GRIK1

GRIK1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2ZNS, 2ZNT, 2ZNU, 3FUZ, 3FV1, 3FV2, 3FVG, 3FVK, 3FVN, 3FVO, 4MF3
Ідентифікатори
Символи	GRIK1, EAA3, EEA3, GLR5, GLUR5, GluK1, gluR-5, glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1
Зовнішні ІД	OMIM: 138245 MGI: 95814 HomoloGene: 68992 GeneCards: GRIK1
Пов'язані генетичні захворювання
	періодонтит, hepatocellular carcinoma, рак молочної залози[1]
Реагує на сполуку
	Iodo-Willardiine, ACET (речовина), UBP310[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція	• ion channel activity; • kainate selective glutamate receptor activity; • extracellularly glutamate-gated ion channel activity; • ionotropic glutamate receptor activity; • ligand-gated ion channel activity; • signaling receptor activity; • glutamate receptor activity; • transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • Міжклітинні контакти; • клітинна мембрана; • postsynaptic membrane; • integral component of plasma membrane; • Синапс; • мембрана; • kainate selective glutamate receptor complex; • presynaptic membrane;
Біологічний процес	• glutamate receptor signaling pathway; • central nervous system development; • ion transmembrane transport; • regulation of synaptic transmission, glutamatergic; • ion transport; • нейробіологія розвитку; • chemical synaptic transmission; • ionotropic glutamate receptor signaling pathway; • excitatory postsynaptic potential; • synaptic transmission, glutamatergic; • modulation of chemical synaptic transmission; • regulation of postsynaptic membrane potential;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	2897
	14805
	ENSG00000171189
	ENSMUSG00000022935
	P39086
	Q60934
NM_000830; NM_175611; NM_001320616; NM_001320618; NM_001320621;
	NM_001320630; NM_001330993; NM_001330994; NM_001393424; NM_001393425; NM_001393426
	NM_010348; NM_146072; NM_001346964
NP_000821; NP_001307545; NP_001307547; NP_001307550; NP_001307559;
	NP_001317922; NP_001317923; NP_783300
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GRIK1 (англ. Glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 918 амінокислот, а молекулярна маса — 103 981[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEHGTLLAQP	GLWTRDTSWA	LLYFLCYILP	QTAPQVLRIG	GIFETVENEP
VNVEELAFKF	AVTSINRNRT	LMPNTTLTYD	IQRINLFDSF	EASRRACDQL
ALGVAALFGP	SHSSSVSAVQ	SICNALEVPH	IQTRWKHPSV	DNKDLFYINL
YPDYAAISRA	ILDLVLYYNW	KTVTVVYEDS	TGLIRLQELI	KAPSRYNIKI
KIRQLPSGNK	DAKPLLKEMK	KGKEFYVIFD	CSHETAAEIL	KQILFMGMMT
EYYHYFFTTL	DLFALDLELY	RYSGVNMTGF	RLLNIDNPHV	SSIIEKWSME
RLQAPPRPET	GLLDGMMTTE	AALMYDAVYM	VAIASHRASQ	LTVSSLQCHR
HKPWRLGPRF	MNLIKEARWD	GLTGHITFNK	TNGLRKDFDL	DIISLKEEGT
EKAAGEVSKH	LYKVWKKIGI	WNSNSGLNMT	DSNKDKSSNI	TDSLANRTLI
VTTILEEPYV	MYRKSDKPLY	GNDRFEGYCL	DLLKELSNIL	GFIYDVKLVP
DGKYGAQNDK	GEWNGMVKEL	IDHRADLAVA	PLTITYVREK	VIDFSKPFMT
LGISILYRKP	NGTNPGVFSF	LNPLSPDIWM	YVLLACLGVS	CVLFVIARFT
PYEWYNPHPC	NPDSDVVENN	FTLLNSFWFG	VGALMQQGSE	LMPKALSTRI
VGGIWWFFTL	IIISSYTANL	AAFLTVERME	SPIDSADDLA	KQTKIEYGAV
RDGSTMTFFK	KSKISTYEKM	WAFMSSRQQT	ALVRNSDEGI	QRVLTTDYAL
LMESTSIEYV	TQRNCNLTQI	GGLIDSKGYG	VGTPIGSPYR	DKITIAILQL
QEEGKLHMMK	EKWWRGNGCP	EEDNKEASAL	GVENIGGIFI	VLAAGLVLSV
FVAIGEFIYK	SRKNNDIEQA	FCFFYGLQCK	QTHPTNSTSG	TTLSTDLECG
KLIREERGIR	KQSSVHTV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Gregor P., O'Hara B.F., Yang X., Uhl G.R. (1993). Expression and novel subunit isoforms of glutamate receptor genes GluR5 and GluR6.. NeuroReport 4: 1343 — 1346. PubMed
Nutt S.L., Kamboj R.K. (1994). RNA editing of human kainate receptor subunits.. NeuroReport 5: 2625 — 2629. PubMed

Примітки

Захворювання, генетично пов'язані з GRIK1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Сполуки, які фізично взаємодіють з Glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
Human PubMed Reference:.
Mouse PubMed Reference:.
HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4579 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.
UniProt, P39086 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 21

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з GRIK1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4579 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-6] UniProt, P39086 (англ.). Процитовано 12 вересня 2017.