TYMS

TYMS
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1YPV, 1JU6, 2RDA, 3EF9, 3ED7, 1HW3, 3EHI, 3GH0, 4JEF, 4O1X, 1HZW, 3EAW, 3OB7, 3EBU, 4KPW, 3EGY, 3EJL, 3N5G, 3N5E, 1HVY, 4GD7, 4G2O, 4H1I, 2ONB, 3H9K, 4GYH, 3HB8, 1I00, 3GG5, 4FGT, 2RD8, 3EDW, 4G6W, 1HW4, 3GH2, 4E28, 1JUJ, 4O1U, 4UP1, 5HS3,%%s1HW3, 1YPV, 4GD7, 2ONB
Ідентифікатори
Символи	TYMS, HST422, TMS, TS, thymidylate synthetase
Зовнішні ІД	OMIM: 188350 MGI: 98878 HomoloGene: 834 GeneCards: TYMS
Реагує на сполуку
	Капецитабін, pemetrexed, raltitrexed[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• methyltransferase activity; • transferase activity; • nucleotide binding; • protein homodimerization activity; • folic acid binding; • thymidylate synthase activity; • mRNA binding; • translation repressor activity, mRNA regulatory element binding; • sequence-specific mRNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • мембрана; • мітохондріальний матрикс; • Ядерце; • мітохондрія; • мітохондріальна внутрішня мембрана; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• response to cytokine; • nucleotide biosynthetic process; • DNA biosynthetic process; • response to organic cyclic compound; • response to progesterone; • tetrahydrofolate interconversion; • Старіння людини; • response to glucocorticoid; • regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle; • dTTP biosynthetic process; • tetrahydrofolate metabolic process; • response to vitamin A; • cartilage development; • Метилювання; • developmental growth; • response to organophosphorus; • Циркадний ритм; • uracil metabolic process; • dTMP biosynthetic process; • intestinal epithelial cell maturation; • dUMP metabolic process; • response to folic acid; • response to ethanol; • response to toxic substance; • pyrimidine nucleobase metabolic process; • regulation of translation; • liver regeneration; • nucleobase-containing small molecule interconversion; • negative regulation of translation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7298
	22171
	ENSG00000176890
	ENSMUSG00000025747
	P04818; Q53Y97
	P07607
	NM_001071; NM_001354867; NM_001354868
	NM_021288
	NP_001062; NP_001341796; NP_001341797; NP_001062.1
	NP_067263
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TYMS (англ. Thymidylate synthetase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 35 716[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPVAGSELPR	RPLPPAAQER	DAEPRPPHGE	LQYLGQIQHI	LRCGVRKDDR
TGTGTLSVFG	MQARYSLRDE	FPLLTTKRVF	WKGVLEELLW	FIKGSTNAKE
LSSKGVKIWD	ANGSRDFLDS	LGFSTREEGD	LGPVYGFQWR	HFGAEYRDME
SDYSGQGVDQ	LQRVIDTIKT	NPDDRRIIMC	AWNPRDLPLM	ALPPCHALCQ
FYVVNSELSC	QLYQRSGDMG	LGVPFNIASY	ALLTYMIAHI	TGLKPGDFIH
TLGDAHIYLN	HIEPLKIQLQ	REPRPFPKLR	ILRKVEKIDD	FKAEDFQIEG
YNPHPTIKME	MAV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504
Anderson D.D., Quintero C.M., Stover P.J. (2011). Identification of a de novo thymidylate biosynthesis pathway in mammalian mitochondria.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 15163 — 15168. PubMed DOI:10.1073/pnas.1103623108
Schiffer C.A., Clifton I.J., Davisson V.J., Santi D.V., Stroud R.M. (1995). Crystal structure of human thymidylate synthase: a structural mechanism for guiding substrates into the active site.. Biochemistry 34: 16279 — 16287. PubMed DOI:10.1021/bi00050a007
Shimizu K., Ayusawa D., Takeishi K., Seno T. (1985). Purification and NH2-terminal amino acid sequence of human thymidylate synthase in an overproducing transformant of mouse FM3A cells.. J. Biochem. 97: 845 — 850. PubMed
Davisson V.J., Sirawaraporn W., Santi D.V. (1989). Expression of human thymidylate synthase in Escherichia coli.. J. Biol. Chem. 264: 9145 — 9148. PubMed

Примітки

Сполуки, які фізично взаємодіють з TYMS переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12441 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P04818 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 18

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з TYMS переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12441 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P04818 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.