TRPV1

TRPV1
Ідентифікатори
Символи	TRPV1, VR1, transient receptor potential cation channel subfamily V member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602076 MGI: 1341787 HomoloGene: 12920 GeneCards: TRPV1
Реагує на сполуку
	Анандамід, капсаїцин, piperine, 5S-HETE, Камфора, гідрон, capsazepine, 2-aminoethoxydiphenylborate, 5'-iodoresiniferatoxin, Аліцин, NADA[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • ion channel activity; • phosphoprotein binding; • ATP binding; • cation transmembrane transporter activity; • cation channel activity; • ligand-gated ion channel activity; • calcium-release channel activity; • temperature-gated ion channel activity; • identical protein binding; • chloride channel regulator activity; • transmembrane signaling receptor activity; • excitatory extracellular ligand-gated ion channel activity; • calcium channel activity; • extracellular ligand-gated ion channel activity; • phosphatidylinositol binding; • зв'язування з іоном металу; • calmodulin binding; • GO:0001948 protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • postsynaptic membrane; • cell projection; • мембрана; • клітинна мембрана; • Синапс; • Міжклітинні контакти; • dendritic spine membrane; • гіалоплазма; • neuronal cell body; • intrinsic component of plasma membrane; • Дендрит (нейробіологія); • external side of plasma membrane; • neuron projection; • integral component of plasma membrane; • мітохондрія;
Біологічний процес	• ion transport; • chemosensory behavior; • cell surface receptor signaling pathway; • calcium ion transmembrane transport; • thermoception; • calcium ion transport; • inflammatory response; • transmembrane transport; • release of sequestered calcium ion into cytosol; • negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • diet induced thermogenesis; • detection of chemical stimulus involved in sensory perception of pain; • microglial cell activation; • cellular response to growth factor stimulus; • positive regulation of gastric acid secretion; • response to peptide hormone; • cellular response to nerve growth factor stimulus; • positive regulation of nitric oxide biosynthetic process; • negative regulation of establishment of blood-brain barrier; • lipid metabolism; • temperature homeostasis; • response to heat; • cellular response to temperature stimulus; • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; • peptide secretion; • detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain; • sensory perception of mechanical stimulus; • smooth muscle contraction involved in micturition; • behavioral response to pain; • response to pain; • cellular response to alkaloid; • cellular response to cytokine stimulus; • fever generation; • detection of temperature stimulus involved in thermoception; • positive regulation of apoptotic process; • urinary bladder smooth muscle contraction; • glutamate secretion; • sensory perception of pain; • cellular response to tumor necrosis factor; • cellular response to ATP; • ion transmembrane transport; • response to pH; • response to organonitrogen compound; • cellular response to heat; • protein homotetramerization; • excitatory postsynaptic potential; • cellular response to acidic pH; • response to capsazepine; • calcium ion import across plasma membrane; • negative regulation of systemic arterial blood pressure; • negative regulation of heart rate; • negative regulation of mitochondrial membrane potential;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7442
	193034
	ENSG00000196689
	ENSMUSG00000005952
	Q8NER1
	Q704Y3
	NM_018727; NM_080704; NM_080705; NM_080706
	NM_001001445
	NP_061197; NP_542435; NP_542436; NP_542437
	NP_001001445
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TRPV1 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1) – білок, який кодується однойменним геном TRPV1, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 839 амінокислот, а молекулярна маса — 94 956 Da[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKKWSSTDLG	AAADPLQKDT	CPDPLDGDPN	SRPPPAKPQL	STAKSRTRLF
GKGDSEEAFP	VDCPHEEGEL	DSCPTITVSP	VITIQRPGDG	PTGARLLSQD
SVAASTEKTL	RLYDRRSIFE	AVAQNNCQDL	ESLLLFLQKS	KKHLTDNEFK
DPETGKTCLL	KAMLNLHDGQ	NTTIPLLLEI	ARQTDSLKEL	VNASYTDSYY
KGQTALHIAI	ERRNMALVTL	LVENGADVQA	AAHGDFFKKT	KGRPGFYFGE
LPLSLAACTN	QLGIVKFLLQ	NSWQTADISA	RDSVGNTVLH	ALVEVADNTA
DNTKFVTSMY	NEILMLGAKL	HPTLKLEELT	NKKGMTPLAL	AAGTGKIGVL
AYILQREIQE	PECRHLSRKF	TEWAYGPVHS	SLYDLSCIDT	CEKNSVLEVI
AYSSSETPNR	HDMLLVEPLN	RLLQDKWDRF	VKRIFYFNFL	VYCLYMIIFT
MAAYYRPVDG	LPPFKMEKTG	DYFRVTGEIL	SVLGGVYFFF	RGIQYFLQRR
PSMKTLFVDS	YSEMLFFLQS	LFMLATVVLY	FSHLKEYVAS	MVFSLALGWT
NMLYYTRGFQ	QMGIYAVMIE	KMILRDLCRF	MFVYIVFLFG	FSTAVVTLIE
DGKNDSLPSE	STSHRWRGPA	CRPPDSSYNS	LYSTCLELFK	FTIGMGDLEF
TENYDFKAVF	IILLLAYVIL	TYILLLNMLI	ALMGETVNKI	AQESKNIWKL
QRAITILDTE	KSFLKCMRKA	FRSGKLLQVG	YTPDGKDDYR	WCFRVDEVNW
TTWNTNVGII	NEDPGNCEGV	KRTLSFSLRS	SRVSGRHWKN	FALVPLLREA
SARDRQSAQP	EEVYLRQFSG	SLKPEDAEVF	KSPAASGEK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

TRPV1 - це неселективний катіонний канал та належить до іонних каналів, який активується:

протонами,
ванілоїдними сполуками - капсаїцином (CAP),
резініфератоксином (RTX),
ліпідами, що надходять з мембран, включаючи анандамід (Caterina et al., 1997; Caterina and Julius, 2001).

Капсаїцин є найбільш потужним і специфічним відомим агоністом TRPV1.

Функції білка TRPV1

TRPV1 задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою кальмодуліну, іонами металів, іоном кальцію. Цей рецептор також активується підвищенням температури в шкідливому діапазоні, тож можливо, що він функціонує як перетворювач болючих теплових подразників in vivo.[6]

Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.

Експресія гена TRPV1

Цей ген має 10 транскриптів (сплайс варіантів), 197 ортологів та 5 паралогів. [7]

Експресія TRPV1, в ЦНС, має важливе значення для потенційних побічних ефектів агоністів і антагоністів TRPV1, що розробляються для лікування хронічного болю.[8]

Cavanaugh et al. (2011) досліджували експресію TRPV1, використовуючи метод генного націлювання для модифікації генетичного локусу TRPV1. Була продемонстрована стійка експресія TRPV1 у первинних аферентних нейронах та виявлена у підмножині клітин гладких м’язів (SMC) в тканинах, що виконують функцію терморегуляції.

Розлади, що пов'язані з TRPV1

Соматоформний розлад

Соматоформний розлад пов’язаний із тривогою та обсесивно-компульсивним розладом і має такі симптоми, як судоми, задишка та запаморочення. Важливим геном, асоційованим із соматоформним розладом, є TRPV1.[9]

Синдром "палаючого рота"

Синдром печіння рота, також відомий як стоматодинія, пов’язаний з глоситом та хворобою Graft-versus-host disease , і має симптоми, включаючи пероральні прояви. Важливим геном, пов’язаним із синдромом, є TRPV1. [10]

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з TRPV1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12716 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.
UniProt, Q8NER1 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.
TRPV1 Gene - GeneCards | TRPV1 Protein | TRPV1 Antibody. www.genecards.org. Процитовано 23 грудня 2020.
Gene: TRPV1 (ENSG00000196689) - Summary - Homo_sapiens - Ensembl genome browser 102. www.ensembl.org. Процитовано 23 грудня 2020.
Cavanaugh, Daniel J.; Chesler, Alexander T.; Jackson, Alexander C.; Sigal, Yaron M.; Yamanaka, Hiroki; Grant, Rebecca; O'Donnell, Dajan; Nicoll, Roger A. та ін. (30 березня 2011). Trpv1 Reporter Mice Reveal Highly Restricted Brain Distribution and Functional Expression in Arteriolar Smooth Muscle Cells. Journal of Neuroscience (англ.) 31 (13). с. 5067–5077. ISSN 0270-6474. PMID 21451044. doi:10.1523/JNEUROSCI.6451-10.2011. Процитовано 23 грудня 2020.
Somatoform Disorder disease: Malacards - Research Articles, Drugs, Genes, Clinical Trials. www.malacards.org. Процитовано 23 грудня 2020.
Burning Mouth Syndrome disease: Malacards - Research Articles, Drugs, Genes, Clinical Trials. www.malacards.org. Процитовано 23 грудня 2020.

Див. також

Хромосома 17

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з TRPV1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12716 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q8NER1 (англ.). Процитовано 22 серпня 2017.

[6] TRPV1 Gene - GeneCards | TRPV1 Protein | TRPV1 Antibody. www.genecards.org. Процитовано 23 грудня 2020.

[7] Gene: TRPV1 (ENSG00000196689) - Summary - Homo_sapiens - Ensembl genome browser 102. www.ensembl.org. Процитовано 23 грудня 2020.

[8] Cavanaugh, Daniel J.; Chesler, Alexander T.; Jackson, Alexander C.; Sigal, Yaron M.; Yamanaka, Hiroki; Grant, Rebecca; O'Donnell, Dajan; Nicoll, Roger A. та ін. (30 березня 2011). Trpv1 Reporter Mice Reveal Highly Restricted Brain Distribution and Functional Expression in Arteriolar Smooth Muscle Cells. Journal of Neuroscience (англ.) 31 (13). с. 5067–5077. ISSN 0270-6474. PMID 21451044. doi:10.1523/JNEUROSCI.6451-10.2011. Процитовано 23 грудня 2020.

[9] Somatoform Disorder disease: Malacards - Research Articles, Drugs, Genes, Clinical Trials. www.malacards.org. Процитовано 23 грудня 2020.

[10] Burning Mouth Syndrome disease: Malacards - Research Articles, Drugs, Genes, Clinical Trials. www.malacards.org. Процитовано 23 грудня 2020.