H2AFX

H2AFX
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2D31, 2DYP, 3SHV, 3SQD, 3SZM, 1YDP, 2AZM, 3U3Z
Ідентифікатори
Символи	H2AX, H2A.X, H2A/X, H2A histone family member X, H2A.X variant histone, H2AFX
Зовнішні ІД	OMIM: 601772 MGI: 102688 HomoloGene: 134201 GeneCards: H2AX
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • histone binding; • GO:0001948 protein binding; • protein heterodimerization activity; • enzyme binding; • damaged DNA binding;
Клітинна компонента	• Нуклеоплазма; • хромосома; • Теломера; • Нуклеосома; • Екзосома; • nuclear speck; • центросома; • клітинне ядро; • site of double-strand break; • Хроматин; • condensed nuclear chromosome; • male germ cell nucleus; • XY body; • replication fork; • site of DNA damage;
Біологічний процес	• response to ionizing radiation; • nucleosome assembly; • DNA recombination; • DNA damage checkpoint signaling; • positive regulation of DNA repair; • cellular response to DNA damage stimulus; • клітинне старіння; • GO:0007126 Мейоз; • cellular response to gamma radiation; • Сперматогенез; • cerebral cortex development; • Клітинний цикл; • GO:0022415 viral process; • double-strand break repair via nonhomologous end joining; • double-strand break repair; • Репарація ДНК; • double-strand break repair via homologous recombination; • chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3014
	15270
	ENSG00000188486
	ENSMUSG00000049932
	P16104
	P27661
	NM_002105
	NM_010436
	NP_002096
	NP_034566
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

H2AFX (англ. H2A histone family member X) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 143 амінокислот, а молекулярна маса — 15 145[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGRGKTGGK	ARAKAKSRSS	RAGLQFPVGR	VHRLLRKGHY	AERVGAGAPV
YLAAVLEYLT	AEILELAGNA	ARDNKKTRII	PRHLQLAIRN	DEELNKLLGG
VTIAQGGVLP	NIQAVLLPKK	TSATVGPKAP	SGGKKATQAS	QEY

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, клітинний цикл, пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, мейоз, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Mannironi C., Bonner W.M., Hatch C.L. (1989). H2A.X. a histone isoprotein with a conserved C-terminal sequence, is encoded by a novel mRNA with both DNA replication type and polyA 3' processing signals.. Nucleic Acids Res. 17: 9113 — 9126. PubMed DOI:10.1093/nar/17.22.9113
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Rogakou E.P., Pilch D.R., Orr A.H., Ivanova V.S., Bonner W.M. (1998). DNA double-stranded breaks induce histone H2AX phosphorylation on serine 139.. J. Biol. Chem. 273: 5858 — 5868. PubMed DOI:10.1074/jbc.273.10.5858
Rogakou E.P., Boon C., Redon C., Bonner W.M. (1999). Megabase chromatin domains involved in DNA double-strand breaks in vivo.. J. Cell Biol. 146: 905 — 916. PubMed DOI:10.1083/jcb.146.5.905
Rogakou E.P., Nieves-Neira W., Boon C., Pommier Y., Bonner W.M. (2000). Initiation of DNA fragmentation during apoptosis induces phosphorylation of H2AX histone at serine 139.. J. Biol. Chem. 275: 9390 — 9395. PubMed DOI:10.1074/jbc.275.13.9390
Ward I.M., Chen J. (2001). Histone H2AX is phosphorylated in an ATR-dependent manner in response to replicational stress.. J. Biol. Chem. 276: 47759 — 47762. PubMed DOI:10.1074/jbc.C100569200

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4739 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, P16104 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4739 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P16104 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.