CYP1B1

CYP1B1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3PM0
Ідентифікатори
Символи	CYP1B1, CP1B, CYPIB1, GLC3A, P4501B1, cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1, ASGD6
Зовнішні ІД	OMIM: 601771 MGI: 88590 HomoloGene: 68035 GeneCards: CYP1B1
Пов'язані генетичні захворювання
	anterior segment dysgenesis 6[1]
Реагує на сполуку
	chrysin[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• iron ion binding; • oxygen binding; • зв'язування з іоном металу; • heme binding; • oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen; • oxidoreductase activity; • aromatase activity; • oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen; • monooxygenase activity;
Клітинна компонента	• organelle membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • мембрана; • Ендоплазматичний ретикулум; • мітохондрія;
Біологічний процес	• toxin metabolic process; • steroid metabolic process; • retina vasculature development in camera-type eye; • cellular response to organic cyclic compound; • epoxygenase P450 pathway; • endothelial cell-cell adhesion; • omega-hydroxylase P450 pathway; • Ангіогенез; • cellular aromatic compound metabolic process; • sterol metabolic process; • response to toxic substance; • зір; • blood vessel morphogenesis; • trabecular meshwork development; • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • regulation of reactive oxygen species metabolic process; • retinal metabolic process; • endothelial cell migration; • nitric oxide biosynthetic process; • retinol metabolic process; • Адгезія клітин; • negative regulation of cell population proliferation; • positive regulation of apoptotic process; • positive regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT; • negative regulation of cell adhesion mediated by integrin; • xenobiotic metabolic process; • cellular response to hydrogen peroxide; • membrane lipid catabolic process; • retinal blood vessel morphogenesis; • positive regulation of angiogenesis; • positive regulation of vascular endothelial growth factor production; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to oxidative stress; • arachidonic acid metabolic process; • negative regulation of cell migration; • estrogen metabolic process; • collagen fibril organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	1545
	13078
	ENSG00000138061
	ENSMUSG00000024087
	Q16678
	Q64429
	NM_000104
	NM_009994; NM_001364889
	NP_000095
	NP_034124; NP_001351818
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CYP1B1 (англ. Cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 543 амінокислот, а молекулярна маса — 60 846[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGTSLSPNDP	WPLNPLSIQQ	TTLLLLLSVL	ATVHVGQRLL	RQRRRQLRSA
PPGPFAWPLI	GNAAAVGQAA	HLSFARLARR	YGDVFQIRLG	SCPIVVLNGE
RAIHQALVQQ	GSAFADRPAF	ASFRVVSGGR	SMAFGHYSEH	WKVQRRAAHS
MMRNFFTRQP	RSRQVLEGHV	LSEARELVAL	LVRGSADGAF	LDPRPLTVVA
VANVMSAVCF	GCRYSHDDPE	FRELLSHNEE	FGRTVGAGSL	VDVMPWLQYF
PNPVRTVFRE	FEQLNRNFSN	FILDKFLRHC	ESLRPGAAPR	DMMDAFILSA
EKKAAGDSHG	GGARLDLENV	PATITDIFGA	SQDTLSTALQ	WLLLLFTRYP
DVQTRVQAEL	DQVVGRDRLP	CMGDQPNLPY	VLAFLYEAMR	FSSFVPVTIP
HATTANTSVL	GYHIPKDTVV	FVNQWSVNHD	PLKWPNPENF	DPARFLDKDG
LINKDLTSRV	MIFSVGKRRC	IGEELSKMQL	FLFISILAHQ	CDFRANPNEP
AKMNFSYGLT	IKPKSFKVNV	TLRESMELLD	SAVQNLQAKE	TCQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, гемом. Локалізований у мембрані, мітохондрії, ендоплазматичному ретикулумі, мікросомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Choudhary D., Jansson I., Stoilov I., Sarfarazi M., Schenkman J.B. (2004). Metabolism of retinoids and arachidonic acid by human and mouse cytochrome P450 1b1.. Drug Metab. Dispos. 32: 840 — 847. PubMed DOI:10.1124/dmd.32.8.840
Nishida C.R., Everett S., Ortiz de Montellano P.R. (2013). Specificity determinants of CYP1B1 estradiol hydroxylation.. Mol. Pharmacol. 84: 451 — 458. PubMed DOI:10.1124/mol.113.087700
Wang A., Savas U., Stout C.D., Johnson E.F. (2011). Structural characterization of the complex between alpha-naphthoflavone and human cytochrome P450 1B1.. J. Biol. Chem. 286: 5736 — 5743. PubMed DOI:10.1074/jbc.M110.204420
Ohtake Y., Kubota R., Tanino T., Miyata H., Mashima Y. (2000). Novel compound heterozygous mutations in the cytochrome P4501B1 gene (CYP1B1) in a Japanese patient with primary congenital glaucoma.. Ophthalmic Genet. 21: 191 — 193. PubMed DOI:10.1076/1381-6810(200009)2131-ZFT191
Chakrabarti S., Komatireddy S., Mandal A.K., Balasubramanian D. (2003). Gene symbol: CYP1B1. Disease: glaucoma, primary congenital.. Hum. Genet. 113: 556 — 558. PubMed DOI:10.1007/s00439-003-1035-0

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з CYP1B1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Сполуки, які фізично взаємодіють з Cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2597 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.
UniProt, Q16678 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CYP1B1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Cytochrome P450 family 1 subfamily B member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2597 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-6] UniProt, Q16678 (англ.). Процитовано 28 серпня 2017.