TLR3

TLR3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1ZIW, 2A0Z, 3ULU, 3ULV, 2MK9, 2MKA
Ідентифікатори
Символи	TLR3, CD283, IIAE2, toll like receptor 3, IMD83
Зовнішні ІД	OMIM: 603029 MGI: 2156367 HomoloGene: 20696 GeneCards: TLR3
Пов'язані генетичні захворювання
	herpesviral encephalitis[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • identical protein binding; • RNA binding; • double-stranded RNA binding; • transmembrane signaling receptor activity; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • Ендосома; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • Golgi membrane; • integral component of plasma membrane; • внутрішньоклітинний; • cell surface; • lysosomal membrane; • early endosome; • Ендоплазматичний ретикулум; • endolysosome membrane; • endosome membrane; • extracellular space; • GO:0005578 Позаклітинна матриця;
Біологічний процес	• positive regulation of interferon-beta production; • response to dsRNA; • defense response; • positive regulation of toll-like receptor signaling pathway; • positive regulation of protein phosphorylation; • male gonad development; • positive regulation of inflammatory response; • positive regulation of interleukin-12 production; • positive regulation of type III interferon production; • cellular response to interferon-beta; • response to exogenous dsRNA; • negative regulation of osteoclast differentiation; • positive regulation of cytokine production; • immune system process; • response to virus; • activation of NF-kappaB-inducing kinase activity; • I-kappaB phosphorylation; • positive regulation of JNK cascade; • hyperosmotic response; • cellular response to dsRNA; • regulation of dendritic cell cytokine production; • microglial cell activation; • toll-like receptor signaling pathway; • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway; • cellular response to mechanical stimulus; • microglial cell activation involved in immune response; • positive regulation of gene expression; • defense response to bacterium; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • defense response to virus; • necroptotic signaling pathway; • positive regulation of interleukin-8 production; • cellular response to exogenous dsRNA; • positive regulation of interleukin-6 production; • positive regulation of tumor necrosis factor production; • cellular response to interferon-gamma; • positive regulation of chemokine production; • positive regulation of apoptotic process; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • detection of virus; • inflammatory response; • Вроджений імунітет; • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • toll-like receptor 3 signaling pathway; • positive regulation of type I interferon production; • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway; • Сигнальна трансдукція; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0060554, GO:0060555 Некроптоз; • apoptotic signaling pathway; • negative regulation of MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway; • extrinsic apoptotic signaling pathway; • positive regulation of angiogenesis; • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7098
	142980
	ENSG00000164342
	ENSMUSG00000031639
	O15455
	Q99MB1
	NM_003265
	NM_126166; NM_001357316; NM_001357317
	NP_003256
	NP_569054; NP_001344245; NP_001344246
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TLR3 (англ. Toll like receptor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 904 амінокислот, а молекулярна маса — 103 829[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRQTLPCIYF	WGGLLPFGML	CASSTTKCTV	SHEVADCSHL	KLTQVPDDLP
TNITVLNLTH	NQLRRLPAAN	FTRYSQLTSL	DVGFNTISKL	EPELCQKLPM
LKVLNLQHNE	LSQLSDKTFA	FCTNLTELHL	MSNSIQKIKN	NPFVKQKNLI
TLDLSHNGLS	STKLGTQVQL	ENLQELLLSN	NKIQALKSEE	LDIFANSSLK
KLELSSNQIK	EFSPGCFHAI	GRLFGLFLNN	VQLGPSLTEK	LCLELANTSI
RNLSLSNSQL	STTSNTTFLG	LKWTNLTMLD	LSYNNLNVVG	NDSFAWLPQL
EYFFLEYNNI	QHLFSHSLHG	LFNVRYLNLK	RSFTKQSISL	ASLPKIDDFS
FQWLKCLEHL	NMEDNDIPGI	KSNMFTGLIN	LKYLSLSNSF	TSLRTLTNET
FVSLAHSPLH	ILNLTKNKIS	KIESDAFSWL	GHLEVLDLGL	NEIGQELTGQ
EWRGLENIFE	IYLSYNKYLQ	LTRNSFALVP	SLQRLMLRRV	ALKNVDSSPS
PFQPLRNLTI	LDLSNNNIAN	INDDMLEGLE	KLEILDLQHN	NLARLWKHAN
PGGPIYFLKG	LSHLHILNLE	SNGFDEIPVE	VFKDLFELKI	IDLGLNNLNT
LPASVFNNQV	SLKSLNLQKN	LITSVEKKVF	GPAFRNLTEL	DMRFNPFDCT
CESIAWFVNW	INETHTNIPE	LSSHYLCNTP	PHYHGFPVRL	FDTSSCKDSA
PFELFFMINT	SILLIFIFIV	LLIHFEGWRI	SFYWNVSVHR	VLGFKEIDRQ
TEQFEYAAYI	IHAYKDKDWV	WEHFSSMEKE	DQSLKFCLEE	RDFEAGVFEL
EAIVNSIKRS	RKIIFVITHH	LLKDPLCKRF	KVHHAVQQAI	EQNLDSIILV
FLEEIPDYKL	NHALCLRRGM	FKSHCILNWP	VQKERIGAFR	HKLQVALGSK
NSVH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, ендосомах.

Література

Rock F.L., Hardiman G., Timans J.C., Kastelein R.A., Bazan J.F. (1998). A family of human receptors structurally related to Drosophila Toll.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 588 — 593. PubMed DOI:10.1073/pnas.95.2.588
Lafon M., Megret F., Lafage M., Prehaud C. (2006). The innate immune facet of brain: human neurons express TLR-3 and sense viral dsRNA.. J. Mol. Neurosci. 29: 185 — 194. PubMed DOI:10.1385/JMN:29:3:185
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites.. Protein Sci. 13: 2819 — 2824. PubMed DOI:10.1110/ps.04682504
Oshiumi H., Matsumoto M., Funami K., Akazawa T., Seya T. (2003). TICAM-1, an adapter molecule that participates in Toll-like receptor 3 mediated interferon-beta induction.. Nat. Immunol. 4: 161 — 167. PubMed DOI:10.1038/ni886
Bell J.K., Askins J., Hall P.R., Davies D.R., Segal D.M. (2006). The dsRNA binding site of human Toll-like receptor 3.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 8792 — 8797. PubMed DOI:10.1073/pnas.0603245103

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з TLR3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11849 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, O15455 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з TLR3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11849 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, O15455 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.