Фактор некрозу пухлини

TNF
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1A8M, 1TNF, 2AZ5, 2E7A, 2TUN, 2ZJC, 2ZPX, 3ALQ, 3IT8, 3L9J, 3WD5, 4G3Y, 4TSV, 4TWT, 5TSW
Ідентифікатори
Символи	TNF, DIF, TNF-alpha, TNFA, TNFSF2, Tumour necrosis factor, TNF-α, tumor necrosis factor, TNLG1F, Tumor necrosis factor alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 191160 MGI: 104798 HomoloGene: 496 GeneCards: TNF
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948 protein binding; • protease binding; • tumor necrosis factor receptor binding; • cytokine activity; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• мембрана; • cell surface; • integral component of membrane; • recycling endosome; • внутрішньоклітинний; • integral component of plasma membrane; • phagocytic cup; • external side of plasma membrane; • extracellular region; • клітинна мембрана; • membrane raft; • extracellular space;
Біологічний процес	• regulation of protein phosphorylation; • positive regulation of protein phosphorylation; • positive regulation of MAP kinase activity; • response to salt stress; • positive regulation of calcidiol 1-monooxygenase activity; • positive regulation of programmed cell death; • positive regulation of JNK cascade; • response to organic substance; • negative regulation of osteoblast differentiation; • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • negative regulation of viral genome replication; • humoral immune response; • positive regulation of interleukin-8 production; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; • positive regulation of protein localization to cell surface; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • glucose metabolic process; • animal organ morphogenesis; • apoptotic signaling pathway; • negative regulation of alkaline phosphatase activity; • regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium; • regulation of branching involved in salivary gland morphogenesis; • positive regulation of phagocytosis; • negative regulation of fat cell differentiation; • negative regulation of myoblast differentiation; • positive regulation of protein kinase B signaling; • regulation of insulin secretion; • osteoclast differentiation; • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • response to virus; • positive regulation of osteoclast differentiation; • GO:0002719 negative regulation of cytokine production involved in immune response; • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation; • negative regulation of branching involved in lung morphogenesis; • JNK cascade; • death-inducing signaling complex assembly; • regulation of osteoclast differentiation; • defense response to bacterium; • positive regulation of interleukin-6 production; • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • positive regulation of translational initiation by iron; • sequestering of triglyceride; • positive regulation of chronic inflammatory response to antigenic stimulus; • positive regulation of chemokine (C-X-C motif) ligand 2 production; • positive regulation of JUN kinase activity; • positive regulation of hair follicle development; • chronic inflammatory response to antigenic stimulus; • cellular response to organic cyclic compound; • positive regulation of fever generation; • extracellular matrix organization; • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity; • cellular response to nicotine; • positive regulation of podosome assembly; • regulation of reactive oxygen species metabolic process; • positive regulation of protein transport; • negative regulation of glucose import; • Імунна відповідь; • leukocyte tethering or rolling; • positive regulation of chemokine production; • cellular extravasation; • negative regulation of lipid storage; • negative regulation of myosin-light-chain-phosphatase activity; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0033109 cortical actin cytoskeleton organization; • embryonic digestive tract development; • leukocyte migration; • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway; • positive regulation of smooth muscle cell proliferation; • positive regulation of protein kinase activity; • positive regulation of superoxide dismutase activity; • defense response; • positive regulation of ceramide biosynthetic process; • positive regulation of protein-containing complex assembly; • protein kinase B signaling; • positive regulation of cytokine production; • epithelial cell proliferation involved in salivary gland morphogenesis; • positive regulation of nitric oxide biosynthetic process; • negative regulation of interleukin-6 production; • positive regulation of membrane protein ectodomain proteolysis; • positive regulation of humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin; • positive regulation of interferon-gamma production; • response to glucocorticoid; • positive regulation of vitamin D biosynthetic process; • positive regulation of mononuclear cell migration; • MAPK cascade; • negative regulation of protein-containing complex disassembly; • multicellular organism development; • negative regulation of bicellular tight junction assembly; • positive regulation of protein-containing complex disassembly; • regulation of cell population proliferation; • cellular response to amino acid stimulus; • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand; • cellular response to lipopolysaccharide; • negative regulation of lipid catabolic process; • regulation of establishment of endothelial barrier; • positive regulation of cell adhesion; • regulation of protein secretion; • positive regulation of apoptotic process; • inflammatory response; • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • necroptotic signaling pathway; • positive regulation of gene expression; • extrinsic apoptotic signaling pathway; • extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • positive regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of leukocyte adhesion to arterial endothelial cell; • positive regulation of leukocyte adhesion to vascular endothelial cell; • positive regulation of blood microparticle formation; • negative regulation of endothelial cell proliferation; • positive regulation of heterotypic cell-cell adhesion; • negative regulation of mitotic cell cycle; • endothelial cell apoptotic process; • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation; • negative regulation of gene expression; • protein localization to plasma membrane; • positive regulation of protein catabolic process; • regulation of signaling receptor activity; • regulation of inflammatory response; • cytokine-mediated signaling pathway; • positive regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade; • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7124
	21926
ENSG00000228978; ENSG00000230108; ENSG00000223952; ENSG00000204490; ENSG00000228321;
	ENSG00000232810; ENSG00000228849; ENSG00000206439
	ENSMUSG00000024401
	P01375
	P06804
	NM_000594
	NM_001278601; NM_013693
	NP_000585
	NP_001265530; NP_038721
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TNF (англ. Tumor necrosis factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 233 амінокислоти, а молекулярна маса — 25 644[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSTESMIRDV	ELAEEALPKK	TGGPQGSRRC	LFLSLFSFLI	VAGATTLFCL
LHFGVIGPQR	EEFPRDLSLI	SPLAQAVRSS	SRTPSDKPVA	HVVANPQAEG
QLQWLNRRAN	ALLANGVELR	DNQLVVPSEG	LYLIYSQVLF	KGQGCPSTHV
LLTHTISRIA	VSYQTKVNLL	SAIKSPCQRE	TPEGAEAKPW	YEPIYLGGVF
QLEKGDRLSA	EINRPDYLDF	AESGQVYFGI	IAL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до клітинних сигнальних білків (цитокінів, фосфопротеїнів), бере участь у процесах системного запалення, є одним з цитокінів що формують реакцію гострої фази. Фактор некрозу пухлин виробляється переважно активованими макрофагами, меншою мірою його синтезують інші типи клітин (CD4+-лімфоцити, NK-клітини, нейтрофіли, опасисті клітини, еозинофіли та нейтрофіли. Локалізований у клітинній мембрані.

Фізіологія

Основна роль ФНП полягає в регуляції взаємодії імунних клітин. ФНП є ендогенним пірогеном (викликає лихоманку), запускає процес клітинного апоптозу, спричинює кахексію, запалення та пригнічення росту пухлини і реплікацію вірусів, при сепсисі регулює продукцію прозапальних інтерлейкінів IL1 та IL6. Порушення регуляції продукції ФНП спостерігається при різних захворювань, зокрема при хворобі Альцгеймера, злоякісних новоутвореннях, великій депресії, псоріазі, запальних захворюваннях кишечника.

Фармакологія

ФНП стимулює запальні реакції, що, своєю чергою, викликає багато клінічних проблем, пов'язаних з аутоімунними розладами. Зокрема, підвищення синтезу ФНП супроводжує ревматоїдний артрит, анкілозуючий спондиліт (хвороба Бехтерєва), запальні захворювання кишечника (хвороба Крона, неспецифічний виразковий коліт), псоріаз, персистуючу бронхіальну астму. У деяких випадках лікування, спрямоване не інгібування ФНП, дозволяє досягти доброго клінічного ефекту. Гальмування ФНП може бути досягнуто за допомогою моноклональних антитіл, що безпосередньо зв'язуються з ФНП: інфліксимаб (Remicade), адалімумаб (Humira), цертолізумаб-пегол (Cimzia). Іншим шляхом зниження активності ФНП є уведення до організму штучного циркулюючого білка-рецептора, який зв'язує ФНП з більшою афінністю, ніж рецептор на клітинній мембрані. Препаратом такої дії є етанерцепт (Enbrel).
На жаль, анти-ФНП-терапія показала скромну ефективність при онкопатології. Лікування нирково-клітинної карциноми з інфліксимабом призвело до тривалої стабілізації хвороби лише у деяких пацієнтів. Етанерцепт був протестований для лікування хворих на рак молочної залози та раку яєчників і спричинив більш тривалу стабілізацію захворювання у деяких пацієнток шляхом зниження експресії IL-6 та CCL2. З іншого боку, додавання інфліксимабу або етанерцепту до гемцитабіну для лікування пацієнтів із запущеним раком підшлункової залози не підвищило ефективності лікування порівняно з плацебо.
Талідомід (Immunoprin) та його похідні леналідомід (Ревлімід) і помалідомід (Pomalyst, Imnovid) також активні проти ФНП. Іншими прикладами простих препаратів, що мають супресивний ефект щодо ФНП, є пентоксифілін[5] і бупропіон.[6]
Рекомбінантний ФНП використовується як імуностимулятор під INN тасонермін[7].

Література

Shirai T., Yamaguchi H., Ito H., Todd C.W., Wallace R.B. (1985). Cloning and expression in Escherichia coli of the gene for human tumour necrosis factor.. Nature 313: 803 — 806. PubMed DOI:10.1038/313803a0
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Takakura-Yamamoto R., Yamamoto S., Fukuda S., Kurimoto M. (1996). O-glycosylated species of natural human tumor-necrosis factor-alpha.. Eur. J. Biochem. 235: 431 — 437. PubMed DOI:10.1111/j.1432-1033.1996.00431.x
Stevenson F.T., Bursten S.L., Locksley R.M., Lovett D.H. (1992). Myristyl acylation of the tumor necrosis factor alpha precursor on specific lysine residues.. J. Exp. Med. 176: 1053 — 1062. PubMed DOI:10.1084/jem.176.4.1053
Jinesh G.G., Chunduru S., Kamat A.M. (2012). Smac mimetic enables the anticancer action of BCG-stimulated neutrophils through TNF-alpha but not through TRAIL and FasL.. J. Leukoc. Biol. 92: 233 — 244. PubMed DOI:10.1189/jlb.1211623
Jones E.Y., Stuart D.I., Walker N.P. (1989). Structure of tumour necrosis factor.. Nature 338: 225 — 228. PubMed DOI:10.1038/338225a0

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11892 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
UniProt, P01375 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.
Pentoxifylline Inhibits TNF-α Production from Human Alveolar Macrophages
A new chapter opens in anti-inflammatory treatments:The antidepressant bupropion lowers production of tumor necrosis factor-alpha and interferon-gamma in mice
Beromun (INN tasonermin)

Див. також

Хромосома 6

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11892 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P01375 (англ.). Процитовано 6 вересня 2017.

[5] Pentoxifylline Inhibits TNF-α Production from Human Alveolar Macrophages

[6] A new chapter opens in anti-inflammatory treatments:The antidepressant bupropion lowers production of tumor necrosis factor-alpha and interferon-gamma in mice

[7] Beromun (INN tasonermin)