TRIM21

TRIM21
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2IWG
Ідентифікатори
Символи	TRIM21, RNF81, RO52, Ro/SSA, SSA, SSA1, tripartite motif containing 21, Tripartite motif-containing protein 21
Зовнішні ІД	OMIM: 109092 MGI: 106657 HomoloGene: 2365 GeneCards: TRIM21
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948 protein binding; • RNA binding; • identical protein binding; • ubiquitin-protein transferase activity; • transferase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • SCF ubiquitin ligase complex; • P-body; • внутрішньоклітинний; • autophagosome; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • Рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• negative regulation of protein deubiquitination; • response to interferon-gamma; • positive regulation of autophagy; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • protein trimerization; • positive regulation of viral entry into host cell; • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity; • protein monoubiquitination; • regulation of type I interferon production; • positive regulation of cell cycle; • protein destabilization; • Убіквітин-залежний протеоліз; • Клітинний цикл; • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • protein autoubiquitination; • Вроджений імунітет; • protein polyubiquitination; • negative regulation of viral transcription;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6737
	20821
	ENSG00000132109
	ENSMUSG00000030966
	P19474
	Q62191
	NM_003141
	NM_001082552; NM_009277
	NP_003132
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TRIM21 (англ. Tripartite motif containing 21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 475 амінокислот, а молекулярна маса — 54 170[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASAARLTMM	WEEVTCPICL	DPFVEPVSIE	CGHSFCQECI	SQVGKGGGSV
CPVCRQRFLL	KNLRPNRQLA	NMVNNLKEIS	QEAREGTQGE	RCAVHGERLH
LFCEKDGKAL	CWVCAQSRKH	RDHAMVPLEE	AAQEYQEKLQ	VALGELRRKQ
ELAEKLEVEI	AIKRADWKKT	VETQKSRIHA	EFVQQKNFLV	EEEQRQLQEL
EKDEREQLRI	LGEKEAKLAQ	QSQALQELIS	ELDRRCHSSA	LELLQEVIIV
LERSESWNLK	DLDITSPELR	SVCHVPGLKK	MLRTCAVHIT	LDPDTANPWL
ILSEDRRQVR	LGDTQQSIPG	NEERFDSYPM	VLGAQHFHSG	KHYWEVDVTG
KEAWDLGVCR	DSVRRKGHFL	LSSKSGFWTI	WLWNKQKYEA	GTYPQTPLHL
QVPPCQVGIF	LDYEAGMVSF	YNITDHGSLI	YSFSECAFTG	PLRPFFSPGF
NDGGKNTAPL	TLCPLNIGSQ	GSTDY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, цитоплазматичних везикулах.

Література

Itoh K., Itoh Y., Frank M.B. (1991). Protein heterogeneity in the human Ro/SSA ribonucleoproteins. The 52- and 60-kD Ro/SSA autoantigens are encoded by separate genes.. J. Clin. Invest. 87: 177 — 186. PubMed DOI:10.1172/JCI114968
Chan E.K., Hamel J.C., Buyon J.P., Tan E.M. (1991). Molecular definition and sequence motifs of the 52-kD component of human SS-A/Ro autoantigen.. J. Clin. Invest. 87: 68 — 76. PubMed DOI:10.1172/JCI115003
Tsugu H., Horowitz R., Gibson N., Frank M.B. (1994). The location of a disease-associated polymorphism and genomic structure of the human 52-kDa Ro/SSA locus (SSA1).. Genomics 24: 541 — 548. PubMed DOI:10.1006/geno.1994.1664
Keech C.L., Gordon T.P., McCluskey J. (1996). Structural differences between the human and mouse 52-kD Ro autoantigens associated with poorly conserved autoantibody activity across species.. Clin. Exp. Immunol. 104: 255 — 263. PubMed DOI:10.1046/j.1365-2249.1996.16726.x
Bepler G., O'Briant K.C., Kim Y.-C., Schreiber G., Pitterle D.M. (1999). A 1.4-Mb high-resolution physical map and contig of chromosome segment 11p15.5 and genes in the LOH11A metastasis suppressor region.. Genomics 55: 164 — 175. PubMed DOI:10.1006/geno.1998.5659
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11312 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, P19474 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11312 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P19474 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.