FEN1

FEN1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1U7B, 1UL1, 3Q8K, 3Q8L, 3Q8M, 3UVU, 5E0V
Ідентифікатори
Символи	FEN1, Flap endonuclease 1, flap structure-specific endonuclease 1, FEN-1, MF1, RAD2
Зовнішні ІД	OMIM: 600393 MGI: 102779 HomoloGene: 3034 GeneCards: FEN1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу; • RNA-DNA hybrid ribonuclease activity; • hydrolase activity, acting on ester bonds; • nuclease activity; • hydrolase activity; • double-stranded DNA binding; • каталітична активність; • damaged DNA binding; • double-stranded DNA exodeoxyribonuclease activity; • GO:0001948 protein binding; • DNA binding; • endonuclease activity; • exonuclease activity; • 5'-3' exonuclease activity; • 5'-flap endonuclease activity; • flap endonuclease activity; • magnesium ion binding; • manganese ion binding;
Клітинна компонента	• мітохондрія; • клітинне ядро; • мембрана; • Нуклеоплазма; • Ядерце; • protein-containing complex;
Біологічний процес	• double-strand break repair via homologous recombination; • double-strand break repair; • пам'ять; • cellular response to DNA damage stimulus; • UV protection; • Реплікація ДНК; • Репарація ДНК; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic; • DNA replication, removal of RNA primer; • positive regulation of sister chromatid cohesion; • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis; • telomere maintenance via semi-conservative replication; • base-excision repair; • apoptotic DNA fragmentation; • retina development in camera-type eye;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	2237
	14156
	ENSG00000168496
	ENSMUSG00000024742
	P39748
	P39749
	NM_004111
	NM_001271614; NM_001271615; NM_007999
	NP_004102
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

FEN1 (англ. Flap structure-specific endonuclease 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 380 амінокислот, а молекулярна маса — 42 593[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGIQGLAKLI	ADVAPSAIRE	NDIKSYFGRK	VAIDASMSIY	QFLIAVRQGG
DVLQNEEGET	TSHLMGMFYR	TIRMMENGIK	PVYVFDGKPP	QLKSGELAKR
SERRAEAEKQ	LQQAQAAGAE	QEVEKFTKRL	VKVTKQHNDE	CKHLLSLMGI
PYLDAPSEAE	ASCAALVKAG	KVYAAATEDM	DCLTFGSPVL	MRHLTASEAK
KLPIQEFHLS	RILQELGLNQ	EQFVDLCILL	GSDYCESIRG	IGPKRAVDLI
QKHKSIEEIV	RRLDPNKYPV	PENWLHKEAH	QLFLEPEVLD	PESVELKWSE
PNEEELIKFM	CGEKQFSEER	IRSGVKRLSK	SRQGSTQGRL	DDFFKVTGSL
SSAKRKEPEP	KGSTKKKAKT	GAAGKFKRGK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію. Локалізований у ядрі, мітохондрії.

Література

Hiraoka L.R., Harrington J.J., Gerhard D.S., Lieber M.R., Hsieh C.-L. (1995). Sequence of human FEN-1, a structure-specific endonuclease, and chromosomal localization of the gene (FEN1) in mouse and human.. Genomics 25: 220 — 225. PubMed DOI:10.1016/0888-7543(95)80129-A
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Shen B., Nolan J.P., Sklar L.A., Park M.S. (1996). Essential amino acids for substrate binding and catalysis of human flap endonuclease 1.. J. Biol. Chem. 271: 9173 — 9176. PubMed DOI:10.1074/jbc.271.16.9173
Gary R., Ludwig D.L., Cornelius H.L., MacInnes M.A., Park M.S. (1997). The DNA repair endonuclease XPG binds to proliferating cell nuclear antigen (PCNA) and shares sequence elements with the PCNA-binding regions of FEN-1 and cyclin-dependent kinase inhibitor p21.. J. Biol. Chem. 272: 24522 — 24529. PubMed DOI:10.1074/jbc.272.39.24522
Tom S., Henricksen L.A., Bambara R.A. (2000). Mechanism whereby proliferating cell nuclear antigen stimulates flap endonuclease 1.. J. Biol. Chem. 275: 10498 — 10505. PubMed DOI:10.1074/jbc.275.14.10498
Qiu J., Bimston D.N., Partikian A., Shen B. (2002). Arginine residues 47 and 70 of human flap endonuclease-1 are involved in DNA substrate interactions and cleavage site determination.. J. Biol. Chem. 277: 24659 — 24666. PubMed DOI:10.1074/jbc.M111941200

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3650 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, P39748 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3650 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P39748 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.