SYT5

SYT5
Ідентифікатори
Символи	SYT5, synaptotagmin 5
Зовнішні ІД	OMIM: 600782 MGI: 1926368 HomoloGene: 55722 GeneCards: SYT5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• clathrin binding; • зв'язування з іоном металу; • protein heterodimerization activity; • calcium-dependent phospholipid binding; • syntaxin binding; • SNARE binding; • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding; • phosphatidylserine binding; • calcium ion binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • Ендосома; • мембрана; • Синапс; • synaptic vesicle membrane; • Міжклітинні контакти; • neuronal cell body; • recycling endosome membrane; • perinuclear region of cytoplasm; • neuron projection; • dense core granule; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • клітинна мембрана; • proximal neuron projection; • integral component of neuronal dense core vesicle membrane; • Аксон; • exocytic vesicle;
Біологічний процес	• synaptic vesicle endocytosis; • chemical synaptic transmission; • vesicle fusion; • regulation of calcium ion-dependent exocytosis; • calcium ion-regulated exocytosis of neurotransmitter; • regulation of dopamine secretion; • synaptic vesicle exocytosis; • vesicle-mediated transport; • calcium-ion regulated exocytosis; • cellular response to calcium ion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	6861
	53420
	ENSG00000129990
	ENSMUSG00000004961
	O00445
	Q9R0N5
	NM_001297774; NM_003180
	NM_016908; NM_001360421; NM_001360422
	NP_001284703; NP_003171
	NP_001347350; NP_001347351
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SYT5 (англ. Synaptotagmin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 386 амінокислот, а молекулярна маса — 42 900[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFPEPPTPGP	PSPDTPPDSS	RISHGPVPPW	ALATIVLVSG	LLIFSCCFCL
YRKSCRRRTG	KKSQAQAQVH	LQEVKGLGQS	YIDKVQPEVE	ELEPAPSGPG
QQVADKHELG	RLQYSLDYDF	QSGQLLVGIL	QAMGLAALDL	GGSSDPYVRV
YLLPDKRRRY	ETKVHRQTLN	PHFGETFAFK	VPYVELGGRV	LVMAVYDFDR
FSRNDAIGEV	RVPMSSVDLG	RPVQAWRELQ	AAPREEQEKL	GDICFSLRYV
PTAGKLTVIV	LEAKNLKKMD	VGGLSDPYVK	VHLLQGGKKV	RKKKTTIKKN
TLNPYYNEAF	SFEVPCDQVQ	KVQVELTVLD	YDKLGKNEAI	GRVAVGAAAG
GAGLRHWADM	LANPRRPIAQ	WHSLRPPDRV	RLLPAP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах, ендосомах.

Література

Craxton M.A., Olsen A., Goedert M. (1997). Human synaptotagmin V (SYT5): sequence, genomic structure, and chromosomal location.. Genomics 42: 165 — 169. PubMed DOI:10.1006/geno.1997.4722
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Qiu X., Ge J., Gao Y., Teng M., Niu L. (2017). Structural analysis of Ca2+-binding pocket of synaptotagmin 5 C2A domain.. Int. J. Biol. Macromol. 95: 946 — 953. PubMed DOI:10.1016/j.ijbiomac.2016.10.083

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11513 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, O00445 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11513 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O00445 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.