAP1.. Mov. Disord. 25: 1306 — 1307. PubMed DOI:10.1002/mds.23086

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20856 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
  4. UniProt, Q9NVV9 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.