MSH6

MSH6 (англ. MutS homolog 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 360 амінокислот, а молекулярна маса — 152 786[5].

MSH6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2O8F, 2GFU, 2O8B, 2O8C, 2O8D, 2O8E
Ідентифікатори
Символи	MSH6, mutS homolog 6, GTBP, GTMBP, HNPCC5, HSAP, p160, MMRCS3
Зовнішні ІД	OMIM: 600678 MGI: 1343961 HomoloGene: 149 GeneCards: MSH6
Пов'язані генетичні захворювання
Mismatch repair cancer syndrome, колоректальний рак, Спадковий неполіпозний колоректальний рак[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • DNA binding • protein homodimerization activity • mismatched DNA binding • ADP binding • chromatin binding • oxidized purine DNA binding • methylated histone binding • damaged DNA binding • ATPase activity • GO:0001948 protein binding • single thymine insertion binding • four-way junction DNA binding • MutLalpha complex binding • double-stranded DNA binding • ATP binding • magnesium ion binding • single guanine insertion binding • guanine/thymine mispair binding • ATP-dependent activity, acting on DNA • enzyme binding Клітинна компонента • комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинна мембранна органела • MutSalpha complex • Нуклеоплазма • хромосома • клітинне ядро • гіалоплазма • mismatch repair complex Біологічний процес • determination of adult lifespan • cellular response to DNA damage stimulus • positive regulation of isotype switching • intrinsic apoptotic signaling pathway • maintenance of DNA repeat elements • positive regulation of helicase activity • somatic recombination of immunoglobulin gene segments • negative regulation of DNA recombination • mismatch repair • GO:0022415 viral process • Репарація ДНК • meiotic mismatch repair • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • response to UV • somatic hypermutation of immunoglobulin genes • Перемикання класу імуноглобулінів • pyrimidine dimer repair • mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling • negative regulation of DNA endoreduplication • interstrand cross-link repair • replication fork arrest Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2956	17688
Ensembl	ENSG00000116062	ENSMUSG00000005370
UniProt	P52701	P54276
RefSeq (мРНК)	NM_000179 NM_001281492 NM_001281493 NM_001281494	NM_010830
RefSeq (білок)	NP_000170 NP_001268421 NP_001268422 NP_001268423	NP_034960
Локус (UCSC)	Хр. 2: 47.7 – 47.81 Mb	Хр. 17: 87.98 – 87.99 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.