TERF1

TERF1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1BA5, 1ITY, 1IV6, 1W0T, 3BQO, 3L82, 5HKP
Ідентифікатори
Символи	TERF1, PIN2, TRBF1, TRF, TRF1, hTRF1-AS, t-TRF1, telomeric repeat binding factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600951 MGI: 109634 HomoloGene: 7570 GeneCards: TERF1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • double-stranded telomeric DNA binding; • protein homodimerization activity; • telomeric DNA binding; • microtubule binding; • telomerase activity; • ubiquitin binding; • GO:0001948 protein binding; • G-rich strand telomeric DNA binding; • protein heterodimerization activity; • DNA binding, bending; • ankyrin repeat binding; • protein C-terminus binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • nuclear telomere cap complex; • Веретено поділу; • Нуклеоплазма; • хромосома; • Теломера; • Ядерце; • Цитоскелет; • клітинне ядро; • fibrillar center; • Ядерні тільця; • shelterin complex;
Біологічний процес	• telomere maintenance via telomerase; • negative regulation of establishment of RNA localization to telomere; • negative regulation of telomere maintenance via semi-conservative replication; • meiotic telomere clustering; • negative regulation of establishment of protein localization to telomere; • negative regulation of telomerase activity; • negative regulation of DNA replication; • positive regulation of mitotic cell cycle; • mitotic spindle assembly checkpoint signaling; • поділ клітини; • positive regulation of shelterin complex assembly; • G2/M transition of mitotic cell cycle; • positive regulation of apoptotic process; • positive regulation of microtubule polymerization; • negative regulation of establishment of protein-containing complex localization to telomere; • Клітинний цикл; • protein homooligomerization; • positive regulation of mitotic nuclear division; • telomeric loop formation; • telomere capping; • negative regulation of exonuclease activity; • telomeric D-loop disassembly; • t-circle formation; • negative regulation of telomeric D-loop disassembly; • negative regulation of telomere maintenance via telomerase; • negative regulation of telomere maintenance via telomere lengthening; • telomere maintenance; • regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	7013
	21749
	ENSG00000147601
	ENSMUSG00000025925
	P54274
	P70371
	NM_003218; NM_017489
	NM_001286628; NM_009352
	NP_003209; NP_059523
	NP_001273557; NP_033378
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TERF1 (англ. Telomeric repeat binding factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 439 амінокислот, а молекулярна маса — 50 246[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEDVSSAAP	SPRGCADGRD	ADPTEEQMAE	TERNDEEQFE	CQELLECQVQ
VGAPEEEEEE	EEDAGLVAEA	EAVAAGWMLD	FLCLSLCRAF	RDGRSEDFRR
TRNSAEAIIH	GLSSLTACQL	RTIYICQFLT	RIAAGKTLDA	QFENDERITP
LESALMIWGS	IEKEHDKLHE	EIQNLIKIQA	IAVCMENGNF	KEAEEVFERI
FGDPNSHMPF	KSKLLMIISQ	KDTFHSFFQH	FSYNHMMEKI	KSYVNYVLSE
KSSTFLMKAA	AKVVESKRTR	TITSQDKPSG	NDVEMETEAN	LDTRKSVSDK
QSAVTESSEG	TVSLLRSHKN	LFLSKLQHGT	QQQDLNKKER	RVGTPQSTKK
KKESRRATES	RIPVSKSQPV	TPEKHRARKR	QAWLWEEDKN	LRSGVRKYGE
GNWSKILLHY	KFNNRTSVML	KDRWRTMKKL	KLISSDSED

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, хромосомах.

Література

Broccoli D., Smogorzewska A., Chong L., de Lange T. (1997). Human telomeres contain two distinct Myb-related proteins, TRF1 and TRF2.. Nat. Genet. 17: 231 — 235. PubMed DOI:10.1038/ng1097-231
Shen M., Haggblom C., Vogt M., Hunter T., Lu K.P. (1997). Characterization and cell cycle regulation of the related human telomeric proteins Pin2 and TRF1 suggest a role in mitosis.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 13618 — 13623. PubMed DOI:10.1073/pnas.94.25.13618
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Nakamura M., Zhen Zhou X., Kishi S., Ping Lu K. (2002). Involvement of the telomeric protein Pin2/TRF1 in the regulation of the mitotic spindle.. FEBS Lett. 514: 193 — 198. PubMed DOI:10.1016/S0014-5793(02)02363-3
Cook B.D., Dynek J.N., Chang W., Shostak G., Smith S. (2002). Role for the related poly(ADP-Ribose) polymerases tankyrase 1 and 2 at human telomeres.. Mol. Cell. Biol. 22: 332 — 342. PubMed DOI:10.1128/MCB.22.1.332-342.2002
Loayza D., De Lange T. (2003). POT1 as a terminal transducer of TRF1 telomere length control.. Nature 423: 1013 — 1018. PubMed DOI:10.1038/nature01688

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11728 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.
UniProt, P54274 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11728 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P54274 (англ.). Процитовано 7 вересня 2017.