DROSHA
DROSHA (англ. Drosha ribonuclease III) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 374 амінокислот, а молекулярна маса — 159 316[4].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MMQGNTCHRM | SFHPGRGCPR | GRGGHGARPS | APSFRPQNLR | LLHPQQPPVQ | ||||
YQYEPPSAPS | TTFSNSPAPN | FLPPRPDFVP | FPPPMPPSAQ | GPLPPCPIRP | ||||
PFPNHQMRHP | FPVPPCFPPM | PPPMPCPNNP | PVPGAPPGQG | TFPFMMPPPS | ||||
MPHPPPPPVM | PQQVNYQYPP | GYSHHNFPPP | SFNSFQNNPS | SFLPSANNSS | ||||
SPHFRHLPPY | PLPKAPSERR | SPERLKHYDD | HRHRDHSHGR | GERHRSLDRR | ||||
ERGRSPDRRR | QDSRYRSDYD | RGRTPSRHRS | YERSRERERE | RHRHRDNRRS | ||||
PSLERSYKKE | YKRSGRSYGL | SVVPEPAGCT | PELPGEIIKN | TDSWAPPLEI | ||||
VNHRSPSREK | KRARWEEEKD | RWSDNQSSGK | DKNYTSIKEK | EPEETMPDKN | ||||
EEEEEELLKP | VWIRCTHSEN | YYSSDPMDQV | GDSTVVGTSR | LRDLYDKFEE | ||||
ELGSRQEKAK | AARPPWEPPK | TKLDEDLESS | SESECESDED | STCSSSSDSE | ||||
VFDVIAEIKR | KKAHPDRLHD | ELWYNDPGQM | NDGPLCKCSA | KARRTGIRHS | ||||
IYPGEEAIKP | CRPMTNNAGR | LFHYRITVSP | PTNFLTDRPT | VIEYDDHEYI | ||||
FEGFSMFAHA | PLTNIPLCKV | IRFNIDYTIH | FIEEMMPENF | CVKGLELFSL | ||||
FLFRDILELY | DWNLKGPLFE | DSPPCCPRFH | FMPRFVRFLP | DGGKEVLSMH | ||||
QILLYLLRCS | KALVPEEEIA | NMLQWEELEW | QKYAEECKGM | IVTNPGTKPS | ||||
SVRIDQLDRE | QFNPDVITFP | IIVHFGIRPA | QLSYAGDPQY | QKLWKSYVKL | ||||
RHLLANSPKV | KQTDKQKLAQ | REEALQKIRQ | KNTMRREVTV | ELSSQGFWKT | ||||
GIRSDVCQHA | MMLPVLTHHI | RYHQCLMHLD | KLIGYTFQDR | CLLQLAMTHP | ||||
SHHLNFGMNP | DHARNSLSNC | GIRQPKYGDR | KVHHMHMRKK | GINTLINIMS | ||||
RLGQDDPTPS | RINHNERLEF | LGDAVVEFLT | SVHLYYLFPS | LEEGGLATYR | ||||
TAIVQNQHLA | MLAKKLELDR | FMLYAHGPDL | CRESDLRHAM | ANCFEALIGA | ||||
VYLEGSLEEA | KQLFGRLLFN | DPDLREVWLN | YPLHPLQLQE | PNTDRQLIET | ||||
SPVLQKLTEF | EEAIGVIFTH | VRLLARAFTL | RTVGFNHLTL | GHNQRMEFLG | ||||
DSIMQLVATE | YLFIHFPDHH | EGHLTLLRSS | LVNNRTQAKV | AEELGMQEYA | ||||
ITNDKTKRPV | ALRTKTLADL | LESFIAALYI | DKDLEYVHTF | MNVCFFPRLK | ||||
EFILNQDWND | PKSQLQQCCL | TLRTEGKEPD | IPLYKTLQTV | GPSHARTYTV | ||||
AVYFKGERIG | CGKGPSIQQA | EMGAAMDALE | KYNFPQMAHQ | KRFIERKYRQ | ||||
ELKEMRWERE | HQEREPDETE | DIKK |
DROSHA за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез рибосом, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію, РНК, іоном марганцю. Локалізований у ядрі.
Література
- Wu H., Xu H., Miraglia L.J., Crooke S.T. (2000). Human RNase III is a 160-kDa protein involved in preribosomal RNA processing.. J. Biol. Chem. 275: 36957 — 36965. PubMed DOI:10.1074/jbc.M005494200
- Gunther M., Laithier M., Brison O. (2000). A set of proteins interacting with transcription factor Sp1 identified in a two-hybrid screening.. Mol. Cell. Biochem. 210: 131 — 142. PubMed DOI:10.1023/A:1007177623283
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- Landthaler M., Yalcin A., Tuschl T. (2004). The human DiGeorge syndrome critical region gene 8 and its D. melanogaster homolog are required for miRNA biogenesis.. Curr. Biol. 14: 2162 — 2167. PubMed DOI:10.1016/j.cub.2004.11.001
- Zeng Y., Yi R., Cullen B.R. (2005). Recognition and cleavage of primary microRNA precursors by the nuclear processing enzyme Drosha.. EMBO J. 24: 138 — 148. PubMed DOI:10.1038/sj.emboj.7600491
- Faller M., Matsunaga M., Yin S., Loo J.A., Guo F. (2007). Heme is involved in microRNA processing.. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 23 — 29. PubMed DOI:10.1038/nsmb1182
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17904 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.
- UniProt, Q9NRR4 (англ.). Процитовано 5 вересня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.