ARFGEF2

ARFGEF2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3L8N, 3SWV
Ідентифікатори
Символи	ARFGEF2, BIG2, PVNH2, dJ1164I10.1, ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 605371 MGI: 2139354 HomoloGene: 111880 GeneCards: ARFGEF2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• guanyl-nucleotide exchange factor activity; • GABA receptor binding; • myosin binding; • GO:0001948 protein binding; • protein kinase A regulatory subunit binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • recycling endosome; • гіалоплазма; • Ендосома; • комплекс Ґольджі; • cell projection; • мембрана; • Golgi membrane; • dendritic spine; • Синапс; • Центр організації мікротрубочок; • Міжклітинні контакти; • trans-Golgi network; • Дендрит (нейробіологія); • symmetric synapse; • asymmetric synapse; • perinuclear region of cytoplasm; • Цитоскелет; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • axonemal microtubule;
Біологічний процес	• endomembrane system organization; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • regulation of ARF protein signal transduction; • endosome organization; • receptor recycling; • positive regulation of tumor necrosis factor production; • protein transport; • Golgi to plasma membrane transport; • Екзоцитоз; • транспорт; • regulation of molecular function; • vesicle-mediated transport;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	10564
	99371
	ENSG00000124198
	ENSMUSG00000074582
	Q9Y6D5
	A2A5R2
	NM_006420
	NM_001085495
	NP_006411
	NP_001078964
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ARFGEF2 (англ. ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 785 амінокислот, а молекулярна маса — 202 038[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQESQTKSMF	VSRALEKILA	DKEVKRPQHS	QLRRACQVAL	DEIKAEIEKQ
RLGTAAPPKA	NFIEADKYFL	PFELACQSKS	PRVVSTSLDC	LQKLIAYGHI
TGNAPDSGAP	GKRLIDRIVE	TICSCFQGPQ	TDEGVQLQII	KALLTAVTSP
HIEIHEGTIL	QTVRTCYNIY	LASKNLINQT	TAKATLTQML	NVIFTRMENQ
VLQEARELEK	PIQSKPQSPV	IQAAAVSPKF	VRLKHSQAQS	KPTTPEKTDL
TNGEHARSDS	GKVSTENGDA	PRERGSSLSG	TDDGAQEVVK	DILEDVVTSA
IKEAAEKHGL	TEPERVLGEL	ECQECAIPPG	VDENSQTNGI	ADDRQSLSSA
DNLESDAQGH	QVAARFSHVL	QKDAFLVFRS	LCKLSMKPLG	EGPPDPKSHE
LRSKVVSLQL	LLSVLQNAGP	VFRTHEMFIN	AIKQYLCVAL	SKNGVSSVPD
VFELSLAIFL	TLLSNFKMHL	KMQIEVFFKE	IFLNILETST	SSFEHRWMVI
QTLTRICADA	QCVVDIYVNY	DCDLNAANIF	ERLVNDLSKI	AQGRSGHELG
MTPLQELSLR	KKGLECLVSI	LKCMVEWSKD	LYVNPNHQTS	LGQERLTDQE
IGDGKGLDMA	RRCSVTSMES	TVSSGTQTTV	QDDPEQFEVI	KQQKEIIEHG
IELFNKKPKR	GIQFLQEQGM	LGTSVEDIAQ	FLHQEERLDS	TQVGDFLGDS
ARFNKEVMYA	YVDQLDFCEK	EFVSALRTFL	EGFRLPGEAQ	KIDRLMEKFA
ARYIECNQGQ	TLFASADTAY	VLAYSIIMLT	TDLHSPQVKN	KMTKEQYIKM
NRGINDSKDL	PEEYLSSIYE	EIEGKKIAMK	ETKELTIATK	STKQNVASEK
QRRLLYNLEM	EQMAKTAKAL	MEAVSHAKAP	FTSATHLDHV	RPMFKLVWTP
LLAAYSIGLQ	NCDDTEVASL	CLEGIRCAIR	IACIFGMQLE	RDAYVQALAR
FSLLTASSSI	TEMKQKNIDT	IKTLITVAHT	DGNYLGNSWH	EILKCISQLE
LAQLIGTGVK	TRYLSGSGRE	REGSLKGHTL	AGEEFMGLGL	GNLVSGGVDK
RQMASFQESV	GETSSQSVVV	AVDRIFTGST	RLDGNAIVDF	VRWLCAVSMD
ELASPHHPRM	FSLQKIVEIS	YYNMNRIRLQ	WSRIWHVIGD	HFNKVGCNPN
EDVAIFAVDS	LRQLSMKFLE	KGELANFRFQ	KDFLRPFEHI	MKKNRSPTIR
DMAIRCIAQM	VNSQAANIRS	GWKNIFAVFH	QAASDHDGNI	VELAFQTTCH
IVTTIFQHHF	PAAIDSFQDA	VKCLSEFACN	AAFPDTSMEA	IRLIRFCGKY
VSERPRVLQE	YTSDDMNVAP	GDRVWVRGWF	PILFELSCII	NRCKLDVRTR
GLTVMFEIMK	SYGHTFEKHW	WQDLFRIVFR	IFDNMKLPEQ	LSEKSEWMTT
TCNHALYAIC	DVFTQFYEAL	NEVLLSDVFA	QLQWCVKQDN	EQLARSGTNC
LENLVISNGE	KFSPEVWDET	CNCMLDIFKT	TIPHVLLTWR	PVGMEEDSSE
KHLDVDLDRQ	SLSSIDKNPS	ERGQSQLSNP	TDDSWKGRPY	ANQKLFASLL
IKCVVQLELI	QTIDNIVFYP	ATSKKEDAEH	MVAAQQDTLD	ADIHIETEDQ
GMYKYMSSQH	LFKLLDCLQE	SHSFSKAFNS	NYEQRTVLWR	AGFKGKSKPN
LLKQETSSLA	CCLRILFRMY	VDENRRDSWE	EIQQRLLTVC	SEALAYFITV
NSESHREAWT	SLLLLLLTKT	LKINDEKFKA	HASMYYPYLC	EIMQFDLIPE
LRAVLRKFFL	RIGVVYKIWI	PEEPSQVPAA	LSPVW

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, синапсах, ендосомах.

Література

Togawa A., Morinaga N., Ogasawara M., Moss J., Vaughan M. (1999). Purification and cloning of a brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein for ADP-ribosylation factors.. J. Biol. Chem. 274: 12308 — 12315. PubMed DOI:10.1074/jbc.274.18.12308
Shinotsuka C., Waguri S., Wakasugi M., Uchiyama Y., Nakayama K. (2002). Dominant-negative mutant of BIG2, an ARF-guanine nucleotide exchange factor, specifically affects membrane trafficking from the trans-Golgi network through inhibiting membrane association of AP-1 and GGA coat proteins.. Biochem. Biophys. Res. Commun. 294: 254 — 260. PubMed DOI:10.1016/S0006-291X(02)00456-4
Li H., Adamik R., Pacheco-Rodriguez G., Moss J., Vaughan M. (2003). Protein kinase A-anchoring (AKAP) domains in brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2 (BIG2).. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 1627 — 1632. PubMed DOI:10.1073/pnas.0337678100
Shin H.W., Morinaga N., Noda M., Nakayama K. (2004). BIG2, a guanine nucleotide exchange factor for ADP-ribosylation factors: its localization to recycling endosomes and implication in the endosome integrity.. Mol. Biol. Cell 15: 5283 — 5294. PubMed DOI:10.1091/mbc.E04-05-0388
Ishizaki R., Shin H.W., Iguchi-Ariga S.M., Ariga H., Nakayama K. (2006). AMY-1 (associate of Myc-1) localization to the trans-Golgi network through interacting with BIG2, a guanine-nucleotide exchange factor for ADP-ribosylation factors.. Genes Cells 11: 949 — 959. PubMed DOI:10.1111/j.1365-2443.2006.00991.x
Kuroda F., Moss J., Vaughan M. (2007). Regulation of brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1 (BIG1) and BIG2 activity via PKA and protein phosphatase 1gamma.. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104: 3201 — 3206. PubMed DOI:10.1073/pnas.0611696104

Примітки

Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15853 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, Q9Y6D5 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15853 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9Y6D5 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.