TCF7L2

TCF7L2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2GL7, 1JDH, 1JPW
Ідентифікатори
Символи	TCF7L2, TCF-4, TCF4, transcription factor 7 like 2
Зовнішні ІД	OMIM: 602228 MGI: 1202879 HomoloGene: 7564 GeneCards: TCF7L2
Пов'язані генетичні захворювання
	Цукровий діабет 2-го типу, біполярний афективний розлад, рак молочної залози, ішемічна хвороба серця, Метаболічні захворювання, колоректальний рак[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • beta-catenin binding; • gamma-catenin binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • transcription factor binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948 protein binding; • armadillo repeat domain binding; • protein kinase binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • chromatin binding;
Клітинна компонента	• beta-catenin-TCF7L2 complex; • PML body; • Нуклеоплазма; • protein-DNA complex; • клітинне ядро; • transcription regulator complex;
Біологічний процес	• positive regulation of heparan sulfate proteoglycan biosynthetic process; • positive regulation of protein kinase B signaling; • regulation of transcription, DNA-templated; • glucose homeostasis; • regulation of transcription by RNA polymerase II; • response to glucose; • Wnt signaling pathway; • regulation of smooth muscle cell proliferation; • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity; • canonical Wnt signaling pathway involved in positive regulation of epithelial to mesenchymal transition; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of protein export from nucleus; • maintenance of DNA repeat elements; • blood vessel development; • myoblast fate commitment; • canonical Wnt signaling pathway; • pancreas development; • positive regulation of protein binding; • regulation of hormone metabolic process; • проліферація; • negative regulation of transcription, DNA-templated; • fat cell differentiation; • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; • beta-catenin-TCF complex assembly; • Wnt signaling pathway, calcium modulating pathway; • positive regulation of insulin secretion; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of type B pancreatic cell apoptotic process; • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway; • positive regulation of epithelial cell proliferation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	6934
	21416
	ENSG00000148737
	ENSMUSG00000024985
	Q9NQB0
	Q924A0
NM_001146274; NM_001146283; NM_001146284; NM_001146285; NM_001146286;
	NM_001198525; NM_001198526; NM_001198527; NM_001198528; NM_001198529; NM_001198530; NM_001198531; NM_030756; NM_001349870; NM_001349871; NM_001363501; NM_001367943
NM_001142918; NM_001142919; NM_001142920; NM_001142921; NM_001142922;
	NM_001142923; NM_001142924; NM_009333; NM_001331135; NM_001331136; NM_001331137; NM_001331138; NM_001331139; NM_001331140; NM_001331141; NM_001331142; NM_001331143; NM_001331144; NM_001331145; NM_001331146; NM_001331147; NM_001331148; NM_001331149; NM_001331150
NP_001139746; NP_001139755; NP_001139756; NP_001139757; NP_001139758;
	NP_001185454; NP_001185455; NP_001185456; NP_001185457; NP_001185458; NP_001185459; NP_001185460; NP_110383; NP_001336799; NP_001336800; NP_001350430; NP_001354872; NP_001139757.1
NP_001136390; NP_001136391; NP_001136392; NP_001136393; NP_001136394;
	NP_001136395; NP_001136396; NP_001318064; NP_001318065; NP_001318066; NP_001318067; NP_001318068; NP_001318069; NP_001318070; NP_001318071; NP_001318072; NP_001318073; NP_001318074; NP_001318075; NP_001318076; NP_001318077; NP_001318078; NP_001318079; NP_033359
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TCF7L2 (англ. Transcription factor 7 like 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 619 амінокислот, а молекулярна маса — 67 919[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPQLNGGGGD	DLGANDELIS	FKDEGEQEEK	SSENSSAERD	LADVKSSLVN
ESETNQNSSS	DSEAERRPPP	RSESFRDKSR	ESLEEAAKRQ	DGGLFKGPPY
PGYPFIMIPD	LTSPYLPNGS	LSPTARTLHF	QSGSTHYSAY	KTIEHQIAVQ
YLQMKWPLLD	VQAGSLQSRQ	ALKDARSPSP	AHIVSNKVPV	VQHPHHVHPL
TPLITYSNEH	FTPGNPPPHL	PADVDPKTGI	PRPPHPPDIS	PYYPLSPGTV
GQIPHPLGWL	VPQQGQPVYP	ITTGGFRHPY	PTALTVNASM	SRFPPHMVPP
HHTLHTTGIP	HPAIVTPTVK	QESSQSDVGS	LHSSKHQDSK	KEEEKKKPHI
KKPLNAFMLY	MKEMRAKVVA	ECTLKESAAI	NQILGRRWHA	LSREEQAKYY
ELARKERQLH	MQLYPGWSAR	DNYGKKKKRK	RDKQPGETNE	HSECFLNPCL
SLPPITDLSA	PKKCRARFGL	DQQNNWCGPC	RRKKKCVRYI	QGEGSCLSPP
SSDGSLLDSP	PPSPNLLGSP	PRDAKSQTEQ	TQPLSLSLKP	DPLAHLSMMP
PPPALLLAEA	THKASALCPN	GALDLPPAAL	QPAAPSSSIA	QPSTSSLHSH
SSLAGTQPQP	LSLVTKSLE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Barker N., Huls G., Korinek V., Clevers H. (1999). Restricted high level expression of Tcf-4 protein in intestinal and mammary gland epithelium.. Am. J. Pathol. 154: 29 — 35. PubMed DOI:10.1016/S0002-9440(10)65247-9
Omer C.A., Miller P.J., Diehl R.E., Kral A.M. (1999). Identification of Tcf4 residues involved in high-affinity beta-catenin binding.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 256: 584 — 590. PubMed DOI:10.1006/bbrc.1999.0379
Brantjes H., Roose J., van De Wetering M., Clevers H. (2001). All Tcf HMG box transcription factors interact with Groucho-related co-repressors.. Nucleic Acids Res. 29: 1410 — 1419. PubMed DOI:10.1093/nar/29.7.1410
Yamamoto H., Ihara M., Matsuura Y., Kikuchi A. (2003). Sumoylation is involved in beta-catenin-dependent activation of Tcf-4.. EMBO J. 22: 2047 — 2059. PubMed DOI:10.1093/emboj/cdg204
Hecht A., Stemmler M.P. (2003). Identification of a promoter-specific transcriptional activation domain at the C-terminus of the Wnt effector protein T-cell factor 4.. J. Biol. Chem. 278: 3776 — 3785. PubMed DOI:10.1074/jbc.M210081200

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з TCF7L2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11641 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.
UniProt, Q9NQB0 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з TCF7L2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11641 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q9NQB0 (англ.). Процитовано 8 вересня 2017.