KDM6B
KDM6B (англ. Lysine demethylase 6B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 643 амінокислот, а молекулярна маса — 176 632[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MHRAVDPPGA | RAAREAFALG | GLSCAGAWSS | CPPHPPPRSA | WLPGGRCSAS | ||||
| IGQPPLPAPL | PPSHGSSSGH | PSKPYYAPGA | PTPRPLHGKL | ESLHGCVQAL | ||||
| LREPAQPGLW | EQLGQLYESE | HDSEEATRCY | HSALRYGGSF | AELGPRIGRL | ||||
| QQAQLWNFHT | GSCQHRAKVL | PPLEQVWNLL | HLEHKRNYGA | KRGGPPVKRA | ||||
| AEPPVVQPVP | PAALSGPSGE | EGLSPGGKRR | RGCNSEQTGL | PPGLPLPPPP | ||||
| LPPPPPPPPP | PPPPLPGLAT | SPPFQLTKPG | LWSTLHGDAW | GPERKGSAPP | ||||
| ERQEQRHSLP | HPYPYPAPAY | TAHPPGHRLV | PAAPPGPGPR | PPGAESHGCL | ||||
| PATRPPGSDL | RESRVQRSRM | DSSVSPAATT | ACVPYAPSRP | PGLPGTTTSS | ||||
| SSSSSSNTGL | RGVEPNPGIP | GADHYQTPAL | EVSHHGRLGP | SAHSSRKPFL | ||||
| GAPAATPHLS | LPPGPSSPPP | PPCPRLLRPP | PPPAWLKGPA | CRAAREDGEI | ||||
| LEELFFGTEG | PPRPAPPPLP | HREGFLGPPA | SRFSVGTQDS | HTPPTPPTPT | ||||
| TSSSNSNSGS | HSSSPAGPVS | FPPPPYLARS | IDPLPRPPSP | AQNPQDPPLV | ||||
| PLTLALPPAP | PSSCHQNTSG | SFRRPESPRP | RVSFPKTPEV | GPGPPPGPLS | ||||
| KAPQPVPPGV | GELPARGPRL | FDFPPTPLED | QFEEPAEFKI | LPDGLANIMK | ||||
| MLDESIRKEE | EQQQHEAGVA | PQPPLKEPFA | SLQSPFPTDT | APTTTAPAVA | ||||
| VTTTTTTTTT | TTATQEEEKK | PPPALPPPPP | LAKFPPPSQP | QPPPPPPPSP | ||||
| ASLLKSLASV | LEGQKYCYRG | TGAAVSTRPG | PLPTTQYSPG | PPSGATALPP | ||||
| TSAAPSAQGS | PQPSASSSSQ | FSTSGGPWAR | ERRAGEEPVP | GPMTPTQPPP | ||||
| PLSLPPARSE | SEVLEEISRA | CETLVERVGR | SATDPADPVD | TAEPADSGTE | ||||
| RLLPPAQAKE | EAGGVAAVSG | SCKRRQKEHQ | KEHRRHRRAC | KDSVGRRPRE | ||||
| GRAKAKAKVP | KEKSRRVLGN | LDLQSEEIQG | REKSRPDLGG | ASKAKPPTAP | ||||
| APPSAPAPSA | QPTPPSASVP | GKKAREEAPG | PPGVSRADML | KLRSLSEGPP | ||||
| KELKIRLIKV | ESGDKETFIA | SEVEERRLRM | ADLTISHCAA | DVVRASRNAK | ||||
| VKGKFRESYL | SPAQSVKPKI | NTEEKLPREK | LNPPTPSIYL | ESKRDAFSPV | ||||
| LLQFCTDPRN | PITVIRGLAG | SLRLNLGLFS | TKTLVEASGE | HTVEVRTQVQ | ||||
| QPSDENWDLT | GTRQIWPCES | SRSHTTIAKY | AQYQASSFQE | SLQEEKESED | ||||
| EESEEPDSTT | GTPPSSAPDP | KNHHIIKFGT | NIDLSDAKRW | KPQLQELLKL | ||||
| PAFMRVTSTG | NMLSHVGHTI | LGMNTVQLYM | KVPGSRTPGH | QENNNFCSVN | ||||
| INIGPGDCEW | FAVHEHYWET | ISAFCDRHGV | DYLTGSWWPI | LDDLYASNIP | ||||
| VYRFVQRPGD | LVWINAGTVH | WVQATGWCNN | IAWNVGPLTA | YQYQLALERY | ||||
| EWNEVKNVKS | IVPMIHVSWN | VARTVKISDP | DLFKMIKFCL | LQSMKHCQVQ | ||||
| RESLVRAGKK | IAYQGRVKDE | PAYYCNECDV | EVFNILFVTS | ENGSRNTYLV | ||||
| HCEGCARRRS | AGLQGVVVLE | QYRTEELAQA | YDAFTLAPAS | TSR |
Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
- Hu L.Y., Tepper C.G., Lo S.H., Lin W.C. (2006). An efficient strategy to identify early TPA-responsive genes during differentiation of HL-60 cells.. Gene Expr. 13: 179 — 189. PubMed DOI:10.3727/000000006783991791
Примітки
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29012 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
- UniProt, O15054 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.