THRA

THRA
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1NAV, 2H77, 2H79, 3HZF, 3ILZ, 3JZB, 4LNW, 4LNX
Ідентифікатори
Символи	THRA, AR7, CHNG6, EAR7, ERB-T-1, ERBA, ERBA1, NR1A1, THRA1, THRA2, c-ERBA-1, thyroid hormone receptor, alpha, thyroid hormone receptor alpha, TRalpha
Зовнішні ІД	OMIM: 190120 MGI: 98742 HomoloGene: 37747 GeneCards: THRA
Пов'язані генетичні захворювання
	congenital nongoitrous hypothryoidism 6[1]
Реагує на сполуку
	DL-3,3',5'-triiodothyronine, tiratricol, Трийодтиронін, Левотироксин[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • GO:0001948 protein binding; • single-stranded RNA binding; • zinc ion binding; • chromatin DNA binding; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity; • steroid receptor RNA activator RNA binding; • transcription factor binding; • TBP-class protein binding; • steroid hormone receptor activity; • DNA binding; • protein domain specific binding; • sequence-specific DNA binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • thyroid hormone binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • nuclear receptor coactivator activity; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • Нуклеоплазма; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • RNA polymerase II transcription regulator complex;
Біологічний процес	• regulation of transcription by RNA polymerase II; • response to cold; • cytoplasmic sequestering of transcription factor; • hormone-mediated signaling pathway; • regulation of thyroid hormone mediated signaling pathway; • thyroid gland development; • regulation of transcription, DNA-templated; • ossification; • female courtship behavior; • cartilage condensation; • negative regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly; • type I pneumocyte differentiation; • transcription, DNA-templated; • steroid hormone mediated signaling pathway; • transcription by RNA polymerase II; • regulation of lipid catabolic process; • regulation of heart contraction; • animal organ morphogenesis; • positive regulation of female receptivity; • learning or memory; • regulation of myeloid cell apoptotic process; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • erythrocyte differentiation; • negative regulation of DNA-templated transcription, initiation; • positive regulation of myotube differentiation; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • intracellular receptor signaling pathway; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • thyroid hormone mediated signaling pathway; • multicellular organism development; • brain development; • Диференціація клітин; • response to lipid; • positive regulation of cold-induced thermogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	7067
	21833
	ENSG00000126351
	ENSMUSG00000058756
	P10827
	P63058
	NM_199334; NM_001190918; NM_001190919; NM_003250
	NM_178060; NM_001313983
	NP_001177847; NP_001177848; NP_003241; NP_955366
	NP_001300912; NP_835161
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

THRA (англ. Thyroid hormone receptor, alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 490 амінокислот, а молекулярна маса — 54 816[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEQKPSKVEC	GSDPEENSAR	SPDGKRKRKN	GQCSLKTSMS	GYIPSYLDKD
EQCVVCGDKA	TGYHYRCITC	EGCKGFFRRT	IQKNLHPTYS	CKYDSCCVID
KITRNQCQLC	RFKKCIAVGM	AMDLVLDDSK	RVAKRKLIEQ	NRERRRKEEM
IRSLQQRPEP	TPEEWDLIHI	ATEAHRSTNA	QGSHWKQRRK	FLPDDIGQSP
IVSMPDGDKV	DLEAFSEFTK	IITPAITRVV	DFAKKLPMFS	ELPCEDQIIL
LKGCCMEIMS	LRAAVRYDPE	SDTLTLSGEM	AVKREQLKNG	GLGVVSDAIF
ELGKSLSAFN	LDDTEVALLQ	AVLLMSTDRS	GLLCVDKIEK	SQEAYLLAFE
HYVNHRKHNI	PHFWPKLLMK	EREVQSSILY	KGAAAEGRPG	GSLGVHPEGQ
QLLGMHVVQG	PQVRQLEQQL	GEAGSLQGPV	LQHQSPKSPQ	QRLLELLHRS
GILHARAVCG	EDDSSEADSP	SSSEEEPEVC	EDLAGNAASP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Pfahl M., Benbrook D. (1987). Nucleotide sequence of cDNA encoding a novel human thyroid hormone receptor.. Nucleic Acids Res. 15: 9613 — 9613. PubMed DOI:10.1093/nar/15.22.9613
Nakai A., Sakurai A., Bell G.I., Degroot L.J. (1988). Characterization of a third human thyroid hormone receptor coexpressed with other thyroid hormone receptors in several tissues.. Mol. Endocrinol. 2: 1087 — 1092. PubMed DOI:10.1210/mend-2-11-1087
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Benbrook D., Pfahl M. (1987). A novel thyroid hormone receptor encoded by a cDNA clone from a human testis library.. Science 238: 788 — 791. PubMed DOI:10.1126/science.3672126
Yang Y.Z., Burgos-Trinidad M., Wu Y., Koenig R.J. (1996). Thyroid hormone receptor variant alpha2. Role of the ninth heptad in dna binding, heterodimerization with retinoid X receptors, and dominant negative activity.. J. Biol. Chem. 271: 28235 — 28242. PubMed DOI:10.1074/jbc.271.45.28235

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з THRA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Сполуки, які фізично взаємодіють з Thyroid hormone receptor alpha переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11796 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P10827 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з THRA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Thyroid hormone receptor alpha переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11796 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-6] UniProt, P10827 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.