ARAF

ARAF
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WXM, 2MSE
Ідентифікатори
Символи	ARAF, A-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase, A-RAF, ARAF1, PKS2, RAFA1, Serine/threonine-protein kinase A-Raf
Зовнішні ІД	OMIM: 311010 MGI: 88065 HomoloGene: 1249 GeneCards: ARAF
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • protein kinase activity; • nucleotide binding; • зв'язування з іоном металу; • kinase activity; • protein serine/threonine kinase activity; • GO:0001948 protein binding; • ATP binding; • MAP kinase kinase kinase activity; • mitogen-activated protein kinase kinase binding;
Клітинна компонента	• мітохондрія; • гіалоплазма; • компонент клітини;
Біологічний процес	• GO:0007243 intracellular signal transduction; • regulation of TOR signaling; • фосфорилювання; • negative regulation of apoptotic process; • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation; • MAPK cascade; • protein phosphorylation; • cellular protein modification process; • regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • Сигнальна трансдукція; • multicellular organism development; • negative regulation of signal transduction; • Диференціація клітин; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	369
	11836
	ENSG00000078061
	ENSMUSG00000001127
	P10398; Q96II5
	P04627
	NM_001256196; NM_001256197; NM_001654
	NM_001159645; NM_009703
	NP_001243125; NP_001243126; NP_001645; NP_001243125.1
	NP_001153117; NP_033833
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ARAF, або Серин/треонінова протеїн кіназа A-Raf(англ. A-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase) — білок, який кодується геном ARAF, розташованим у людей на короткому плечі X-хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 606 амінокислот, а молекулярна маса — 67 585[4].

ARAF — це протоонкоген, який бере участь у регуляції клітинного росту та диференціації та належить до родини Raf-кіназ.[5] Ген ARAF складається з 16 екзонів, які формуються приблизно 10 тис. нуклеотидами. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, іоном цинку.

Взаємодія

ARAF показав взаємодію з наступними білками:

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEPPRGPPAN	GAEPSRAVGT	VKVYLPNKQR	TVVTVRDGMS	VYDSLDKALK
VRGLNQDCCV	VYRLIKGRKT	VTAWDTAIAP	LDGEELIVEV	LEDVPLTMHN
FVRKTFFSLA	FCDFCLKFLF	HGFRCQTCGY	KFHQHCSSKV	PTVCVDMSTN
RQQFYHSVQD	LSGGSRQHEA	PSNRPLNELL	TPQGPSPRTQ	HCDPEHFPFP
APANAPLQRI	RSTSTPNVHM	VSTTAPMDSN	LIQLTGQSFS	TDAAGSRGGS
DGTPRGSPSP	ASVSSGRKSP	HSKSPAEQRE	RKSLADDKKK	VKNLGYRDSG
YYWEVPPSEV	QLLKRIGTGS	FGTVFRGRWH	GDVAVKVLKV	SQPTAEQAQA
FKNEMQVLRK	TRHVNILLFM	GFMTRPGFAI	ITQWCEGSSL	YHHLHVADTR
FDMVQLIDVA	RQTAQGMDYL	HAKNIIHRDL	KSNNIFLHEG	LTVKIGDFGL
ATVKTRWSGA	QPLEQPSGSV	LWMAAEVIRM	QDPNPYSFQS	DVYAYGVVLY
ELMTGSLPYS	HIGCRDQIIF	MVGRGYLSPD	LSKISSNCPK	AMRRLLSDCL
KFQREERPLF	PQILATIELL	QRSLPKIERS	ASEPSLHRTQ	ADELPACLLS
AARLVP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Література

Beck T.W., Huleihel M., Gunnell M., Bonner T.I., Rapp U.R. (1987). The complete coding sequence of the human A-raf-1 oncogene and transforming activity of a human A-raf carrying retrovirus.. Nucleic Acids Res. 15: 595 — 609. PubMed DOI:10.1093/nar/15.2.595
Lee J.-E., Beck T.W., Brennscheidt U., DeGennaro L.J., Rapp U.R. (1994). The complete sequence and promoter activity of the human A-raf-1 gene (ARAF1).. Genomics 20: 43 — 55. PubMed DOI:10.1006/geno.1994.1125
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Mark G.E., Seeley T.W., Shows T.B., Mountz J.D. (1986). Pks, a raf-related sequence in humans.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83: 6312 — 6316. PubMed DOI:10.1073/pnas.83.17.6312
Yin X.L., Chen S., Gu J.X. (2002). Identification of TH1 as an interaction partner of A-Raf kinase.. Mol. Cell. Biochem. 231: 69 — 74. PubMed DOI:10.1023/A:1014437024129
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization.. Nat. Biotechnol. 24: 1285 — 1292. PubMed DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:646 (англ.). Процитовано 5 жовтня 2018.
UniProt, P10398 (англ.). Процитовано 5 жовтня 2018.
Yuryev A, Ono M, Goff SA, Macaluso F, Wennogle LP (July 2000). Isoform-Specific Localization of A-RAF in Mitochondria. Mol. Cell. Biol. 20 (13): 4870–8. PMC 85938. PMID 10848612. doi:10.1128/MCB.20.13.4870-4878.2000.
Yuryev Anton. Novel raf kinase protein-protein interactions found by an exhaustive yeast two-hybrid analysis / Wennogle Lawrence P // Genomics. — США, 2003. — Т. 81, № 2 (лютий). — С. 112–25. — ISSN 0888-7543. — PMID:12620389.

Див. також

Хромосома X

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:646 (англ.). Процитовано 5 жовтня 2018.

[UniProt-4] UniProt, P10398 (англ.). Процитовано 5 жовтня 2018.

[pmid10848612-5] Yuryev A, Ono M, Goff SA, Macaluso F, Wennogle LP (July 2000). Isoform-Specific Localization of A-RAF in Mitochondria. Mol. Cell. Biol. 20 (13): 4870–8. PMC 85938. PMID 10848612. doi:10.1128/MCB.20.13.4870-4878.2000.

[pmid12620389-6] Yuryev Anton. Novel raf kinase protein-protein interactions found by an exhaustive yeast two-hybrid analysis / Wennogle Lawrence P // Genomics. — США, 2003. — Т. 81, № 2 (лютий). — С. 112–25. — ISSN 0888-7543. — PMID:12620389.