CYP2D6

CYP2D6
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2F9Q, 3QM4, 3TBG, 3TDA, 4WNT, 4WNU, 4WNV, 4WNW, 4XRY, 4XRZ
Ідентифікатори
Символи	CYP2D6, CPD6, CYP2D, CYP2D7AP, CYP2D7BP, CYP2D7P2, CYP2D8P2, CYP2DL1, CYPIID6, P450-DB1, P450C2D, P450DB1, cytochrome P450 family 2 subfamily D member 6, Cytochrome P450 2D6
Зовнішні ІД	OMIM: 124030 HomoloGene: 133550 GeneCards: CYP2D6
Реагує на сполуку
	raubasine[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• iron ion binding; • зв'язування з іоном металу; • heme binding; • oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen; • oxidoreductase activity; • aromatase activity; • oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen; • steroid hydroxylase activity; • monooxygenase activity;
Клітинна компонента	• organelle membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • ендоплазматичний ретикулум; • мітохондрія; • цитоплазма;
Біологічний процес	• steroid metabolic process; • alkaloid metabolic process; • coumarin metabolic process; • lipid metabolism; • isoquinoline alkaloid metabolic process; • alkaloid catabolic process; • oxidative demethylation; • heterocycle metabolic process; • negative regulation of binding; • monoterpenoid metabolic process; • xenobiotic metabolic process; • arachidonic acid metabolic process; • negative regulation of cellular organofluorine metabolic process; • long-chain fatty acid biosynthetic process; • organic acid metabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	1565
	24303
ENSG00000100197; ENSG00000275211; ENSG00000280905; ENSG00000282966; ENSG00000283284;
	ENSG00000272532
	ENSRNOG00000029179
	P10635
	P12938
	NM_000106; NM_001025161
	NM_173093
	NP_000097; NP_001020332
	NP_775116
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CYP2D6 (англ. Cytochrome P450 family 2 subfamily D member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 497 амінокислот, а молекулярна маса — 55 769[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGLEALVPLA	VIVAIFLLLV	DLMHRRQRWA	ARYPPGPLPL	PGLGNLLHVD
FQNTPYCFDQ	LRRRFGDVFS	LQLAWTPVVV	LNGLAAVREA	LVTHGEDTAD
RPPVPITQIL	GFGPRSQGVF	LARYGPAWRE	QRRFSVSTLR	NLGLGKKSLE
QWVTEEAACL	CAAFANHSGR	PFRPNGLLDK	AVSNVIASLT	CGRRFEYDDP
RFLRLLDLAQ	EGLKEESGFL	REVLNAVPVL	LHIPALAGKV	LRFQKAFLTQ
LDELLTEHRM	TWDPAQPPRD	LTEAFLAEME	KAKGNPESSF	NDENLRIVVA
DLFSAGMVTT	STTLAWGLLL	MILHPDVQRR	VQQEIDDVIG	QVRRPEMGDQ
AHMPYTTAVI	HEVQRFGDIV	PLGVTHMTSR	DIEVQGFRIP	KGTTLITNLS
SVLKDEAVWE	KPFRFHPEHF	LDAQGHFVKP	EAFLPFSAGR	RACLGEPLAR
MELFLFFTSL	LQHFSFSVPT	GQPRPSHHGV	FAFLVSPSPY	ELCAVPR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм ліпідів, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, гемом. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, мікросомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Evert B., Griese E.U., Eichelbaum M. (1994). A missense mutation in exon 6 of the CYP2D6 gene leading to a histidine 324 to proline exchange is associated with the poor metabolizer phenotype of sparteine.. Naunyn Schmiedebergs Arch. Pharmacol. 350: 434 — 439. PubMed DOI:10.1007/BF00178963
Daly A.K., Leathart J.B., London S.J., Idle J.R. (1995). An inactive cytochrome P450 CYP2D6 allele containing a deletion and a base substitution.. Hum. Genet. 95: 337 — 341. PubMed DOI:10.1007/BF00225204
Masimirembwa C., Persson I., Bertilsson L., Hasler J., Ingelman-Sundberg M. (1996). A novel mutant variant of the CYP2D6 gene (CYP2D6*17) common in a black African population: association with diminished debrisoquine hydroxylase activity.. Br. J. Clin. Pharmacol. 42: 713 — 719. PubMed DOI:10.1046/j.1365-2125.1996.00489.x
Kimura S., Umeno M., Skoda R.C., Meyer U.A., Gonzalez F.J. (1989). The human debrisoquine 4-hydroxylase (CYP2D) locus: sequence and identification of the polymorphic CYP2D6 gene, a related gene, and a pseudogene.. Am. J. Hum. Genet. 45: 889 — 904. PubMed
Wang S.L., Lai M.D., Huang J.D. (1999). G169R mutation diminishes the metabolic activity of CYP2D6 in Chinese.. Drug Metab. Dispos. 27: 385 — 388. PubMed

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з CYP2D6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2625 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P10635 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 22

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з CYP2D6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2625 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P10635 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.