CHAF1A

CHAF1A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1S4Z
Ідентифікатори
Символи	CHAF1A, CAF-1, CAF1, CAF1B, CAF1P150, P150, chromatin assembly factor 1 subunit A
Зовнішні ІД	OMIM: 601246 MGI: 1351331 HomoloGene: 4003 GeneCards: CHAF1A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• unfolded protein binding; • chromatin binding; • GO:0001948 protein binding; • chromo shadow domain binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• CAF-1 complex; • клітинне ядро; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• chromatin assembly; • Реплікація ДНК; • клітинний цикл; • Репарація ДНК; • cellular response to DNA damage stimulus; • DNA replication-dependent chromatin assembly; • nucleosome assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	10036
	27221
	ENSG00000167670
	ENSMUSG00000002835
	Q13111
	Q9QWF0
	NM_005483
	NM_013733
	NP_005474
	NP_038761
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CHAF1A (англ. Chromatin assembly factor 1 subunit A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 956 амінокислот, а молекулярна маса — 106 926[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLEELECGAP	GARGAATAMD	CKDRPAFPVK	KLIQARLPFK	RLNLVPKGKA
DDMSDDQGTS	VQSKSPDLEA	SLDTLENNCH	VGSDIDFRPK	LVNGKGPLDN
FLRNRIETSI	GQSTVIIDLT	EDSNEQPDSL	VDHNKLNSEA	SPSREAINGQ
REDTGDQQGL	LKAIQNDKLA	FPGETLSDIP	CKTEEEGVGC	GGAGRRGDSQ
ECSPRSCPEL	TSGPRMCPRK	EQDSWSEAGG	ILFKGKVPMV	VLQDILAVRP
PQIKSLPATP	QGKNMTPESE	VLESFPEEDS	VLSHSSLSSP	SSTSSPEGPP
APPKQHSSTS	PFPTSTPLRR	ITKKFVKGST	EKNKLRLQRD	QERLGKQLKL
RAEREEKEKL	KEEAKRAKEE	AKKKKEEEKE	LKEKERREKR	EKDEKEKAEK
QRLKEERRKE	RQEALEAKLE	EKRKKEEEKR	LREEEKRIKA	EKAEITRFFQ
KPKTPQAPKT	LAGSCGKFAP	FEIKEHMVLA	PRRRTAFHPD	LCSQLDQLLQ
QQSGEFSFLK	DLKGRQPLRS	GPTHVSTRNA	DIFNSDVVIV	ERGKGDGVPE
RRKFGRMKLL	QFCENHRPAY	WGTWNKKTAL	IRARDPWAQD	TKLLDYEVDS
DEEWEEEEPG	ESLSHSEGDD	DDDMGEDEDE	DDGFFVPHGY	LSEDEGVTEE
CADPENHKVR	QKLKAKEWDE	FLAKGKRFRV	LQPVKIGCVW	AADRDCAGDD
LKVLQQFAAC	FLETLPAQEE	QTPKASKRER	RDEQILAQLL	PLLHGNVNGS
KVIIREFQEH	CRRGLLSNHT	GSPRSPSTTY	LHTPTPSEDA	AIPSKSRLKR
LISENSVYEK	RPDFRMCWYV	HPQVLQSFQQ	EHLPVPCQWS	YVTSVPSAPK
EDSGSVPSTG	PSQGTPISLK	RKSAGSMCIT	QFMKKRRHDG	QIGAEDMDGF
QADTEEEEEE	EGDCMIVDVP	DAAEVQAPCG	AASGAGGGVG	VDTGKATLTS
SPLGAS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Kaufman P.D., Kobayashi R., Kessler N., Stillman B. (1995). The p150 and p60 subunits of chromatin assembly factor I: a molecular link between newly synthesized histones and DNA replication.. Cell 81: 1105 — 1114. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(05)80015-7
Shibahara K., Stillman B. (1999). Replication-dependent marking of DNA by PCNA facilitates CAF-1-coupled inheritance of chromatin.. Cell 96: 575 — 585. PubMed DOI:10.1016/S0092-8674(00)80661-3
Quivy J.-P., Grandi P., Almouzni G. (2001). Dimerization of the largest subunit of chromatin assembly factor 1: importance in vitro and during Xenopus early development.. EMBO J. 20: 2015 — 2027. PubMed DOI:10.1093/emboj/20.8.2015
Reese B.E., Bachman K.E., Baylin S.B., Rountree M.R. (2003). The methyl-CpG binding protein MBD1 interacts with the p150 subunit of chromatin assembly factor 1.. Mol. Cell. Biol. 23: 3226 — 3236. PubMed DOI:10.1128/MCB.23.9.3226-3236.2003
Sarraf S.A., Stancheva I. (2004). Methyl-CpG binding protein MBD1 couples histone H3 methylation at lysine 9 by SETDB1 to DNA replication and chromatin assembly.. Mol. Cell 15: 595 — 605. PubMed DOI:10.1016/j.molcel.2004.06.043

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1910 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, Q13111 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1910 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q13111 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.