TLR9

TLR9
Ідентифікатори
Символи	TLR9, CD289, toll like receptor 9
Зовнішні ІД	OMIM: 605474 MGI: 1932389 HomoloGene: 68126 GeneCards: TLR9
Реагує на сполуку
	гідроксихлорохін[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• siRNA binding; • interleukin-1 receptor binding; • transmembrane signaling receptor activity; • 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity; • protein homodimerization activity; • unmethylated CpG binding; • GO:0008329 pattern recognition receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • Ендосома; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • early phagosome; • Golgi membrane; • клітинна мембрана; • extracellular region; • basolateral plasma membrane; • apical plasma membrane; • Ендоплазматичний ретикулум; • phagocytic vesicle; • endolysosome membrane; • Лізосома; • endosome membrane; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • extracellular space; • endolysosome;
Біологічний процес	• positive regulation of interleukin-18 production; • positive regulation of toll-like receptor signaling pathway; • positive regulation of inflammatory response; • positive regulation of interleukin-12 production; • axonogenesis; • positive regulation of interleukin-10 production; • immune system process; • positive regulation of JUN kinase activity; • negative regulation of interleukin-6 production; • I-kappaB phosphorylation; • positive regulation of JNK cascade; • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process; • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway; • negative regulation of interleukin-8 production; • positive regulation of gene expression; • negative regulation of ATPase-coupled calcium transmembrane transporter activity; • negative regulation of toll-like receptor signaling pathway; • defense response to bacterium; • maintenance of gastrointestinal epithelium; • positive regulation of granulocyte macrophage colony-stimulating factor production; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • positive regulation of interleukin-8 production; • positive regulation of interleukin-6 production; • positive regulation of tumor necrosis factor production; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • positive regulation of chemokine production; • tumor necrosis factor production; • toll-like receptor 9 signaling pathway; • Вроджений імунітет; • inflammatory response; • response to molecule of bacterial origin; • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • Сигнальна трансдукція; • positive regulation of interferon-beta production; • toll-like receptor signaling pathway; • phosphatidylinositol-3-phosphate biosynthetic process; • positive regulation of immunoglobulin production; • positive regulation of B cell proliferation; • regulation of toll-like receptor 9 signaling pathway; • positive regulation of MAPK cascade; • regulation of B cell differentiation; • positive regulation of B cell activation; • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • Імунна відповідь; • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • defense response to virus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	54106
	81897
	ENSG00000239732
	ENSMUSG00000045322
	Q9NR96
	Q9EQU3
	NM_138688; NM_017442
	NM_031178
	NP_059138
	NP_112455
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TLR9 (англ. Toll like receptor 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 032 амінокислот, а молекулярна маса — 115 860[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGFCRSALHP	LSLLVQAIML	AMTLALGTLP	AFLPCELQPH	GLVNCNWLFL
KSVPHFSMAA	PRGNVTSLSL	SSNRIHHLHD	SDFAHLPSLR	HLNLKWNCPP
VGLSPMHFPC	HMTIEPSTFL	AVPTLEELNL	SYNNIMTVPA	LPKSLISLSL
SHTNILMLDS	ASLAGLHALR	FLFMDGNCYY	KNPCRQALEV	APGALLGLGN
LTHLSLKYNN	LTVVPRNLPS	SLEYLLLSYN	RIVKLAPEDL	ANLTALRVLD
VGGNCRRCDH	APNPCMECPR	HFPQLHPDTF	SHLSRLEGLV	LKDSSLSWLN
ASWFRGLGNL	RVLDLSENFL	YKCITKTKAF	QGLTQLRKLN	LSFNYQKRVS
FAHLSLAPSF	GSLVALKELD	MHGIFFRSLD	ETTLRPLARL	PMLQTLRLQM
NFINQAQLGI	FRAFPGLRYV	DLSDNRISGA	SELTATMGEA	DGGEKVWLQP
GDLAPAPVDT	PSSEDFRPNC	STLNFTLDLS	RNNLVTVQPE	MFAQLSHLQC
LRLSHNCISQ	AVNGSQFLPL	TGLQVLDLSH	NKLDLYHEHS	FTELPRLEAL
DLSYNSQPFG	MQGVGHNFSF	VAHLRTLRHL	SLAHNNIHSQ	VSQQLCSTSL
RALDFSGNAL	GHMWAEGDLY	LHFFQGLSGL	IWLDLSQNRL	HTLLPQTLRN
LPKSLQVLRL	RDNYLAFFKW	WSLHFLPKLE	VLDLAGNQLK	ALTNGSLPAG
TRLRRLDVSC	NSISFVAPGF	FSKAKELREL	NLSANALKTV	DHSWFGPLAS
ALQILDVSAN	PLHCACGAAF	MDFLLEVQAA	VPGLPSRVKC	GSPGQLQGLS
IFAQDLRLCL	DEALSWDCFA	LSLLAVALGL	GVPMLHHLCG	WDLWYCFHLC
LAWLPWRGRQ	SGRDEDALPY	DAFVVFDKTQ	SAVADWVYNE	LRGQLEECRG
RWALRLCLEE	RDWLPGKTLF	ENLWASVYGS	RKTLFVLAHT	DRVSGLLRAS
FLLAQQRLLE	DRKDVVVLVI	LSPDGRRSRY	VRLRQRLCRQ	SVLLWPHQPS
GQRSFWAQLG	MALTRDNHHF	YNRNFCQGPT	AE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ендосомах.

Література

Georgel P., Macquin C., Bahram S. (2009). The heterogeneous allelic repertoire of human Toll-Like receptor (TLR) genes.. PLoS ONE 4: E7803 — E7803. PubMed DOI:10.1371/journal.pone.0007803
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Doyle S.L., Jefferies C.A., Feighery C., O'Neill L.A. (2007). Signaling by Toll-like receptors 8 and 9 requires Bruton's tyrosine kinase.. J. Biol. Chem. 282: 36953 — 36960. PubMed DOI:10.1074/jbc.M707682200
Du X., Poltorak A., Wei Y., Beutler B. (2000). Three novel mammalian Toll-like receptors: gene structure, expression, and evolution.. Eur. Cytokine Netw. 11: 362 — 371. PubMed
Chuang T.-H., Ulevitch R.J. (2000). Cloning and characterization of a sub-family of human Toll-like receptors: hTLR7, hTLR8 and hTLR9.. Eur. Cytokine Netw. 11: 372 — 378. PubMed

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з Toll like receptor 9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15633 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.
UniProt, Q9NR96 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Toll like receptor 9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15633 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q9NR96 (англ.). Процитовано 30 серпня 2017.