SMARCA4
SMARCA4 (англ. SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 647 амінокислот, а молекулярна маса — 184 646[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSTPDPPLGG | TPRPGPSPGP | GPSPGAMLGP | SPGPSPGSAH | SMMGPSPGPP | ||||
SAGHPIPTQG | PGGYPQDNMH | QMHKPMESMH | EKGMSDDPRY | NQMKGMGMRS | ||||
GGHAGMGPPP | SPMDQHSQGY | PSPLGGSEHA | SSPVPASGPS | SGPQMSSGPG | ||||
GAPLDGADPQ | ALGQQNRGPT | PFNQNQLHQL | RAQIMAYKML | ARGQPLPDHL | ||||
QMAVQGKRPM | PGMQQQMPTL | PPPSVSATGP | GPGPGPGPGP | GPGPAPPNYS | ||||
RPHGMGGPNM | PPPGPSGVPP | GMPGQPPGGP | PKPWPEGPMA | NAAAPTSTPQ | ||||
KLIPPQPTGR | PSPAPPAVPP | AASPVMPPQT | QSPGQPAQPA | PMVPLHQKQS | ||||
RITPIQKPRG | LDPVEILQER | EYRLQARIAH | RIQELENLPG | SLAGDLRTKA | ||||
TIELKALRLL | NFQRQLRQEV | VVCMRRDTAL | ETALNAKAYK | RSKRQSLREA | ||||
RITEKLEKQQ | KIEQERKRRQ | KHQEYLNSIL | QHAKDFKEYH | RSVTGKIQKL | ||||
TKAVATYHAN | TEREQKKENE | RIEKERMRRL | MAEDEEGYRK | LIDQKKDKRL | ||||
AYLLQQTDEY | VANLTELVRQ | HKAAQVAKEK | KKKKKKKKAE | NAEGQTPAIG | ||||
PDGEPLDETS | QMSDLPVKVI | HVESGKILTG | TDAPKAGQLE | AWLEMNPGYE | ||||
VAPRSDSEES | GSEEEEEEEE | EEQPQAAQPP | TLPVEEKKKI | PDPDSDDVSE | ||||
VDARHIIENA | KQDVDDEYGV | SQALARGLQS | YYAVAHAVTE | RVDKQSALMV | ||||
NGVLKQYQIK | GLEWLVSLYN | NNLNGILADE | MGLGKTIQTI | ALITYLMEHK | ||||
RINGPFLIIV | PLSTLSNWAY | EFDKWAPSVV | KVSYKGSPAA | RRAFVPQLRS | ||||
GKFNVLLTTY | EYIIKDKHIL | AKIRWKYMIV | DEGHRMKNHH | CKLTQVLNTH | ||||
YVAPRRLLLT | GTPLQNKLPE | LWALLNFLLP | TIFKSCSTFE | QWFNAPFAMT | ||||
GEKVDLNEEE | TILIIRRLHK | VLRPFLLRRL | KKEVEAQLPE | KVEYVIKCDM | ||||
SALQRVLYRH | MQAKGVLLTD | GSEKDKKGKG | GTKTLMNTIM | QLRKICNHPY | ||||
MFQHIEESFS | EHLGFTGGIV | QGLDLYRASG | KFELLDRILP | KLRATNHKVL | ||||
LFCQMTSLMT | IMEDYFAYRG | FKYLRLDGTT | KAEDRGMLLK | TFNEPGSEYF | ||||
IFLLSTRAGG | LGLNLQSADT | VIIFDSDWNP | HQDLQAQDRA | HRIGQQNEVR | ||||
VLRLCTVNSV | EEKILAAAKY | KLNVDQKVIQ | AGMFDQKSSS | HERRAFLQAI | ||||
LEHEEQDESR | HCSTGSGSAS | FAHTAPPPAG | VNPDLEEPPL | KEEDEVPDDE | ||||
TVNQMIARHE | EEFDLFMRMD | LDRRREEARN | PKRKPRLMEE | DELPSWIIKD | ||||
DAEVERLTCE | EEEEKMFGRG | SRHRKEVDYS | DSLTEKQWLK | AIEEGTLEEI | ||||
EEEVRQKKSS | RKRKRDSDAG | SSTPTTSTRS | RDKDDESKKQ | KKRGRPPAEK | ||||
LSPNPPNLTK | KMKKIVDAVI | KYKDSSSGRQ | LSEVFIQLPS | RKELPEYYEL | ||||
IRKPVDFKKI | KERIRNHKYR | SLNDLEKDVM | LLCQNAQTFN | LEGSLIYEDS | ||||
IVLQSVFTSV | RQKIEKEDDS | EGEESEEEEE | GEEEGSESES | RSVKVKIKLG | ||||
RKEKAQDRLK | GGRRRPSRGS | RAKPVVSDDD | SEEEQEEDRS | GSGSEED |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, активаторів, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, нейрогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.
Література
- Khavari P.A., Peterson C.L., Tamkun J.W., Mendel D.B., Crabtree G.R. (1993). BRG1 contains a conserved domain of the SWI2/SNF2 family necessary for normal mitotic growth and transcription.. Nature 366: 170 — 174. PubMed DOI:10.1038/366170a0
- Chiba H., Muramatsu M., Nomoto A., Kato H. (1994). Two human homologues of Saccharomyces cerevisiae SWI2/SNF2 and Drosophila brahma are transcriptional coactivators cooperating with the estrogen receptor and the retinoic acid receptor.. Nucleic Acids Res. 22: 1815 — 1820. PubMed DOI:10.1093/nar/22.10.1815
- Fryer C.J., Archer T.K. (1998). Chromatin remodelling by the glucocorticoid receptor requires the BRG1 complex.. Nature 393: 88 — 91. PubMed DOI:10.1038/30032
- Park J., Wood M.A., Cole M.D. (2002). BAF53 forms distinct nuclear complexes and functions as a critical c-Myc-interacting nuclear cofactor for oncogenic transformation.. Mol. Cell. Biol. 22: 1307 — 1316. PubMed DOI:10.1128/MCB.22.5.1307-1316.2002
- Hsiao P.W., Fryer C.J., Trotter K.W., Wang W., Archer T.K. (2003). BAF60a mediates critical interactions between nuclear receptors and the BRG1 chromatin-remodeling complex for transactivation.. Mol. Cell. Biol. 23: 6210 — 6220. PubMed DOI:10.1128/MCB.23.17.6210-6220.2003
- Liu K., Luo Y., Lin F.-T., Lin W.-C. (2004). TopBP1 recruits Brg1/Brm to repress E2F1-induced apoptosis, a novel pRb-independent and E2F1-specific control for cell survival.. Genes Dev. 18: 673 — 686. PubMed DOI:10.1101/gad.1180204
Примітки
- Захворювання, генетично пов'язані з SMARCA4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- Human PubMed Reference:.
- Mouse PubMed Reference:.
- HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11100 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
- UniProt, P51532 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.