GRIA1

GRIA1
Ідентифікатори
Символи	GRIA1, GLUH1, GLUR1, GLURA, GluA1, HBGR1, glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1, Glutamate receptor, ionotropic, AMPA 1
Зовнішні ІД	OMIM: 138248 MGI: 95808 HomoloGene: 20226 GeneCards: GRIA1
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння[1]
Реагує на сполуку
	AMPA, Анірацетам, cx516, CX546, Циклотіазид, IDRA-21, пірацетам, S-18986, GYKI 53655, GYKI-52,466, NBQX, Тезампанел, Аргіотоксин 636, Токсин Джоро[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• glutamate receptor activity; • PDZ domain binding; • AMPA glutamate receptor activity; • ion channel activity; • GO:0001948 protein binding; • ionotropic glutamate receptor activity; • extracellularly glutamate-gated ion channel activity; • excitatory extracellular ligand-gated ion channel activity; • neurotransmitter receptor activity involved in regulation of postsynaptic cytosolic calcium ion concentration; • transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential; • amyloid-beta binding; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • recycling endosome; • endocytic vesicle membrane; • postsynaptic membrane; • cell projection; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • Синаптичні бульбашки; • GO:0097483, GO:0097481 Постсинаптичне ущільнення; • axonal spine; • клітинна мембрана; • dendritic spine; • Синапс; • dendrite membrane; • cell surface; • Міжклітинні контакти; • neuronal cell body; • Дендрит (нейробіологія); • Ендоплазматичний ретикулум; • dendritic spine membrane; • neuron spine; • ER to Golgi transport vesicle membrane; • neuron projection; • AMPA glutamate receptor complex; • ionotropic glutamate receptor complex; • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane; • Golgi membrane; • postsynapse; • postsynaptic density membrane; • Ендосома; • early endosome membrane; • somatodendritic compartment; • recycling endosome membrane; • synaptic membrane; • glutamatergic synapse; • integral component of postsynaptic density membrane;
Біологічний процес	• receptor internalization; • ion transport; • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; • ion transmembrane transport; • COPII vesicle coating; • Довготривала пам'ять; • транспорт; • long-term synaptic depression; • Сигнальна трансдукція; • chemical synaptic transmission; • ionotropic glutamate receptor signaling pathway; • excitatory postsynaptic potential; • regulation of postsynaptic membrane potential; • regulation of postsynaptic cytosolic calcium ion concentration; • chemical synaptic transmission, postsynaptic; • regulation of NMDA receptor activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	2890
	14799
	ENSG00000155511
	ENSMUSG00000020524
	P42261
	P23818
NM_000827; NM_001114183; NM_001258019; NM_001258020; NM_001258021;
	NM_001258022; NM_001258023; NM_001364165; NM_001364166; NM_001364167
	NM_001113325; NM_001252403; NM_008165
NP_000818; NP_001107655; NP_001244948; NP_001244949; NP_001244950;
	NP_001244951; NP_001244952; NP_001351094; NP_001351095; NP_001351096
	NP_001106796; NP_001239332; NP_032191
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GRIA1 (англ. Glutamate ionotropic receptor AMPA type subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 906 амінокислот, а молекулярна маса — 101 506[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQHIFAFFCT	GFLGAVVGAN	FPNNIQIGGL	FPNQQSQEHA	AFRFALSQLT
EPPKLLPQID	IVNISDSFEM	TYRFCSQFSK	GVYAIFGFYE	RRTVNMLTSF
CGALHVCFIT	PSFPVDTSNQ	FVLQLRPELQ	DALISIIDHY	KWQKFVYIYD
ADRGLSVLQK	VLDTAAEKNW	QVTAVNILTT	TEEGYRMLFQ	DLEKKKERLV
VVDCESERLN	AILGQIIKLE	KNGIGYHYIL	ANLGFMDIDL	NKFKESGANV
TGFQLVNYTD	TIPAKIMQQW	KNSDARDHTR	VDWKRPKYTS	ALTYDGVKVM
AEAFQSLRRQ	RIDISRRGNA	GDCLANPAVP	WGQGIDIQRA	LQQVRFEGLT
GNVQFNEKGR	RTNYTLHVIE	MKHDGIRKIG	YWNEDDKFVP	AATDAQAGGD
NSSVQNRTYI	VTTILEDPYV	MLKKNANQFE	GNDRYEGYCV	ELAAEIAKHV
GYSYRLEIVS	DGKYGARDPD	TKAWNGMVGE	LVYGRADVAV	APLTITLVRE
EVIDFSKPFM	SLGISIMIKK	PQKSKPGVFS	FLDPLAYEIW	MCIVFAYIGV
SVVLFLVSRF	SPYEWHSEEF	EEGRDQTTSD	QSNEFGIFNS	LWFSLGAFMQ
QGCDISPRSL	SGRIVGGVWW	FFTLIIISSY	TANLAAFLTV	ERMVSPIESA
EDLAKQTEIA	YGTLEAGSTK	EFFRRSKIAV	FEKMWTYMKS	AEPSVFVRTT
EEGMIRVRKS	KGKYAYLLES	TMNEYIEQRK	PCDTMKVGGN	LDSKGYGIAT
PKGSALRNPV	NLAVLKLNEQ	GLLDKLKNKW	WYDKGECGSG	GGDSKDKTSA
LSLSNVAGVF	YILIGGLGLA	MLVALIEFCY	KSRSESKRMK	GFCLIPQQSI
NEAIRTSTLP	RNSGAGASSG	GSGENGRVVS	HDFPKSMQSI	PCMSHSSGMP
LGATGL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, ендоплазматичному ретикулумі, клітинних відростках, синапсах.

Література

Potier M.-C., Spillantini M.G., Carter N.P. (1992). The human glutamate receptor cDNA GluR1: cloning, sequencing, expression and localization to chromosome 5.. DNA Seq. 2: 211 — 218. PubMed DOI:10.3109/10425179209020805
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).. Genome Res. 14: 2121 — 2127. 2004. PubMed DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з GRIA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Сполуки, які фізично взаємодіють з GRIA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4571 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.
UniProt, P42261 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 5

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з GRIA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з GRIA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4571 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.

[UniProt-6] UniProt, P42261 (англ.). Процитовано 31 серпня 2017.