SMARCA4

SMARCA4 (англ. SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 647 амінокислот, а молекулярна маса — 184 646[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSTPDPPLGGTPRPGPSPGPGPSPGAMLGPSPGPSPGSAHSMMGPSPGPP
SAGHPIPTQGPGGYPQDNMHQMHKPMESMHEKGMSDDPRYNQMKGMGMRS
GGHAGMGPPPSPMDQHSQGYPSPLGGSEHASSPVPASGPSSGPQMSSGPG
GAPLDGADPQALGQQNRGPTPFNQNQLHQLRAQIMAYKMLARGQPLPDHL
QMAVQGKRPMPGMQQQMPTLPPPSVSATGPGPGPGPGPGPGPGPAPPNYS
RPHGMGGPNMPPPGPSGVPPGMPGQPPGGPPKPWPEGPMANAAAPTSTPQ
KLIPPQPTGRPSPAPPAVPPAASPVMPPQTQSPGQPAQPAPMVPLHQKQS
RITPIQKPRGLDPVEILQEREYRLQARIAHRIQELENLPGSLAGDLRTKA
TIELKALRLLNFQRQLRQEVVVCMRRDTALETALNAKAYKRSKRQSLREA
RITEKLEKQQKIEQERKRRQKHQEYLNSILQHAKDFKEYHRSVTGKIQKL
TKAVATYHANTEREQKKENERIEKERMRRLMAEDEEGYRKLIDQKKDKRL
AYLLQQTDEYVANLTELVRQHKAAQVAKEKKKKKKKKKAENAEGQTPAIG
PDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYE
VAPRSDSEESGSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSE
VDARHIIENAKQDVDDEYGVSQALARGLQSYYAVAHAVTERVDKQSALMV
NGVLKQYQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHK
RINGPFLIIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAARRAFVPQLRS
GKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTH
YVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLNFLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMT
GEKVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEAQLPEKVEYVIKCDM
SALQRVLYRHMQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKICNHPY
MFQHIEESFSEHLGFTGGIVQGLDLYRASGKFELLDRILPKLRATNHKVL
LFCQMTSLMTIMEDYFAYRGFKYLRLDGTTKAEDRGMLLKTFNEPGSEYF
IFLLSTRAGGLGLNLQSADTVIIFDSDWNPHQDLQAQDRAHRIGQQNEVR
VLRLCTVNSVEEKILAAAKYKLNVDQKVIQAGMFDQKSSSHERRAFLQAI
LEHEEQDESRHCSTGSGSASFAHTAPPPAGVNPDLEEPPLKEEDEVPDDE
TVNQMIARHEEEFDLFMRMDLDRRREEARNPKRKPRLMEEDELPSWIIKD
DAEVERLTCEEEEEKMFGRGSRHRKEVDYSDSLTEKQWLKAIEEGTLEEI
EEEVRQKKSSRKRKRDSDAGSSTPTTSTRSRDKDDESKKQKKRGRPPAEK
LSPNPPNLTKKMKKIVDAVIKYKDSSSGRQLSEVFIQLPSRKELPEYYEL
IRKPVDFKKIKERIRNHKYRSLNDLEKDVMLLCQNAQTFNLEGSLIYEDS
IVLQSVFTSVRQKIEKEDDSEGEESEEEEEGEEEGSESESRSVKVKIKLG
RKEKAQDRLKGGRRRPSRGSRAKPVVSDDDSEEEQEEDRSGSGSEED
SMARCA4
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи SMARCA4, BAF190, BAF190A, BRG1, MRD16, RTPS2, SNF2, SNF2L4, SNF2LB, SWI2, hSNF2b, CSS4, SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 4
Зовнішні ІД OMIM: 603254 MGI: 88192 HomoloGene: 135927 GeneCards: SMARCA4
Пов'язані генетичні захворювання
ішемічна хвороба серця, Coffin-Siris syndrome 4[1]
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6597
20586
Ensembl
ENSG00000127616
ENSMUSG00000032187
UniProt
P51532
Q9HBD4
Q3TKT4
RefSeq (мРНК)
NM_001174078
NM_001174079
NM_011417
NM_001357764
RefSeq (білок)
NP_001167549
NP_001167550
NP_035547
NP_001344693
Локус (UCSC) Хр. 19: 10.96 – 11.07 Mb Хр. 9: 21.62 – 21.7 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, активаторів, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, нейрогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

  • Khavari P.A., Peterson C.L., Tamkun J.W., Mendel D.B., Crabtree G.R. (1993). BRG1 contains a conserved domain of the SWI2/SNF2 family necessary for normal mitotic growth and transcription.. Nature 366: 170 — 174. PubMed DOI:10.1038/366170a0
  • Chiba H., Muramatsu M., Nomoto A., Kato H. (1994). Two human homologues of Saccharomyces cerevisiae SWI2/SNF2 and Drosophila brahma are transcriptional coactivators cooperating with the estrogen receptor and the retinoic acid receptor.. Nucleic Acids Res. 22: 1815 — 1820. PubMed DOI:10.1093/nar/22.10.1815
  • Fryer C.J., Archer T.K. (1998). Chromatin remodelling by the glucocorticoid receptor requires the BRG1 complex.. Nature 393: 88 — 91. PubMed DOI:10.1038/30032
  • Park J., Wood M.A., Cole M.D. (2002). BAF53 forms distinct nuclear complexes and functions as a critical c-Myc-interacting nuclear cofactor for oncogenic transformation.. Mol. Cell. Biol. 22: 1307 — 1316. PubMed DOI:10.1128/MCB.22.5.1307-1316.2002
  • Hsiao P.W., Fryer C.J., Trotter K.W., Wang W., Archer T.K. (2003). BAF60a mediates critical interactions between nuclear receptors and the BRG1 chromatin-remodeling complex for transactivation.. Mol. Cell. Biol. 23: 6210 — 6220. PubMed DOI:10.1128/MCB.23.17.6210-6220.2003
  • Liu K., Luo Y., Lin F.-T., Lin W.-C. (2004). TopBP1 recruits Brg1/Brm to repress E2F1-induced apoptosis, a novel pRb-independent and E2F1-specific control for cell survival.. Genes Dev. 18: 673 — 686. PubMed DOI:10.1101/gad.1180204

Примітки

Див. також

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.