YY1

YY1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1UBD, 1ZNM, 4C5I
Ідентифікатори
Символи	YY1, DELTA, INO80S, NF-E1, UCRBP, YIN-YANG-1, YY1 transcription factor, GADEVS
Зовнішні ІД	OMIM: 600013 MGI: 99150 HomoloGene: 2556 GeneCards: YY1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001948 protein binding; • four-way junction DNA binding; • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • RNA binding; • nucleic acid binding; • SMAD binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • histone deacetylase binding;
Клітинна компонента	• Ino80 complex; • nuclear matrix; • клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • transcription regulator complex; • цитоплазма; • PcG protein complex;
Біологічний процес	• Диференціація клітин; • DNA recombination; • regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • cellular response to UV; • negative regulation of gene expression; • transcription, DNA-templated; • cellular response to DNA damage stimulus; • double-strand break repair via homologous recombination; • Сперматогенез; • Репарація ДНК; • protein deubiquitination; • negative regulation of interferon-beta production; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • RNA localization; • anterior/posterior pattern specification; • response to UV-C; • positive regulation of gene expression; • response to prostaglandin F; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • camera-type eye morphogenesis; • chromosome organization; • cellular response to interleukin-1; • negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of cell growth involved in cardiac muscle cell development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	7528
	22632
	ENSG00000100811
	ENSMUSG00000021264
	P25490
	Q00899
	NM_003403
	NM_009537
	NP_003394
	NP_033563
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

YY1 (англ. YY1 transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 414 амінокислот, а молекулярна маса — 44 713[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASGDTLYIA	TDGSEMPAEI	VELHEIEVET	IPVETIETTV	VGEEEEEDDD
DEDGGGGDHG	GGGGHGHAGH	HHHHHHHHHH	PPMIALQPLV	TDDPTQVHHH
QEVILVQTRE	EVVGGDDSDG	LRAEDGFEDQ	ILIPVPAPAG	GDDDYIEQTL
VTVAAAGKSG	GGGSSSSGGG	RVKKGGGKKS	GKKSYLSGGA	GAAGGGGADP
GNKKWEQKQV	QIKTLEGEFS	VTMWSSDEKK	DIDHETVVEE	QIIGENSPPD
YSEYMTGKKL	PPGGIPGIDL	SDPKQLAEFA	RMKPRKIKED	DAPRTIACPH
KGCTKMFRDN	SAMRKHLHTH	GPRVHVCAEC	GKAFVESSKL	KRHQLVHTGE
KPFQCTFEGC	GKRFSLDFNL	RTHVRIHTGD	RPYVCPFDGC	NKKFAQSTNL
KSHILTHAKA	KNNQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, диференціація клітин, сперматогенез. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Shi Y., Seto E., Chang L.-S., Shenk T. (1991). Transcriptional repression by YY1, a human GLI-Kruppel-related protein, and relief of repression by adenovirus E1A protein.. Cell 67: 377 — 388. PubMed DOI:10.1016/0092-8674(91)90189-6
Park K., Atchison M. (1991). Isolation of a candidate repressor/activator, NF-E1 (YY-1, delta), that binds to the immunoglobulin kappa 3' enhancer and the immunoglobulin heavy-chain mu E1 site.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 9804 — 9808. PubMed DOI:10.1073/pnas.88.21.9804
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Kalenik J.L., Chen D., Bradley M.E., Chen S.-J., Lee T.-C. (1997). Yeast two-hybrid cloning of a novel zinc finger protein that interacts with the multifunctional transcription factor YY1.. Nucleic Acids Res. 25: 843 — 849. PubMed DOI:10.1093/nar/25.4.843
Oei S.L., Shi Y. (2001). Poly(ADP-ribosyl)ation of transcription factor Yin Yang 1 under conditions of DNA damage.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 285: 27 — 31. PubMed DOI:10.1006/bbrc.2001.5115
Satijn D.P.E., Hamer K.M., den Blaauwen J., Otte A.P. (2001). The polycomb group protein EED interacts with YY1, and both proteins induce neural tissue in Xenopus embryos.. Mol. Cell. Biol. 21: 1360 — 1369. PubMed DOI:10.1128/MCB.21.4.1360-1369.2001

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12856 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.
UniProt, P25490 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 14

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12856 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P25490 (англ.). Процитовано 11 вересня 2017.